Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,618,960 | 0 | A | C | 27.7% | 339.3 / 258.3 | 267 | intergenic (‑206/‑70) | ydeI/ydeJ | hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein/inactive PncC family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (115/78); new base C (38/36); total (153/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTCAAAG > CP009273/1618811‑1619109 | gCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAatt > 2:3118767/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAattatt < 1:494837/150‑1 (MQ=255) tAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATtata < 2:4522164/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |