| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 130,349 | 0 | G | T | 7.9% | 1129.5 / 42.5 | 297 | E750* (GAA→TAA) | acnB | bifunctional aconitate hydratase 2/2‑methylisocitrate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (123/150); new base T (15/9); total (138/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.34e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
AAGATCGACGAAGTGTTTATCGGTTCCTGCATGACCAACATCGGTCACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACAGTTGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTGCAACGGTGGTTTCCACCTCTACCCGTAACTTCCCGAACCGTCTGGGTACT > CP009273/130202‑130498 | aagaTCGACGAAGTGTTTATCGGTTCCTGCATGACCAACATCGGTCACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACAGTTGACCgaa < 2:1419949/150‑1 (MQ=255)aagaTCGACGAAGTGTTTATCGGTTCCTGCATGACCAACATCGGTCACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACAGTTGACCgaa > 2:943404/1‑150 (MQ=255)aagaTCGACGAAGTGTTTATCGGTTCCTGCATGACCAACATCGGTCACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACAGTTGACCgaa > 1:816707/1‑150 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |