| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,299,742 | C→A | 60.4% | A244A (GCC→GCA) | oppD → | oligopeptide transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,299,742 | 0 | C | A | 60.4% | 98.0 / inf | 288 | A244A (GCC→GCA) | oppD | oligopeptide transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/55); new base A (94/80); total (153/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CCAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCT > CP009273/1299593‑1299888 | ccAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGcc < 2:3158063/150‑1 (MQ=255) caacaaCTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCg < 2:3693495/150‑1 (MQ=255) aacTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGgcg < 1:2945817/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCa > 1:3762784/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACg > 2:613090/1‑150 (MQ=255) tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCATGATgg > 1:2178583/1‑150 (MQ=255) tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATgg > 1:1729930/1‑150 (MQ=255) tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATgg > 1:1974186/1‑150 (MQ=255) ggACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGa > 2:4576871/1‑150 (MQ=255) aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:2807469/150‑1 (MQ=255) aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:4543291/150‑1 (MQ=255) aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:3656857/150‑1 (MQ=255) gTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAatat > 1:769408/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAatat > 1:1793898/1‑150 (MQ=255) cACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATgg < 1:3032951/150‑1 (MQ=255) aCCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGc < 1:4179607/150‑1 (MQ=255) ccGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCa < 1:3883257/150‑1 (MQ=255) aCAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAAcgc < 1:4596890/150‑1 (MQ=255) aGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAAcgcgc > 1:4627784/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCCCGATGGAATATGGCAAcgcgcg > 2:2042826/1‑150 (MQ=255) aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 2:743649/1‑150 (MQ=255) aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 2:2332137/1‑150 (MQ=255) aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 1:571293/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:2699316/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1052852/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1839104/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1550486/1‑150 (MQ=255) aTGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCttt > 1:1827706/1‑150 (MQ=255) aTGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCttt < 2:1651958/150‑1 (MQ=255) gACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTa < 1:1088920/150‑1 (MQ=255) tcGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGTATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt < 1:1027539/149‑1 (MQ=255) aCGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt > 1:2581602/1‑150 (MQ=255) aCGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt < 1:441047/150‑1 (MQ=255) cGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATc < 1:159327/150‑1 (MQ=255) cGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATc < 2:2964907/150‑1 (MQ=255) gCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCa > 1:1660923/1‑150 (MQ=255) tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGAGGTCTTTTATCAAc > 2:3892798/1‑150 (MQ=255) tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 2:359260/1‑150 (MQ=255) tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 1:1062241/1‑150 (MQ=255) tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 2:4032595/1‑150 (MQ=255) aTTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAcc > 1:2502942/1‑150 (MQ=255) aaaTGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGt > 1:253864/1‑150 (MQ=255) gAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCAt < 1:933816/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCtt < 2:162832/150‑1 (MQ=255) cGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCt > 1:1754731/1‑150 (MQ=255) gAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATc > 2:2395150/1‑150 (MQ=255) gAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATc < 1:2385451/150‑1 (MQ=255) tactACCGCCTTCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGTTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGTATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCATCACGTTCTTCCTTTTTCTTTCGGttt < 2:2292115/147‑1 (MQ=255) tAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGttt < 1:885781/150‑1 (MQ=255) aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg > 1:4535143/1‑150 (MQ=255) aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg < 1:3630021/150‑1 (MQ=255) aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAAAGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg > 1:1324592/1‑150 (MQ=255) aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATATGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg < 2:3363723/150‑1 (MQ=255) aTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGc > 2:1779835/1‑150 (MQ=255) aCCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTc > 2:2812731/1‑150 (MQ=255) aCCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTc > 1:4027027/1‑150 (MQ=255) gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc > 2:3320652/1‑150 (MQ=255) gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc > 2:1183562/1‑150 (MQ=255) gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc < 1:3412733/150‑1 (MQ=255) atcatTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAcgcg < 2:3979026/150‑1 (MQ=255) atTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTg < 2:835488/150‑1 (MQ=255) atTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTg > 1:2914884/1‑150 (MQ=255) tttGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGcc < 1:712832/148‑1 (MQ=255) tATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGcc > 1:3613212/1‑150 (MQ=255) aTGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcg > 1:34729/1‑150 (MQ=255) gATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcgcg > 2:1917289/1‑150 (MQ=255) gATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcgcg < 2:2236927/150‑1 (MQ=255) aTCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGt > 1:2681928/1‑150 (MQ=255) aTCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGt < 2:2443937/150‑1 (MQ=255) cACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtct < 2:682563/150‑1 (MQ=255) aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGACTATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc > 1:4094533/1‑150 (MQ=255) aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc > 1:2972895/1‑150 (MQ=255) aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc < 2:4384000/150‑1 (MQ=255) cccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCg < 2:254068/150‑1 (MQ=255) ccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGa > 1:2294808/1‑150 (MQ=255) ccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGa > 2:4184789/1‑150 (MQ=255) cACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGAt < 1:2800943/150‑1 (MQ=255) cACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGAt < 2:3862073/150‑1 (MQ=255) cACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGAt < 2:1107485/150‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGa < 2:412802/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCTCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACACGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAg < 1:3522237/150‑1 (MQ=255) tGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAgg > 2:4375621/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGt > 2:4087934/1‑150 (MQ=255) tCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTTCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGTCTATGGCAAATCGCGCGATGTCTTTTATCAAACCGTTCATCCTTCGTCTATCGGTTTGCTCATCGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTg < 2:1486038/150‑1 (MQ=255) tCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTg < 2:5674/150‑1 (MQ=255) gtggCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACa < 1:1957785/150‑1 (MQ=255) gggATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTg < 1:2174963/150‑1 (MQ=255) ggATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGa > 1:3063673/1‑150 (MQ=255) gATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGAc > 1:2052487/1‑150 (MQ=255) cTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCAt > 1:4423481/1‑150 (MQ=255) cGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATccc < 2:4308783/150‑1 (MQ=255) gACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCg > 1:4133658/1‑150 (MQ=255) gACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCg > 2:2372639/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAAt < 1:4620614/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTAGTCTATCGGTTTGCTCATCGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATc < 2:3257498/150‑1 (MQ=255) tGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGc > 2:3205573/1‑150 (MQ=255) tGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGc > 1:1402667/1‑150 (MQ=255) aaTGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCaaa > 2:2890313/1‑150 (MQ=255) aCGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACctgc > 1:3793437/1‑150 (MQ=255) cGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTATATCAACCCGTTCATCCTTATTCTCTCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACctgct > 2:4209830/1‑150 (MQ=255) | CCAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCT > CP009273/1299593‑1299888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |