| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,412,595 | C→A | 6.7% | pseudogene (130/960 nt) | yhdW → | pseudogene, amino‑acid transporter homology;putative transport; Not classified; putative periplasmic binding transport protein; periplasmic‑binding component of ABC superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,412,595 | 0 | C | A | 6.7% | 1102.0 / 31.5 | 291 | pseudogene (130/960 nt) | yhdW | pseudogene, amino‑acid transporter homology;putative transport; Not classified; putative periplasmic binding transport protein; periplasmic‑binding component of ABC superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (132/139); new base A (11/9); total (143/148) | |||||||||||
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Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
TTGCCGTTGCAAATCAGGCGCTGCTGGCGCGACGCTTGATGCCGTTCAGAAAAAAGGTTTTGTGCAATGCGGGATCAGTGATGGATTACCTGGGTTCTCTTATGCCGATGCTGACGGTAAGTTTTCAGGTATTGATGTTGATATTTGTCGTGGTGTTGCCGCTGCTGTATTTGGTGACGACACGAAAGTGAAATATACCCCGCTCACTGCAAAAGAACGCTTCACCGCTTTACAGTCAGGGGAGGTGGATTTGCTCTCCCGTAATACGACCTGGACTTCATCTCGCGATGCCGGGAT > CP009273/3412447‑3412743 | ttGCCGTTGCAAATCAGGCGCTGCTGGCGCGACGCTTGATGCCGTTCAGAAAAAAGGTTTTGTGCAATGCGGGATCAGTGATGGATTACCTGGGTTCTCTTATGCCGATGCTGACGGTAAGTTTTCAGGTATTGATGTTGATATTTGTc > 1:2907585/1‑149 (MQ=255)ttGCCGTTGCAAATCAGGCGCTGCTGGCGCGACGCTTGATGCCGTTCAGAAAAAAGGTTTTGTGCAATGCGGGATCAGTGATGGATTACCTGGGTTCTCTTATGCCGATGCTGACGGTAAGTTTTCAGGTATTGATGTTGATATTTGTc < 2:3004109/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGCAAATCAGGCGCTGCTGGCGCGACGCTTGATGCCGTTCAGAAAAAAGGTTTTGTGCAATGCGGGATCAGTGATGGATTACCTGGGTTCTCTTATGCCGATGCTGACGGTAAGTTTTCAGGTATTGATGTTGATATTTGTCgt < 2:1002390/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |