Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,454,724 | G→T | 94.0% | G472C (GGT→TGT) | paaH → | 3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,454,724 | 0 | G | T | 94.0% | 1035.0 / 50.9 | 341 | G472C (GGT→TGT) | paaH | 3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/9); new base T (165/155); total (177/164) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCA > CP009273/1454577‑1454870 | tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt < 1:1652190/150‑1 (MQ=255) tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt > 2:2595623/1‑150 (MQ=255) ttATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGa < 1:3480838/150‑1 (MQ=255) aTCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGt < 2:2049429/150‑1 (MQ=255) cATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCAt < 1:3301395/150‑1 (MQ=255) atatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTTGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGAATCACAATGGAGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCTCCAACGGGCGCTTCTGTAGAGATGTTATGATTCATa > 2:3967016/1‑150 (MQ=255) atatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATa > 1:3975822/1‑150 (MQ=255) atatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATa < 2:2983275/150‑1 (MQ=255) atGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGTCTCCTTGAAAATCTACCGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATTAg < 2:555339/150‑1 (MQ=255) tGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAgg < 2:130005/150‑1 (MQ=255) ggCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGc > 1:976789/1‑150 (MQ=255) cccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCt < 1:2467594/150‑1 (MQ=255) ccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTg > 1:3055080/1‑150 (MQ=255) aCTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGc > 1:2045909/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGAGCGCAACTTGCCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAAt < 2:3316933/150‑1 (MQ=255) cTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATg > 2:3702104/1‑150 (MQ=255) cTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATg > 2:4487066/1‑150 (MQ=255) tGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGc > 1:1904215/1‑150 (MQ=255) ggggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGcc < 2:3939203/150‑1 (MQ=255) gggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGccc > 1:3910844/1‑150 (MQ=255) ggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCa < 1:2471407/150‑1 (MQ=255) gAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAt > 2:3148244/1‑150 (MQ=255) gAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAt < 2:1596102/150‑1 (MQ=255) gAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAt > 2:955300/1‑150 (MQ=255) aGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATg > 1:4466853/1‑150 (MQ=255) aaCTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATg > 2:3374373/1‑150 (MQ=255) cTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTa < 2:3768668/150‑1 (MQ=255) ggctggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATga > 2:1201010/1‑150 (MQ=255) ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 1:2286141/150‑1 (MQ=255) ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 1:146758/150‑1 (MQ=255) ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 2:539988/150‑1 (MQ=255) ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 1:1288590/150‑1 (MQ=255) gcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACg > 2:1926365/1‑150 (MQ=255) gCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATg < 1:2396653/150‑1 (MQ=255) gCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATg < 1:1044851/150‑1 (MQ=255) cGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGc > 1:1038589/1‑150 (MQ=255) aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt < 2:3917884/150‑1 (MQ=255) aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt > 1:1824307/1‑150 (MQ=255) tatTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTgc > 1:539746/1‑150 (MQ=255) ttAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTgcgc > 1:3769630/1‑150 (MQ=255) tAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGcc > 2:3524080/1‑150 (MQ=255) tAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGACAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGcc < 1:3597699/150‑1 (MQ=255) ggCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCaaa < 1:2313049/150‑1 (MQ=255) ccTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgcgc > 2:4611927/1‑150 (MQ=255) gAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTgg < 1:3893382/150‑1 (MQ=255) aaaaTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGc > 1:3117133/1‑150 (MQ=255) aaaaTCTACAGCATCACTAGGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGc < 2:3230960/150‑1 (MQ=255) aaTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCAt < 1:824909/150‑1 (MQ=255) aTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATc < 2:3178413/150‑1 (MQ=255) cTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGa < 1:1614435/150‑1 (MQ=255) tACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGAc < 1:2652531/150‑1 (MQ=255) aGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAtt > 2:4192395/1‑150 (MQ=255) aGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAtt < 2:825713/150‑1 (MQ=255) aTCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtc < 1:1963873/150‑1 (MQ=255) aTCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATAGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGATTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCACTTTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTAGGCAACAACATAAtc > 1:4321556/1‑150 (MQ=255) cACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtctc < 1:4640326/150‑1 (MQ=255) cACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtctc > 2:3821525/1‑150 (MQ=255) cACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtctc < 1:2846588/150‑1 (MQ=255) cACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtctc < 1:3632359/150‑1 (MQ=255) tATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAt < 2:1371852/150‑1 (MQ=255) tATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAt > 2:1259392/1‑150 (MQ=255) aTGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCACTGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATg > 2:2096058/1‑150 (MQ=255) aTGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATg > 1:693663/1‑150 (MQ=255) tGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATgg < 2:356796/150‑1 (MQ=255) tGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATgg < 2:1654685/150‑1 (MQ=255) cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg > 2:2125275/1‑150 (MQ=255) aagaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGaa > 2:1114513/1‑150 (MQ=255) gaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAgg > 1:3272628/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCt < 1:2142491/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCt > 2:2954663/1‑150 (MQ=255) tCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTg > 2:2482269/1‑150 (MQ=255) tCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTg < 2:547097/150‑1 (MQ=255) tCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTg > 2:3058363/1‑150 (MQ=255) ccATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGt > 2:3629197/1‑150 (MQ=255) ccATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGt < 1:4618617/150‑1 (MQ=255) tGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAc > 1:4529983/1‑150 (MQ=255) tGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAAGTATGAGAACGATGCCTTCGCCAAAGCGCTTGGCAACGACATTAAATCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAc > 1:2744866/1‑150 (MQ=255) gTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAcc > 2:4383293/1‑150 (MQ=255) gTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAcc > 1:1023725/1‑150 (MQ=255) ttCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCa > 2:2667115/1‑150 (MQ=255) tCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCAt < 2:756774/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCCATCGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAc < 2:3501678/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc < 2:2313631/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCa < 2:468480/150‑1 (MQ=255) gcCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACt < 1:4560710/150‑1 (MQ=255) gcCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACt < 1:3808481/150‑1 (MQ=255) aaCGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGca > 1:605745/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGCTGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGcac > 2:500022/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGcaca < 2:2739365/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAAt < 1:4082252/150‑1 (MQ=255) cgcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATg > 2:666499/1‑150 (MQ=255) cTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCt > 1:1410373/1‑150 (MQ=255) cTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTaa > 1:4016667/1‑150 (MQ=255) tGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAAc > 1:4386938/1‑150 (MQ=255) ggAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGCCCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACg < 1:3374373/150‑1 (MQ=255) ggAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACg < 1:4182137/150‑1 (MQ=255) agagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGt > 2:4076351/1‑150 (MQ=255) gagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGtc > 1:125963/1‑150 (MQ=255) gagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGtc > 1:3715311/1‑150 (MQ=255) agCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGtca > 1:1318014/1‑150 (MQ=255) | GTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCA > CP009273/1454577‑1454870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |