| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,919,067 | A→T | 36.8% | T121S (ACT→TCT) | queF → | 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase (NADPH‑dependent) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,919,067 | 0 | A | T | 36.8% | 318.2 / inf | 288 | T121S (ACT→TCT) | queF | 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase (NADPH‑dependent) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (97/85); new base T (46/60); total (143/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CGCAGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGGAGAAT > CP009273/2918918‑2919213 | cGCAGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCa > 2:4284831/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCtt < 1:3170357/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCtt > 1:1281681/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACtt < 1:1118564/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAAATGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCtt > 2:2510986/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCa > 2:2136958/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCa > 2:3489598/1‑150 (MQ=255) gTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTa > 1:4133995/1‑150 (MQ=255) tCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTaa < 2:3643810/150‑1 (MQ=255) aTGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGa > 1:4404026/1‑150 (MQ=255) aTGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGa > 1:238054/1‑150 (MQ=255) tGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGAt > 1:3206346/1‑150 (MQ=255) gTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGAtt > 1:4028340/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTa > 1:53002/1‑150 (MQ=255) tGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAg < 2:2263290/150‑1 (MQ=255) tGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCCCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAg > 1:3378978/1‑150 (MQ=255) cTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTg > 2:1340068/1‑150 (MQ=255) tGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGc > 1:1372429/1‑150 (MQ=255) gATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCg > 1:2000483/1‑150 (MQ=255) ttACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGtt < 1:3285362/150‑1 (MQ=255) tACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTta < 1:2117525/150‑1 (MQ=255) cacCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTtata > 2:2995539/1‑150 (MQ=255) acCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTatat < 1:1513883/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATc < 1:1921251/150‑1 (MQ=255) cAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCg < 2:1587918/150‑1 (MQ=255) cAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCg < 2:3672202/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTtga > 2:1830955/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTtga > 2:1711113/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAAAAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAAATGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGATCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTCAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTtga > 2:4495865/1‑150 (MQ=255) aaTCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTtgat < 2:779843/150‑1 (MQ=255) tCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTtgatga < 2:1162829/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGaa < 2:2332722/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGaa > 1:3437600/1‑150 (MQ=255) cTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGaa < 1:3718227/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGATTTAATAACTGGTATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGAGTGGCGTTATATCGTCTTGATGaa > 2:3956383/1‑150 (MQ=255) gATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACt < 2:2209910/150‑1 (MQ=255) gAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGaa < 1:1716430/150‑1 (MQ=255) aGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAg < 2:380608/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGcc > 1:2828793/1‑150 (MQ=255) gAAGAGTTTTAAGCTCTATGTCAACAGTTTTAACGAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCa > 1:2191018/1‑150 (MQ=255) gAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCa > 1:2296492/1‑150 (MQ=255) ttttAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGAt > 2:1246209/1‑150 (MQ=255) tttAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATa < 2:488962/150‑1 (MQ=255) tttAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTTTTTGGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATa < 2:1518110/150‑1 (MQ=255) aGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTc < 2:906616/150‑1 (MQ=255) aGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTc > 1:838664/1‑150 (MQ=255) aGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTCTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTc > 1:3243159/1‑150 (MQ=255) ctATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCAttt > 1:3532759/1‑150 (MQ=255) ctATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCAttt < 2:2019011/150‑1 (MQ=255) tATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCAtttt < 2:2535011/150‑1 (MQ=255) tcAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATg < 2:1405563/150‑1 (MQ=255) tcAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATg > 1:2693481/1‑150 (MQ=255) aaCAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGc > 2:852066/1‑150 (MQ=255) aGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACt > 1:1323638/1‑150 (MQ=255) aGTGTTAACCAGACGCGTTTAAATAACAGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCCGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACt > 2:4320613/1‑150 (MQ=255) gTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACtt < 2:3325737/150‑1 (MQ=255) gTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACtt < 2:3459245/150‑1 (MQ=255) gTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACtt < 2:3325765/150‑1 (MQ=255) tttAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGc > 2:2782562/1‑150 (MQ=255) tttAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGc < 1:2344827/150‑1 (MQ=255) aaCCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCAtt < 1:461677/150‑1 (MQ=255) aCCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATtg > 1:3289462/1‑150 (MQ=255) ccAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATtga > 1:2998833/1‑150 (MQ=255) cAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATtgat > 1:1448948/1‑150 (MQ=255) gACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATtgatga < 1:1243143/150‑1 (MQ=255) gACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATtgatga < 1:1112976/150‑1 (MQ=255) cgcgTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGAcc > 1:2735362/1‑150 (MQ=255) tttAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGat < 1:2153438/150‑1 (MQ=255) tttAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGat < 2:4166603/150‑1 (MQ=255) taataaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGatat < 1:3973096/150‑1 (MQ=255) taataaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGatat < 2:669389/150‑1 (MQ=255) taataaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGatat > 1:3786272/1‑150 (MQ=255) taataaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTATAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGatat > 1:3901750/1‑150 (MQ=255) ataaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCa > 1:2652116/1‑150 (MQ=255) aaCTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACt > 2:2181528/1‑150 (MQ=255) cTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTAt < 1:4589494/150‑1 (MQ=255) tGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGNACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATc < 1:4284866/150‑1 (MQ=255) tGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATc > 2:2067355/1‑150 (MQ=255) aTGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAACGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATa < 1:4233216/150‑1 (MQ=255) aTGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATa > 2:4525489/1‑150 (MQ=255) gAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAAc > 1:717102/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTa < 2:3219539/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGTCTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCAATATCGATAACTAt < 2:4435662/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATg < 2:1013311/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATg < 2:3747707/150‑1 (MQ=255) cAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTc > 1:490086/1‑150 (MQ=255) aGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCa > 2:1867711/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCact < 1:2391877/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCacta < 1:3434367/150‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTg < 1:4271787/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGAc < 2:4175165/150‑1 (MQ=255) cgcgACTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTATTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTAt < 2:98543/150‑1 (MQ=255) gACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTg > 2:4286206/1‑150 (MQ=255) gACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTATTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTGTCATTGATGACCAGGATATCACTATAGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTg < 2:1925201/150‑1 (MQ=255) cTTAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGga > 2:2267148/1‑150 (MQ=255) ttAAGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGgag < 2:652125/150‑1 (MQ=255) ttAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGgag < 2:556705/150‑1 (MQ=255) tAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGgaga < 1:1632457/150‑1 (MQ=255) tAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGgaga > 2:1670865/1‑150 (MQ=255) aaGCTCTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGGAGaa > 2:2735121/1‑150 (MQ=255) | CGCAGGTCGCTGTCGGTCATGTTGAACTTGATTACACCAGCGTAAATCTGATTGAGTCGAAGAGTTTTAAGCTCTATCTCAACAGTTTTAACCAGACGCGTTTTAATAACTGGGATGAGGTGCGCCAGACGCTGGAGCGCGACTTAAGCACTTGCGCTCAGGGTAAGATTAGCGTGGCGTTATATCGTCTTGATGAACTGGAAGGCCAGCCGATAGGTCATTTTAATGGCACTTGCATTGATGACCAGGATATCACTATCGATAACTATGAATTCACTACTGACTATCTGGAGAAT > CP009273/2918918‑2919213 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |