| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 153,472 | G→T | 100% | intergenic (‑102/+268) | yadN ← / ← folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 153,472 | 0 | G | T | 97.0% | 766.0 / 13.4 | 233 | intergenic (‑102/+268) | yadN/folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/3); new base T (124/102); total (128/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > CP009273/153327‑153618 | gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTatat < 1:3605550/150‑1 (MQ=255) ccAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAtt > 2:4223414/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAttt > 2:808893/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAttt > 2:3693271/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAttt < 2:4447674/150‑1 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGAAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATATGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATAttt < 1:3557467/150‑1 (MQ=255) gCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGt > 1:2719645/1‑150 (MQ=255) cATAAGACCAGCCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATCGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGtt < 2:2017767/150‑1 (MQ=255) cATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGtt < 2:2831561/150‑1 (MQ=255) aTAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTa > 2:1564417/1‑150 (MQ=255) aTAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTa < 1:2736619/150‑1 (MQ=255) aTAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTa < 1:3649929/150‑1 (MQ=255) tAAGCCCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAc < 2:4091508/150‑1 (MQ=255) tAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAc > 2:3300448/1‑150 (MQ=255) gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCa > 1:3740335/1‑150 (MQ=255) gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCa > 1:4611660/1‑150 (MQ=255) gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCa < 2:1655094/150‑1 (MQ=255) cAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAt < 1:3846882/150‑1 (MQ=255) cAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAc < 2:3450785/150‑1 (MQ=255) cAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAc < 2:3451004/150‑1 (MQ=255) aGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACa > 2:3229756/1‑150 (MQ=255) aGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACa > 1:58169/1‑150 (MQ=255) aGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACa > 2:667215/1‑150 (MQ=255) gggCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACaa > 1:1037667/1‑150 (MQ=255) ggCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAAc > 1:2997618/1‑150 (MQ=255) cAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCa > 1:1625527/1‑150 (MQ=255) aaaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCAtt < 2:2912576/150‑1 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCACTTATATTTTTTACCCAAATTTACAACAATTGtt > 1:2760428/1‑150 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:3173428/1‑150 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:2533587/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAt > 1:2134854/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAtt > 1:3038744/1‑150 (MQ=255) tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACGTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGt < 2:3945261/150‑1 (MQ=255) ttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTc < 1:3571892/150‑1 (MQ=255) tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg > 1:501469/1‑150 (MQ=255) tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg > 1:4377921/1‑150 (MQ=255) aGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGc > 2:1955070/1‑150 (MQ=255) gACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGcc > 2:377872/1‑150 (MQ=255) cATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACACATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTa > 2:3604569/1‑150 (MQ=255) cATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTa < 1:283258/150‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 1:3780322/1‑150 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 2:1352921/1‑150 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 1:2955346/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACAATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 2:304146/1‑150 (MQ=255) tCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCAc > 2:4091154/1‑150 (MQ=255) cTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACtt > 1:981608/1‑150 (MQ=255) tttAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACttt < 1:1368457/150‑1 (MQ=255) aaaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAga < 2:296518/150‑2 (MQ=255) aaaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGc > 2:3015378/1‑150 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 2:1849259/1‑150 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 1:2898913/1‑150 (MQ=255) aTTCCATTATTCAGAATACATTTTTGAAGAATGACTATTAATGACACAAATATGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGAAATTATATTTGTTACAAAAATTTACAACCATTGTTCATTATGTCGACTATTGTTCACTTTAGAAGCttt < 2:2660085/150‑1 (MQ=255) cATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa > 1:735146/1‑150 (MQ=255) tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa < 2:284887/150‑1 (MQ=255) tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa > 2:1893022/1‑150 (MQ=255) cAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatta < 2:1053448/150‑1 (MQ=255) cAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatta < 2:351769/150‑1 (MQ=255) aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGGGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 2:3950926/1‑150 (MQ=255) aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 2:2541478/1‑150 (MQ=255) aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 1:111116/1‑150 (MQ=255) gACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaa < 1:1064257/150‑1 (MQ=255) aCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaat > 1:803446/1‑150 (MQ=255) tACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAttt > 2:576834/1‑150 (MQ=255) aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 1:1169794/1‑150 (MQ=255) aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 2:2542402/1‑150 (MQ=255) tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt < 2:3789007/150‑1 (MQ=255) tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt < 1:1338028/150‑1 (MQ=255) tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt < 1:1337207/150‑1 (MQ=255) tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATATTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt > 1:1929310/1‑150 (MQ=255) tttGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTaa < 1:3809145/150‑1 (MQ=255) aagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCa < 2:3729613/150‑1 (MQ=255) ttCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaa > 1:3425775/1‑150 (MQ=255) tGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAAt > 2:3592739/1‑150 (MQ=255) acacAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATaa > 2:1164787/1‑150 (MQ=255) cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg < 1:1385817/150‑1 (MQ=255) cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg < 1:4260016/150‑1 (MQ=255) cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg < 1:3710650/150‑1 (MQ=255) cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg < 1:2906525/150‑1 (MQ=255) aaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTca > 1:89706/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACaa < 1:3149140/150‑1 (MQ=255) gagaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGt > 2:1783643/1‑150 (MQ=255) gagaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGt > 1:2979999/1‑150 (MQ=255) agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg > 2:2044095/1‑150 (MQ=255) aaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCaa < 2:3307715/150‑1 (MQ=255) cAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAtt < 1:2467863/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTgg > 2:4178489/1‑150 (MQ=255) aTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGAAATTGGt > 1:1821383/1‑150 (MQ=255) tGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGtt < 2:838517/150‑1 (MQ=255) tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg < 1:234742/150‑1 (MQ=255) tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg > 1:3279799/1‑150 (MQ=255) tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg < 1:4208779/150‑1 (MQ=255) aGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAggg > 2:4561465/1‑150 (MQ=255) aGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAggg > 2:2228621/1‑150 (MQ=255) tatTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTAt < 2:1472547/150‑1 (MQ=255) atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAANATTAAGTAANAATAAGTTNACAAGTGCAAGTGGTTANGGTATg > 1:4470316/1‑150 (MQ=255) atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 2:1137550/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGga < 1:1911706/150‑1 (MQ=255) aTGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga > 1:4523074/1‑150 (MQ=255) aTGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga < 1:553032/150‑1 (MQ=255) aGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATgg > 1:3399966/1‑150 (MQ=255) | GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > CP009273/153327‑153618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |