| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,646,993 | 0 | C | T | 18.5% | 661.3 / 121.5 | 254 | intergenic (+28/+19) | intQ/ydfJ | pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related/pseudogene, MFS transporter family; interrupted by Qin prophage;Phage or Prophage Related; putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (117/89); new base T (32/15); total (149/105) | |||||||||||
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Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
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acGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTc < 1:1168740/150‑1 (MQ=255) cATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTCGcc < 1:1020407/150‑1 (MQ=255) | GGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTCGCC > CP009273/1646845‑1647142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |