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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,798,234 | 0 | G | T | 18.1% | 857.3 / 123.5 | 282 | pseudogene (460/1476 nt) | arpB | pseudogene, ankyrin repeats |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (111/120); new base T (23/28); total (134/148) | |||||||||||
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Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
TGGCAAACAATGTCAGTCATATGTCCGCGATTTTATATATAGACAATCATACTTTGTCAGTAAGGCTACGAATAAAGCAGTCAGTGTATGGACAATTAAATTATGTTGTGTCCGTTTACGACCCGAACGATACCAACGTTGCCGTCAGAGACACCCACAGGACAGCACGGGGCTTTCTTTCGCTTGATAAGTTCATCAGTTCAGGTCCCGATGCTCAGACCTGGGCTGATAGATATGTTCGCAACTGTGCAATTGCTATTCTGCCCCTATTACCTGTGGGAGTTCCAGGGGCTATTTTC > CP009273/1798085‑1798383 | tgGCAAACAATGTCAGTCATATGTCCGCGATTTTATATATAGACAATCATACTTTGTCAGTAAGGCTACGAATAAAGCAGTCAGTGTATGGACAATTAAATTATGTTGTGTCCGTTTACGACCCGAACGATACCAACGTTGCCGTCagag > 2:607159/1‑150 (MQ=255) aaaCAATGTCAGTCATATGTCCGCGATTTTATATATAGACAATCATACTTTGTCAGTAAGGCTACGAATAAAGCAGTCAGTGTATGGACAATTAAATTATGTTGTGTCCGTTTACGACCCGAACGATACCAACGTTGCCGTCAGAGacac > 1:386912/1‑150 (MQ=255) aaaCAATGTCAGTCATATGTCCGCGATTTTATATATAGACAATCATACTTTGTCAGTAAGGCTACGAATAAAGCAGTCAGTGTATGGACAATTAAATTATGTTGTGTCCGTTTACGACCCGAACGATACCAACGTTGCCGTCAGAGacac > 1:2172779/1‑150 (MQ=255) 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gaCACCCACAGGACAGCACGGGGCTTTCTTTCGCTTGATAAGTTCATCAGTTCAGGTCCCGATGCTCAGACCTGGGCTGATAGATATGTTCGCAACTGTGCAATTGCTATTCTGCCCCTATTACCTGTGGGAGTTCCAGGGGCTATTTTc < 1:1851409/150‑1 (MQ=255) gaCACCCACAGGACAGCACGGGGCTTTCTTTCGCTTGATAAGTTCATCAGTTCAGGTCCCGATGCTCAGACCTGGGCTGATAGATATGTTCGCAACTGTGCAATTGCTATTCTGCCCCTATTACCTGTGGGAGTTCCAGGGGCTATTTTc > 2:1784120/1‑150 (MQ=255) | TGGCAAACAATGTCAGTCATATGTCCGCGATTTTATATATAGACAATCATACTTTGTCAGTAAGGCTACGAATAAAGCAGTCAGTGTATGGACAATTAAATTATGTTGTGTCCGTTTACGACCCGAACGATACCAACGTTGCCGTCAGAGACACCCACAGGACAGCACGGGGCTTTCTTTCGCTTGATAAGTTCATCAGTTCAGGTCCCGATGCTCAGACCTGGGCTGATAGATATGTTCGCAACTGTGCAATTGCTATTCTGCCCCTATTACCTGTGGGAGTTCCAGGGGCTATTTTC > CP009273/1798085‑1798383 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |