Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,066,295 | C→A | 7.4% | K252N (AAG→AAT) | epd ← | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,066,295 | 0 | C | A | 7.4% | 947.3 / 31.7 | 250 | K252N (AAG→AAT) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (130/101); new base A (11/8); total (141/109) | |||||||||||
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Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GTTTGGGTGCCATCGACAATGGCACTGTGCGGATCGTGGTTAAAATCTACAGAGACCAACGGCAATTCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTCAAAGCGATCGTTAAATTGCGGAAAAAATCGTGTGATACCGGCGGCCAGTTTAGTATCGACCGGAATGATCGACTGGCTGGCTGC > CP009273/3066146‑3066444 | gTTTGGGTGCCATCGACAATGGCACTGTGCGGATCGTGGTTAAAATCTACAGAGACCAACGGCAATTCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTttc < 2:3743266/150‑1 (MQ=255) gTTTGGGTGCCATCGACAATGGCACTGTGCGGATCGTGGTTAAAATCTACAGAGACCAACGGCAATTCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTttc < 1:2738956/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGCCATCGACAATGGCACTGTGCGGATCGTGGTTAAAATCTACAGAGACCAACGGCAATTCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGATTTCATTGGCTTTTACAGGTttctt > 2:3959768/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |