| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,015,451 | T→A | 16.7% | G34G (GGT→GGA) | fliP → | flagellar biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,015,451 | 0 | T | A | 16.7% | 760.6 / 134.4 | 281 | G34G (GGT→GGA) | fliP | flagellar biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (119/115); new base A (26/21); total (145/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TTTTCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTGGGAACACCCTCCGCGCC > CP009273/2015302‑2015600 | tttCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTg > 2:120262/1‑150 (MQ=255) ttCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTgg > 1:3474552/1‑150 (MQ=255) ttCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTgg > 1:4597135/1‑150 (MQ=255) cGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAg > 2:3157027/1‑150 (MQ=255) ggacATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATACTTATGCGTCGTTTAATGTCTTTCGAACCTTTCCATCTCACGCAGAAAAACCACCTCTCCTTACCGCAACAGACGCTTATAACCACCCATCCGCTGCCAGGCGGTGGACAAAGc > 2:2053260/4‑150 (MQ=255) ggTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGc > 1:125139/1‑150 (MQ=255) gTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCt < 2:4242306/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTg < 1:1827855/150‑1 (MQ=255) cATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGTTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGTCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGACAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTgg < 1:4017419/150‑1 (MQ=255) cATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTgg > 1:2774597/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTgg < 1:1688820/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTTTCAATCTCTGGCTGATTAAGCCCCTCGCCTTCGCGCAAAAGCCCGGTAACACCAGCCAGCCGCGGCCAGGCGGTGGACAAATCTGGTc > 1:2329931/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTc > 1:3182889/1‑150 (MQ=255) gAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACAGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCg > 2:812551/1‑150 (MQ=255) aaaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTc < 1:1983075/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTc > 2:4228162/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTcc > 1:1296937/1‑150 (MQ=255) aTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTccc < 2:2280707/150‑1 (MQ=255) ttGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCgg > 2:3351801/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGc > 1:2855971/1‑150 (MQ=255) tAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAg > 2:2445238/1‑150 (MQ=255) aaGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGa < 1:3148757/150‑1 (MQ=255) aaGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGa < 1:3149018/150‑1 (MQ=255) aaGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCGGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACAGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCGGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGa > 1:396052/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGAc < 2:719217/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCt > 1:564972/1‑150 (MQ=255) aGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTgg > 2:3572491/1‑150 (MQ=255) gggAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGgtgt > 2:1126437/1‑150 (MQ=255) ggAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGtt < 2:3029685/150‑1 (MQ=255) gagaTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtc < 1:3216974/150‑1 (MQ=255) gagaTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCATCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtc > 1:2137814/1‑150 (MQ=255) aTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTTGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtcatc > 1:2574016/1‑150 (MQ=255) ccTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCAc < 2:2088579/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCAcc > 1:4636771/1‑150 (MQ=255) tGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGt > 1:3318373/1‑150 (MQ=255) tGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGt < 2:270496/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTg < 1:1513122/150‑1 (MQ=255) gtcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGa < 2:1480501/150‑1 (MQ=255) tcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGAc < 2:4166128/150‑1 (MQ=255) tcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGAc > 1:4359764/1‑150 (MQ=255) gtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGt < 2:3137788/150‑1 (MQ=255) ttGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTAtt < 1:85944/150‑1 (MQ=255) tctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCg > 2:3956642/1‑150 (MQ=255) tctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCg > 2:723442/1‑150 (MQ=255) tctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCg < 2:4083653/150‑1 (MQ=255) tctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCg < 2:1162033/150‑1 (MQ=255) ctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCgg < 2:1965959/150‑1 (MQ=255) ctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCgg < 1:3718274/150‑1 (MQ=255) 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ccTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTa < 1:4022538/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACt > 1:4150412/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACt > 2:164467/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACt > 1:447555/1‑150 (MQ=255) tCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACtga > 1:3735791/1‑150 (MQ=255) 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cccTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGca > 2:296489/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcat < 1:2176921/150‑1 (MQ=255) cTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatc > 2:4501348/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatc > 1:3833399/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatca < 1:3035527/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatcat < 1:4228162/150‑1 (MQ=255) cgcAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGttt > 2:1841341/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTg > 2:3013232/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTg > 1:1782450/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTgg < 1:4576214/150‑1 (MQ=255) 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agccagccGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAAcgcg < 1:3478982/150‑1 (MQ=255) agccagccGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAAcgcg < 1:4616741/150‑1 (MQ=255) agccagccGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAAcgcg < 1:894072/150‑1 (MQ=255) cagccGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTg < 1:2977039/150‑1 (MQ=255) agccGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATAGCGTAACGCGCTgg > 2:238079/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTGGGAACACCCt < 2:3208064/150‑1 (MQ=255) tGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTGGGAACACCCTCCGCGcc > 2:673193/1‑150 (MQ=255) | TTTTCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTGGGAACACCCTCCGCGCC > CP009273/2015302‑2015600 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |