| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,741,442 | C→A | 5.5% | A41E (GCG→GAG) | ypjD → | cytochrome c assembly protein family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,741,442 | 0 | C | A | 5.5% | 960.2 / 19.2 | 247 | A41E (GCG→GAG) | ypjD | cytochrome c assembly protein family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (116/117); new base A (5/9); total (121/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGC > CP009273/2741293‑2741591 | tcttATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTgc > 2:2992899/1‑150 (MQ=255) tGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGt > 1:4530974/1‑150 (MQ=255) cTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCt < 2:169227/150‑1 (MQ=255) cTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCATACTCCGTCTGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCt < 1:1223254/150‑1 (MQ=255) aaaCTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTGTTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGcc > 2:3765248/1‑150 (MQ=255) aaCTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCCTTGCGCTGGTCTGCCa > 2:3064589/1‑150 (MQ=255) aCTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCAc > 2:3049865/1‑150 (MQ=255) gTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCa > 2:1368841/1‑150 (MQ=255) tCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCaa > 2:2970758/1‑150 (MQ=255) gACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATc > 2:1944838/1‑150 (MQ=255) cATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGc > 2:2140631/1‑150 (MQ=255) aTCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGct > 2:675215/1‑150 (MQ=255) aTCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGct > 1:2578624/1‑150 (MQ=255) aTCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGct > 2:2994893/1‑150 (MQ=255) aCTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTg > 1:3582371/1‑150 (MQ=255) aCTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTg > 2:2530511/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGaa < 2:3119749/150‑1 (MQ=255) tGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAg < 1:2701798/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTTGAAGc > 2:2889758/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGc > 2:1545923/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGccc < 2:3269469/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCg < 2:859460/150‑1 (MQ=255) tttttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCa > 2:795406/1‑150 (MQ=255) ttttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCAt > 1:727855/1‑150 (MQ=255) ttttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCAt < 1:3672214/150‑1 (MQ=255) tttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATc > 1:4274726/1‑150 (MQ=255) ttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATcc < 1:1719641/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGACTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATcc < 1:1719471/150‑1 (MQ=255) tgctctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCt < 1:2362295/150‑1 (MQ=255) tgctctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCt < 1:3985990/150‑1 (MQ=255) gctctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTg < 1:4181522/150‑1 (MQ=255) ctctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGc > 2:2543756/1‑150 (MQ=255) tctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGcc > 1:1930748/1‑150 (MQ=255) ctgctcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGccc < 2:1446345/150‑1 (MQ=255) tcGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGTTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACg > 2:583372/1‑150 (MQ=255) cgcTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTg < 2:1825459/150‑1 (MQ=255) gcTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGa > 1:4177407/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGAt < 2:10321/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATa < 2:2262156/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATa > 1:770982/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATa < 2:2048597/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAg < 2:1900250/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAg < 2:4230570/150‑1 (MQ=255) tCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCg < 2:3217961/150‑1 (MQ=255) cGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCgg > 1:3652588/1‑150 (MQ=255) tACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACaa > 2:3465451/1‑150 (MQ=255) tACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACaa < 1:1297383/150‑1 (MQ=255) aCTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACaaa < 1:2023841/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCACTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAAcc < 2:1284127/150‑1 (MQ=255) tCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCa > 1:2045250/1‑150 (MQ=255) cAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAg < 1:2107260/150‑1 (MQ=255) aGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGc > 1:114093/1‑150 (MQ=255) aGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGc > 1:2742223/1‑150 (MQ=255) gTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGAGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGcc < 2:4537914/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCctg < 1:1491089/150‑1 (MQ=255) cTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAAc < 2:1484662/150‑1 (MQ=255) cTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAAc < 1:3292041/150‑1 (MQ=255) cTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGAGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAAc < 1:198579/150‑1 (MQ=255) gATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGACTGCTGAACGt > 2:382649/1‑150 (MQ=255) ttGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTg < 2:4468565/150‑1 (MQ=255) ttGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGAGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTg > 1:614943/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTgg > 2:3560680/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTgg > 1:154077/1‑150 (MQ=255) gTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGt > 1:4267409/1‑150 (MQ=255) gTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGt < 1:1276658/150‑1 (MQ=255) gtCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGtt < 1:2455095/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCAt < 1:3168855/150‑1 (MQ=255) tgcAATATAATGGCTGCTTGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCTTTGCGCTGGTCTGCCACGAATTCGCTGTGGATGCCCGCATCCTGCCCGAGGGTGATAGCTGACAAATCCTCAGCGTGCTGAAAGTTGTTTCATTGGTCAGtt < 1:2809441/150‑1 (MQ=255) tgcAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGAGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGtt > 1:449488/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaCGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTtga > 1:2641654/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGAGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTtgatga < 1:1042458/150‑1 (MQ=255) aaaCGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTgatgat > 2:3689931/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATc > 2:77011/1‑150 (MQ=255) ggcggcTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGt > 2:268252/1‑150 (MQ=255) cggcTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTAc > 1:2981195/1‑150 (MQ=255) gcTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACgg > 1:1871255/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTa > 1:3071257/1‑150 (MQ=255) gcggcgCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAAt < 1:2889758/150‑1 (MQ=255) cggcgCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATg < 2:2468852/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGAc < 1:2574075/150‑1 (MQ=255) gcATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCa < 1:2913270/150‑1 (MQ=255) gcATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCa < 1:1385264/150‑1 (MQ=255) gcATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCa > 1:478095/1‑150 (MQ=255) aTGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAtt > 1:3712937/1‑150 (MQ=255) tGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtg > 2:2747393/1‑150 (MQ=255) ggCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtgt > 1:2179149/1‑150 (MQ=255) ggCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtgt > 1:2076962/1‑150 (MQ=255) attattTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCt < 1:86204/150‑1 (MQ=255) ttattTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCtt < 1:608633/150‑1 (MQ=255) tattTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtc > 1:3222974/1‑150 (MQ=255) tattTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtc < 1:1064868/150‑1 (MQ=255) attTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtct < 2:3197266/150‑1 (MQ=255) cGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATc < 2:4276861/150‑1 (MQ=255) 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ttGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggct < 1:4110134/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggctgg > 1:512856/1‑150 (MQ=255) | TCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGCTGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGC > CP009273/2741293‑2741591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |