Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,593,900 | G→T | 17.9% | N189K (AAC→AAA) | lsrK ← | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,593,900 | 0 | G | T | 17.9% | 1019.5 / 132.8 | 328 | N189K (AAC→AAA) | lsrK | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (159/110); new base T (31/28); total (190/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 | agagTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGt < 2:2317439/150‑1 (MQ=255) gagTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCttt < 2:2247019/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTaga < 2:2712705/150‑1 (MQ=255) cgccgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAggg > 1:3090000/1‑150 (MQ=255) ccgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGAt > 2:3356633/1‑150 (MQ=255) cgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATc > 2:1277932/1‑150 (MQ=255) gcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATcc < 2:446082/150‑1 (MQ=255) cTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATCTCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCa < 2:1956953/150‑1 (MQ=255) tgtgAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCAcc > 2:3964196/1‑150 (MQ=255) cTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGt < 2:276684/150‑1 (MQ=255) ttACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGtt > 1:2303510/1‑150 (MQ=255) ttACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGtt > 1:375421/1‑150 (MQ=255) ccACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgc > 2:4328834/1‑150 (MQ=255) cACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgcc < 2:1029553/150‑1 (MQ=255) aCGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgccg > 2:639383/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgccgc > 2:174678/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgccgc > 2:2421834/1‑150 (MQ=255) ccAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGa > 1:4193548/1‑150 (MQ=255) aGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGc > 1:1008325/1‑150 (MQ=255) tgCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAgg < 2:3499356/150‑1 (MQ=255) tgCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAgg > 1:3781672/1‑150 (MQ=255) gTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagc > 1:3203021/1‑150 (MQ=255) ttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcca < 2:545709/150‑1 (MQ=255) ttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcca > 1:4050913/1‑150 (MQ=255) tCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGccagccag > 1:368759/1‑150 (MQ=255) cTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGt > 2:3114785/1‑150 (MQ=255) tttGACAGGAGAAAGAAGATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTc < 1:1195472/150‑1 (MQ=255) ttGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCg > 2:778692/1‑150 (MQ=255) accggAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCCAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTg > 2:2361469/4‑150 (MQ=255) cAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGa > 2:1575103/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt > 2:1776245/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt > 1:2303776/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt < 2:4227610/150‑1 (MQ=255) ggAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATc < 2:1730123/150‑1 (MQ=255) gaaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATg < 2:4340112/150‑1 (MQ=255) aaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATgg > 2:514373/1‑150 (MQ=255) aagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGt > 1:1413748/1‑150 (MQ=255) agaaTATCGGCACGTAGGCCTGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTg < 1:3827238/150‑1 (MQ=255) agaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTg > 1:185349/1‑150 (MQ=255) agaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTg > 1:434966/1‑150 (MQ=255) aaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGAt < 1:3890653/150‑1 (MQ=255) atatCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATg < 2:2684456/150‑1 (MQ=255) atatCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATg < 2:484650/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGtt < 1:326099/150‑1 (MQ=255) gCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGAt < 1:3981579/150‑1 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg < 1:2523639/150‑1 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg > 2:2961377/1‑150 (MQ=255) cGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGcc < 1:4242710/150‑1 (MQ=255) cGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCAAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGTTTGATGcc < 2:1371104/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCt > 2:4535898/1‑150 (MQ=255) tAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTg > 2:1933242/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGa > 1:1048265/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGa > 2:1107714/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGAc > 1:1987496/1‑150 (MQ=255) agccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTa > 2:3179988/1‑150 (MQ=255) caTCTCCAGCATTGCAGGGTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGGGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGTGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAat < 2:1693292/150‑1 (MQ=255) atatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAata > 1:2171485/1‑150 (MQ=255) tatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAatat < 2:2456734/150‑1 (MQ=255) cAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACg > 1:2218345/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGGCGGTAAATATCGGAACGATg > 1:1353197/1‑150 (MQ=255) gCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATgg > 2:1865530/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt > 1:836710/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt < 1:1277932/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt > 1:2105047/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 2:2619062/150‑1 (MQ=255) tttCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgcgc > 2:806474/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcca < 1:1456399/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcca < 2:3729423/150‑1 (MQ=255) aGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgccagcc < 2:2902356/150‑1 (MQ=255) aGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgccagcc > 1:749614/1‑150 (MQ=255) aCGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAg > 2:4603508/1‑150 (MQ=255) aCGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAg < 1:602338/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGt > 2:425351/1‑150 (MQ=255) gggTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTa > 1:3353338/1‑150 (MQ=255) gggTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTa < 2:830883/150‑1 (MQ=255) gtggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAAt < 1:1762578/150‑1 (MQ=255) gtggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAAt < 1:2373521/150‑1 (MQ=255) tggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATc < 2:4038332/150‑1 (MQ=255) ggtTAGATCAAGAAGTCCCGGGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGACCGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCt > 1:282967/1‑150 (MQ=255) gtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTg > 1:2700896/1‑150 (MQ=255) aGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTgggg > 2:2190615/1‑150 (MQ=255) gATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGa < 2:1791380/150‑1 (MQ=255) aTCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGAt < 1:4150672/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATgg > 2:1908724/1‑150 (MQ=255) agaagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCa > 1:1081587/1‑150 (MQ=255) aagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACt > 2:4079211/1‑150 (MQ=255) aagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACt > 2:4079262/1‑150 (MQ=255) aagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACt < 1:1937951/150‑1 (MQ=255) agTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACtt > 1:1527800/1‑150 (MQ=255) agTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACtt < 2:895373/150‑1 (MQ=255) agTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACtt < 1:3039140/150‑1 (MQ=255) gTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTa < 2:4492155/150‑1 (MQ=255) cccGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTaaa > 2:3413176/1‑150 (MQ=255) cGTGTTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCTCCGCTGTGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATCGTTGATGCCTGACGGTAAATATCTGAACGATGGTGCTCCATCCATAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc < 2:3002086/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc < 2:1314375/150‑1 (MQ=255) tggtgCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCa > 2:211886/1‑150 (MQ=255) ggtgCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAg < 2:3879835/150‑1 (MQ=255) ggtgCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAg > 1:2040561/1‑150 (MQ=255) aGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTg > 1:4630888/1‑150 (MQ=255) cGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTc < 2:2852887/150‑1 (MQ=255) | CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |