| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 151,620 | C→A | 15.9% | K98N (AAG→AAT) | htrE ← | putative outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 151,620 | 0 | C | A | 15.9% | 677.6 / 74.7 | 212 | K98N (AAG→AAT) | htrE | putative outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (98/80); new base A (18/16); total (116/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGATC > CP009273/151471‑151769 | aGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTc < 1:2508028/150‑1 (MQ=255)aGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTc < 1:2251137/150‑1 (MQ=255) gACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCt < 2:3958256/150‑1 (MQ=255) aCGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCtt < 1:1648754/150‑1 (MQ=255) aCGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCtt < 2:2393194/150‑1 (MQ=255) ttGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTaa > 2:4352340/1‑150 (MQ=255) cGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGa < 1:2492480/150‑1 (MQ=255) cGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGa < 1:2491453/150‑1 (MQ=255) cGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGa < 1:1603893/150‑1 (MQ=255) tAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATAc < 2:829818/150‑1 (MQ=255) tAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATAc > 1:2980081/1‑150 (MQ=255) gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGc < 1:3349530/150‑1 (MQ=255) tCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTAGATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGcc > 2:3839280/1‑150 (MQ=255) cATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCt < 2:1658065/150‑1 (MQ=255) aTAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTg > 2:1095681/1‑150 (MQ=255) tAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTgg > 1:2421363/1‑150 (MQ=255) aaCGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTggg > 2:3459693/1‑150 (MQ=255) gAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGt < 1:2165647/150‑1 (MQ=255) gAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGt > 1:3798338/1‑150 (MQ=255) cAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCt < 1:2744473/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCt < 1:429924/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCt < 2:3597346/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCt < 2:3249808/150‑1 (MQ=255) aGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtt > 2:452229/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttt < 1:4442382/150‑1 (MQ=255) aGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttttt < 1:2729112/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTc > 2:4177849/1‑150 (MQ=255) cTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTcc > 1:4240827/1‑150 (MQ=255) gAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCtt < 1:1171953/150‑1 (MQ=255) gAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCtt < 2:1729976/150‑1 (MQ=255) gAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCtt > 2:2737543/1‑150 (MQ=255) gggATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCa < 2:119281/150‑1 (MQ=255) aTAATTTCCGTCATATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTCATATGAAACGGCAATAAAGTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAAtt < 2:4620833/150‑1 (MQ=255) tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTg < 1:4603547/150‑1 (MQ=255) tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTg < 1:3787911/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCGTCAATTGCGACa > 2:3155857/1‑150 (MQ=255) gTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAt < 1:4047146/150‑1 (MQ=255) cAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGt > 2:4467807/1‑150 (MQ=255) aaTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTaa < 2:1387246/150‑1 (MQ=255) aTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAATTTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTATTTTTTCCTTACATTGCGAAAAAAGTact > 1:3887230/1‑148 (MQ=255) aTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAAt < 1:3501387/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGTTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTg < 2:2474135/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTATTGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGt > 2:2304084/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGt > 2:3684649/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGt < 1:549421/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTa < 1:455510/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTaa < 1:2387200/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATAGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAAATGGGACAAATTTAAAAAAATGGTTAATg > 1:2361047/1‑150 (MQ=255) cGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTACTTCAATTGCGACAAATGAAATACTTTGGTTAATGa > 2:640819/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTCATCCCTGGCATGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAtt < 1:4141011/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttg < 1:4269326/150‑1 (MQ=255) gTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCATGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATTAttggt > 2:2624808/1‑150 (MQ=255) ttCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttggttg < 1:1189054/150‑1 (MQ=255) ttCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttggttg < 2:870468/150‑1 (MQ=255) aTCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCTGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTc < 1:318240/150‑1 (MQ=255) aTCCCTGGCAAACAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTc < 2:2447877/150‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCg > 1:3230256/1‑150 (MQ=255) tCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCg < 1:1894320/150‑1 (MQ=255) ccTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGtt > 2:517498/1‑150 (MQ=255) cTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGttt < 2:636641/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTa < 2:694963/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTACTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACAt > 1:2805561/1‑150 (MQ=255) aGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATaa > 2:3344512/1‑150 (MQ=255) aGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATaa < 2:1746173/150‑1 (MQ=255) cAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAac > 1:2626669/1‑150 (MQ=255) aGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAaca > 1:4204365/1‑150 (MQ=255) aGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGAAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAaca > 1:2568702/1‑150 (MQ=255) gAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATTTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAacac > 1:2862329/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACt > 2:4346530/1‑150 (MQ=255) ggCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAc < 1:4352354/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcg > 2:1040075/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTATTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTTGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgt > 1:3946164/1‑150 (MQ=255) tttCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgtcgt > 2:2731439/1‑150 (MQ=255) cGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTaaa > 2:2216778/1‑150 (MQ=255) gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 2:259498/1‑150 (MQ=255) gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 1:2307475/1‑150 (MQ=255) ttatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAaca > 1:1029856/1‑150 (MQ=255) tatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAacac > 2:1514196/1‑150 (MQ=255) atatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGt < 2:4256071/150‑1 (MQ=255) atatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGt > 1:1986042/1‑150 (MQ=255) tatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGta > 2:3731393/1‑150 (MQ=255) tCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGtata < 1:3437644/150‑1 (MQ=255) cGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAAGTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAg < 2:4388462/150‑1 (MQ=255) ggAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCg < 1:2020041/150‑1 (MQ=255) agaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCggg < 2:546205/150‑1 (MQ=255) gaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCgggg < 1:1608152/150‑1 (MQ=255) tAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAc > 1:2777519/1‑150 (MQ=255) tAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAAAACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGGTAc > 1:2833232/1‑150 (MQ=255) aaTATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAcc < 1:3956995/150‑1 (MQ=255) tatGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCtt < 2:3768837/150‑1 (MQ=255) tGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCa > 2:3071541/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATTATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 1:4441838/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCaat < 2:2532289/150‑3 (MQ=255) aaaCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 1:3071750/1‑150 (MQ=255) aCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGt > 2:2756230/1‑150 (MQ=255) cTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTa < 2:1825666/150‑1 (MQ=255) gCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTAcc > 1:1516973/1‑150 (MQ=255) aTAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTACTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACAACCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGc > 1:886904/1‑150 (MQ=255) tAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCt > 2:1619492/1‑150 (MQ=255) ttCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTgaga > 2:3292214/1‑150 (MQ=255) | AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGATC > CP009273/151471‑151769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |