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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,457,811 | 0 | A | T | 17.5% | 790.6 / 152.5 | 301 | T6S (ACT→TCT) | paaX | transcriptional repressor of phenylacetic acid degradation paa operon, phenylacetyl‑CoA inducer |
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Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
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acaGACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATTCTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCtt < 1:1200247/150‑1 (MQ=255) caGACTGAAGCGAATGATTAAACTTGATTCTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCttt > 2:1522511/1‑150 (MQ=255) gACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGc < 2:2755434/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTgg > 1:606941/1‑150 (MQ=255) gAAGCGAATGAGTAAACTTGATTCTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCACATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGa < 2:2512287/150‑1 (MQ=255) caGCGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGaa < 1:1532403/149‑1 (MQ=255) gCGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGAAgg < 1:2573345/150‑1 (MQ=255) cGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGAAggg > 2:1124771/1‑150 (MQ=255) gAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGAAGGGc > 2:3492889/1‑150 (MQ=255) gAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGAAGGGc > 2:1784161/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |