| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,813,578 | C→A | 5.7% | D43Y (GAC→TAC) | chbR ← | repressor of chb operon for N,N'‑diacetylchitobiose utilization |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,813,578 | 0 | C | A | 5.7% | 1045.8 / 23.5 | 270 | D43Y (GAC→TAC) | chbR | repressor of chb operon for N,N'‑diacetylchitobiose utilization |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (134/120); new base A (9/7); total (143/127) | |||||||||||
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Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGCCATTAAACAACTGCTGTTCTCGGGCAGTGGCAATTTCCGGCGCGTTAATCACTGGCTGCATCATCGACTCCTTATGCCTTCAGTTTT > CP009273/1813429‑1813727 | aaTATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCg > 1:4572814/1‑150 (MQ=255) aaTATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCg > 1:2351421/1‑150 (MQ=255) tatGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTg > 2:1329050/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |