| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,491,823 | C→A | 8.0% | S237R (AGC→AGA) | opgD → | osmoregulated periplasmic glucan (OPG) biosynthesis periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,491,823 | 0 | C | A | 8.0% | 1085.1 / 43.1 | 285 | S237R (AGC→AGA) | opgD | osmoregulated periplasmic glucan (OPG) biosynthesis periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (134/128); new base A (8/15); total (142/143) | |||||||||||
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Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GATACATATCAATACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTGCGGTACTAATGA > CP009273/1491674‑1491972 | gatACATATCAATACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAgc < 2:1806815/150‑1 (MQ=255) atACATATCAATACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAgcg > 2:3487404/1‑150 (MQ=255) aCATATCAATACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGcc > 1:1050937/1‑150 (MQ=255) 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aTACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCGTTAc < 2:4562719/150‑1 (MQ=255) ggTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATGCGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGt > 1:1124015/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGt > 2:1036862/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGt > 1:1143504/1‑150 (MQ=255) tttGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGc < 1:2864336/150‑1 (MQ=255) 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gTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATg < 2:3888464/150‑1 (MQ=255) tATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTc > 2:3241400/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTg < 2:4297554/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCGATAGAGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTg < 2:3298585/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTGc < 2:4247155/150‑1 (MQ=255) 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aGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTGCGGTACTAAt > 1:3271193/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTGCGGTACTAAt > 1:4417902/1‑150 (MQ=255) | GATACATATCAATACGGTTTGTCGGCCCGCGGCCTGGCGATCGACACTTACACCGACAGTAAAGAAGAGTTCCCCGACTTTACCGCCTTCTGGTTTGATACGGTAAAACCGGGGGCAACTACCTTTACCGTTTATGCGTTGCTCGATAGCGCCAGCATTACTGGTGCCTATAAGTTCACTATCCATTGTGAGAAAAGTCAGGTGATTATGGATGTGGAAAATCACCTGTATGCGCGCAAAGACATTAAACAGCTGGGCATTGCGCCGATGACCAGTATGTTCAGCTGCGGTACTAATGA > CP009273/1491674‑1491972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |