| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,441,854 | C→A | 56.4% | R27S (CGT→AGT) | feaB → | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,441,854 | 0 | C | A | 56.4% | ‑4.4 / inf | 271 | R27S (CGT→AGT) | feaB | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (64/54); new base A (85/68); total (149/122) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |