| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,709,841 | T→A | 13.5% | intergenic (‑33/‑272) | grcA ← / → ung | autonomous glycyl radical cofactor/uracil‑DNA‑glycosylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,709,841 | 0 | T | A | 13.5% | 874.1 / 104.4 | 289 | intergenic (‑33/‑272) | grcA/ung | autonomous glycyl radical cofactor/uracil‑DNA‑glycosylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/125); new base A (16/23); total (141/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
TGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCG > CP009273/2709692‑2709990 | tGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGt < 1:2757198/150‑1 (MQ=255) cATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTc < 1:3674846/150‑1 (MQ=255) cATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATc < 2:3986351/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGc > 2:8742/1‑150 (MQ=255) cTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGTCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTg > 2:2289928/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGt < 2:2223075/150‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTc < 2:4112001/150‑1 (MQ=255) ttttGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTcgc > 1:1336879/1‑150 (MQ=255) cAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCa > 1:2435346/1‑150 (MQ=255) cAACGAAGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCa < 2:3842534/150‑1 (MQ=255) gcGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAAt > 1:2028297/2‑150 (MQ=255) gATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTg < 1:1464101/150‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTg > 1:69864/1‑150 (MQ=255) gATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTg < 1:3826556/150‑1 (MQ=255) aTGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTgg > 1:3186585/1‑150 (MQ=255) aTGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTgg < 1:1814640/150‑1 (MQ=255) aTGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCAGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTgg > 2:320850/1‑150 (MQ=255) tGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGt < 1:436862/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGt < 1:2314915/150‑1 (MQ=255) gCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTa > 2:3061225/1‑150 (MQ=255) gCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTa > 2:1745962/1‑150 (MQ=255) cAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTaa > 2:1748142/1‑150 (MQ=255) cgcTTCGCCTTTTTAGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCTTTATCGGCTTTAGTATTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCa < 2:1433301/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAtt < 2:152412/150‑1 (MQ=255) ttCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTATCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCATCCCCGGCAAAAGTATTTGATGTGATCAGCCTGTCGAGGCCAATTTGTAAAACCAttg > 2:4261338/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAttg > 2:1139668/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAttgt > 2:4232426/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATATGGATACCTGTAATCATGTGATGCATCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAttgg > 1:2206835/1‑149 (MQ=255) cGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAttgtt > 1:1969380/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCAttgtt < 1:3018036/150‑1 (MQ=255) ccTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGc > 1:2518408/1‑150 (MQ=255) ccTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGc < 1:1735028/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAgtg < 2:1505020/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAgtg > 2:441698/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAgtgt < 1:3928958/150‑1 (MQ=255) cTGTCCAGCAGCCAGACAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGta < 1:3690613/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGtata < 1:1093893/150‑1 (MQ=255) agcagcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGtatatata > 1:1147420/1‑150 (MQ=255) agcagcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGtatatata < 1:854518/150‑1 (MQ=255) cagcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATAct > 2:1960359/1‑150 (MQ=255) agcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActc > 1:4016854/1‑150 (MQ=255) ccAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcct > 2:1172914/1‑150 (MQ=255) ccAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcct < 2:800020/150‑1 (MQ=255) ccAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcct < 2:3541795/150‑1 (MQ=255) cAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcctc > 2:3707170/1‑150 (MQ=255) cAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcctc > 2:4495205/1‑150 (MQ=255) aGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCa > 1:4219595/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCTGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCaa > 1:1604839/1‑150 (MQ=255) gagTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGTTTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAacac < 2:4460131/150‑1 (MQ=255) agTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACAcc < 1:1242949/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCt < 2:2142953/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCtt < 1:949053/150‑1 (MQ=255) cagcagATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTg > 1:1540380/1‑150 (MQ=255) gcagATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGaa < 1:6795/150‑1 (MQ=255) gATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCt > 2:3282460/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCtt < 2:1357879/150‑1 (MQ=255) aTCGTCGTTAGCGGCTTTAGGAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCTAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCtt < 2:485667/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTg > 2:3257446/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTg > 1:58383/1‑150 (MQ=255) cgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGAtt > 1:1015885/1‑150 (MQ=255) cgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGAtt < 1:4468278/150‑1 (MQ=255) gCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAAt < 1:4116278/150‑1 (MQ=255) gCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAAt < 2:2376676/150‑1 (MQ=255) ggCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCa > 1:3511628/1‑150 (MQ=255) ttAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATaa < 1:4142781/150‑1 (MQ=255) tCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACcac < 2:2828275/150‑1 (MQ=255) tCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACcac < 1:4627198/150‑1 (MQ=255) gATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACAt < 2:2843813/150‑1 (MQ=255) gATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACAt < 2:3359745/150‑1 (MQ=255) aTACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATc > 2:2061535/1‑150 (MQ=255) ccTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAg < 2:1278568/150‑1 (MQ=255) ccTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAg > 2:1632072/1‑150 (MQ=255) cTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGt > 2:2722788/1‑150 (MQ=255) tGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTa > 2:4465747/1‑150 (MQ=255) gTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTAt > 2:4290925/1‑150 (MQ=255) tAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATg < 2:4372955/150‑1 (MQ=255) aaTCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATgg > 2:848744/1‑150 (MQ=255) cATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg > 1:3143212/1‑150 (MQ=255) ccccGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATCCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGAtttt < 2:1605243/150‑1 (MQ=255) ccccGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGAtttt < 1:4329903/150‑1 (MQ=255) ccccGGCAAAATTATTTGATTTGATCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGAtttt < 2:3633611/150‑1 (MQ=255) cGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTAtt > 2:3335008/1‑150 (MQ=255) cGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTAtt < 2:4343712/150‑1 (MQ=255) gCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGt < 1:3938444/150‑1 (MQ=255) cAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGtt < 2:2333035/150‑1 (MQ=255) cAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGtt > 2:2520718/1‑150 (MQ=255) cAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGtt > 1:3322541/1‑150 (MQ=255) ttattTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACa > 2:3387998/1‑150 (MQ=255) tgatttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAAc < 2:927082/150‑1 (MQ=255) tgatttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAAc < 2:3470193/150‑1 (MQ=255) gatttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACt > 1:2596341/1‑150 (MQ=255) gatttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACt < 2:2024945/150‑1 (MQ=255) atttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAACACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACtt < 1:535290/150‑1 (MQ=255) atgtgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACtt < 1:2648955/147‑1 (MQ=255) ttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTAt < 2:505153/150‑1 (MQ=255) ttgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTAt < 2:254281/150‑1 (MQ=255) tgTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATg < 1:2893934/150‑1 (MQ=255) gTTCATACTGTCGCGGCCATTTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCATCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAAACACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTTTTGTTTTACATCAACTTATGc < 1:320850/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCg > 2:609034/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAACGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCg < 1:3374142/150‑1 (MQ=255) | TGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCG > CP009273/2709692‑2709990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |