| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,429,517 | G→T | 14.5% | I120I (ATC→ATA) | uspF ← | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,429,517 | 0 | G | T | 14.5% | 966.6 / 92.9 | 288 | I120I (ATC→ATA) | uspF | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/132); new base T (13/28); total (128/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.09e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CGGATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTG > CP009273/1429368‑1429666 | aTTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGata > 2:4509408/1‑150 (MQ=255) ttAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGatat < 1:3552965/150‑1 (MQ=255) ttAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGatat < 1:1230739/150‑1 (MQ=255) gagGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCg < 1:555066/150‑1 (MQ=255) agGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCgg < 1:1296908/150‑1 (MQ=255) agGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCgg < 2:2895064/150‑1 (MQ=255) aataTGTCAGCACATTTGCGATATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCTGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGAt < 1:2787960/147‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATgg < 1:4126694/150‑1 (MQ=255) gTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGaa < 1:4539947/150‑1 (MQ=255) tCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAg < 1:3110913/150‑1 (MQ=255) tCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAg > 2:3627824/1‑150 (MQ=255) tCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAg < 1:2853276/150‑1 (MQ=255) cAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGc < 1:1592588/150‑1 (MQ=255) acaTTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatg < 2:1605516/150‑1 (MQ=255) acaTTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatg < 1:1351677/150‑1 (MQ=255) tttGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatgatg < 1:1994342/150‑1 (MQ=255) tGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATgatgat < 2:809254/150‑1 (MQ=255) gAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCat > 1:1830505/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCata < 1:1658796/150‑1 (MQ=255) aaaTGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCata > 2:2555986/1‑150 (MQ=255) tGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGa < 1:1098957/150‑1 (MQ=255) gAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAg < 1:2696879/150‑1 (MQ=255) aaaatGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg > 1:1880899/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg > 2:4369678/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGAGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg > 2:1882043/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGa < 1:3234303/150‑1 (MQ=255) aaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGa < 1:938559/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAGCCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAt < 2:1970544/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAt < 2:2627034/150‑1 (MQ=255) aaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtc > 1:701033/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtc > 2:4171788/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtcttc > 1:4392537/1‑150 (MQ=255) gcagcaATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAGCttcttc > 1:1747957/1‑150 (MQ=255) cagcaATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCg < 1:2161469/150‑1 (MQ=255) agcaATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGc > 2:1486137/1‑150 (MQ=255) gcaATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGcc < 1:4046313/150‑1 (MQ=255) aaTGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCaa > 1:3990103/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAAt > 2:3695133/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAAt > 2:3448275/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAAtt < 1:3704348/150‑1 (MQ=255) cGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAg > 1:2676450/1‑150 (MQ=255) ggCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGaa > 1:1475215/1‑150 (MQ=255) cGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATg < 1:1985595/150‑1 (MQ=255) aGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGt > 1:2081702/1‑150 (MQ=255) tgtCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCt > 2:3073998/1‑150 (MQ=255) cgcACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGc > 2:4620249/1‑150 (MQ=255) caACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGc > 1:819221/1‑150 (MQ=255) cACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTc > 2:1624307/1‑150 (MQ=255) cACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGGCTTTGGGCGAGCCTTCCTc > 1:1851754/1‑150 (MQ=255) ctctGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGAc < 2:3717718/150‑1 (MQ=255) ctGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACAt < 2:1747068/150‑1 (MQ=255) tGCGTGACGCTCTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATg < 2:306122/150‑1 (MQ=255) aCGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCActct < 2:4262586/150‑1 (MQ=255) aCGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCActct < 1:4638435/150‑1 (MQ=255) cGCACTACAGCTGCGTCGTTTGAACCGATAAGATAAGTGGTAAAATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCGTCGCCAATTCCAGAATTCGGTATTTGGGAGATCATTCATCAACATGTAAATGAACTCTg > 2:2173249/1‑150 (MQ=255) cGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCAGGTCGATGGGAAGCAATTATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTg < 2:1041069/150‑1 (MQ=255) cACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTc > 1:1705367/1‑150 (MQ=255) cACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTc < 1:4369516/150‑1 (MQ=255) cACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGATATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCACTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTc > 2:388710/1‑150 (MQ=255) tACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGt < 2:2345433/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt < 1:2942050/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt < 1:2283123/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg < 2:2942386/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 1:1221614/1‑150 (MQ=255) gCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGc < 2:527641/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGc < 1:2637230/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 1:3180619/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGTGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAg < 2:742159/150‑1 (MQ=255) cggcgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt < 1:1798420/150‑1 (MQ=255) cggcgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt < 2:1184433/150‑1 (MQ=255) cgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa > 1:3652026/1‑150 (MQ=255) cgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa > 1:2423968/1‑150 (MQ=255) gTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaaa > 1:2248132/1‑150 (MQ=255) ttGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAt < 2:4643743/150‑1 (MQ=255) ggAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttt > 1:4620126/1‑150 (MQ=255) ggAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttt < 2:2048281/150‑1 (MQ=255) aaCCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttttt < 2:2956219/150‑1 (MQ=255) aaCCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACANGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttttt < 1:4282116/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTa < 1:4464952/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTa > 1:3418268/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa > 1:4192240/1‑150 (MQ=255) gAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAAt < 1:3075543/150‑1 (MQ=255) cAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAt > 2:2796613/1‑150 (MQ=255) cAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAt > 2:3795788/1‑150 (MQ=255) cAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAt < 1:913900/150‑1 (MQ=255) aGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc < 1:472318/150‑1 (MQ=255) aGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc > 1:2097217/1‑150 (MQ=255) aGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGATTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc > 2:3723225/1‑150 (MQ=255) gATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtct < 2:4097895/150‑1 (MQ=255) aTAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtctc < 1:2610819/150‑1 (MQ=255) tAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct > 2:2484828/1‑150 (MQ=255) tAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct < 1:1534694/150‑1 (MQ=255) tAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct < 2:3229256/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt < 2:3191630/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGTGCGAGCCTTCCTAAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt > 2:2088473/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt > 2:1722589/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt > 2:874730/1‑150 (MQ=255) gtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTcc > 2:4126504/1‑150 (MQ=255) gtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt < 2:4441215/150‑1 (MQ=255) tgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGtt < 2:3589037/150‑1 (MQ=255) | CGGATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTG > CP009273/1429368‑1429666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |