| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 186,279 | A→T | 5.3% | noncoding (81/136 nt) | tff → | novel sRNA, function unknown |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 186,279 | 0 | A | T | 5.3% | 809.8 / 25.7 | 244 | noncoding (81/136 nt) | tff | novel sRNA, function unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (111/120); new base T (4/9); total (115/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GACGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTACTG > CP009273/186130‑186428 | gACGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGca > 1:371958/1‑150 (MQ=255)gACGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGca < 1:66280/150‑1 (MQ=255) tCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACata < 2:3592662/150‑1 (MQ=255) tCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACata > 1:3159164/1‑150 (MQ=255) cTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACatat > 2:783295/1‑150 (MQ=255) gATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTc < 1:371764/150‑1 (MQ=255) gCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCgg < 1:15355/150‑1 (MQ=255) acacAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGc > 1:3575049/1‑150 (MQ=255) acacAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGc > 2:4620178/1‑150 (MQ=255) acaGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGccc > 1:206342/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCtt < 1:1802511/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCtt > 2:2705962/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGAATTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCtt > 2:3741518/1‑150 (MQ=255) gcgcCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCTCATATTCCGGGGTGCCCttt < 1:3846872/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCTCATATTCCGGGGTGCCCttt < 1:3845855/150‑1 (MQ=255) caacaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTgggg < 1:2847375/150‑1 (MQ=255) caacaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTgggg > 1:3290546/1‑150 (MQ=255) aacaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGt < 1:2755471/150‑1 (MQ=255) aacaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGt < 1:124133/150‑1 (MQ=255) acaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTc < 2:3382821/150‑1 (MQ=255) acaaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTc < 1:4227247/150‑1 (MQ=255) caaTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCg > 1:3734564/1‑150 (MQ=255) attGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAat < 2:648102/150‑1 (MQ=255) ttGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAata < 1:2046345/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATg < 1:3475546/150‑1 (MQ=255) tCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGAt < 1:715985/150‑1 (MQ=255) ccACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATa < 2:385566/150‑1 (MQ=255) acgacgTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACg < 1:468172/150‑1 (MQ=255) acgacgTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACg > 2:945631/1‑150 (MQ=255) cgacgTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGt > 1:95142/1‑150 (MQ=255) cgacgTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGt > 2:2217004/1‑150 (MQ=255) acgTAATTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTgg < 2:123399/150‑1 (MQ=255) gTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAg > 2:1737943/1‑150 (MQ=255) gTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAg > 2:4038655/1‑150 (MQ=255) tATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAgg > 2:4078980/1‑150 (MQ=255) tgGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAc < 1:371155/150‑1 (MQ=255) tgGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAc < 2:3263759/150‑1 (MQ=255) ggTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAcc < 1:560796/150‑1 (MQ=255) gTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAccc < 2:915872/150‑1 (MQ=255) gTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAccc > 2:2137576/1‑150 (MQ=255) tataAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAcccc < 2:4392846/150‑1 (MQ=255) tataAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAcccc < 2:4516601/150‑1 (MQ=255) tataAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAAcccc < 2:3686962/150‑1 (MQ=255) taAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCaa > 2:3793218/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGGCAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAAc > 2:2845904/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACCCACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACttt < 1:2394814/150‑1 (MQ=255) ggACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATag > 2:598446/1‑150 (MQ=255) gACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATaga > 1:4522560/1‑150 (MQ=255) gACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATaga < 2:3658586/150‑1 (MQ=255) ttCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGt > 1:2612162/1‑150 (MQ=255) tCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGtt > 2:1369172/1‑150 (MQ=255) gATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTa < 2:3468980/150‑1 (MQ=255) gATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATAGAGAGGTTTTa > 2:1557960/1‑150 (MQ=255) tCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAAt < 2:872986/150‑1 (MQ=255) tCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAAt < 2:1879550/150‑1 (MQ=255) ccATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATc > 1:236033/1‑150 (MQ=255) ccATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATc > 1:1847564/1‑150 (MQ=255) cATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCa > 2:1790663/1‑150 (MQ=255) cATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGGAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCa > 2:2492570/1‑150 (MQ=255) gTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCaa < 2:1639229/150‑1 (MQ=255) tataCACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAAc < 1:94155/150‑1 (MQ=255) tataCACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAAc < 1:4613745/150‑1 (MQ=255) ataCACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCTCATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACt < 2:3354080/150‑1 (MQ=255) ataCACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACt < 1:1932227/150‑1 (MQ=255) taCACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTg < 1:3902860/150‑1 (MQ=255) acacAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGt < 1:2246392/150‑1 (MQ=255) cacaGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGtt < 2:2466195/150‑1 (MQ=255) caGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTc > 2:4013987/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATg < 2:371952/150‑1 (MQ=255) ggACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATgcg < 2:2671574/150‑1 (MQ=255) ggACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATgcg < 2:2994411/150‑1 (MQ=255) ggACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATgcg > 2:1023395/1‑150 (MQ=255) ggACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATgcg > 2:3983854/1‑150 (MQ=255) aCGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGcgcg > 2:3988631/1‑150 (MQ=255) ggAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGAc < 2:2037881/150‑1 (MQ=255) gAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACa < 1:1386302/150‑1 (MQ=255) aGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATg > 2:4258159/1‑150 (MQ=255) cGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCt < 2:3783418/150‑1 (MQ=255) gACACTCTCACTTTGTGTAACAACACACCCGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCAAACATTGATCTAGAGGTTTTAATCATTGAAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTc > 1:1592122/1‑150 (MQ=255) gACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTc > 2:2327004/1‑150 (MQ=255) aCAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCa < 1:172930/150‑1 (MQ=255) aTCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAgg < 1:1117513/150‑1 (MQ=255) aTCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAgg < 1:2669358/150‑1 (MQ=255) tctcACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGc > 2:4157938/1‑150 (MQ=255) aCTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGgt > 1:1110639/1‑150 (MQ=255) aCTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGgt > 1:3434597/1‑150 (MQ=255) ttGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGtt < 1:1541406/150‑1 (MQ=255) ttGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGtt < 2:2411077/150‑1 (MQ=255) tgtgTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTc < 2:1540598/150‑1 (MQ=255) tAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACtt > 1:2728018/1‑150 (MQ=255) tAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACtt > 1:3977736/1‑150 (MQ=255) aacaacACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTc < 1:229824/150‑1 (MQ=255) caacaCACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACACCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCgg > 2:1983591/1‑150 (MQ=255) acacacacGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTc > 1:4610968/1‑150 (MQ=255) tATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGAccc > 2:1433941/1‑150 (MQ=255) tATCGGCACATATACCTGGGTGCCCTTTGGGGTCGGAAAAATGTGAAACGTGGAGGCATAACCCCAACTGTTATATAGAGGATTTAATCATGGCAACAGATTCCAAGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTACGGTCACCAGAccc > 2:1972347/1‑150 (MQ=255) ggCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTa > 1:2892134/1‑150 (MQ=255) cacaTATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTACt > 2:3155593/1‑150 (MQ=255) cacaTATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTACt < 1:3409820/150‑1 (MQ=255) acaTATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTACTg > 1:1895833/1‑150 (MQ=255) | GACGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTACTG > CP009273/186130‑186428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |