Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,414,519 | G→T | 24.2% | D343Y (GAT→TAT) | yhdX → | putative amino‑acid transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,414,519 | 0 | G | T | 24.2% | 682.9 / 152.4 | 280 | D343Y (GAT→TAT) | yhdX | putative amino‑acid transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (118/93); new base T (42/27); total (160/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTG > CP009273/3414371‑3414666 | gCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTAGTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGatat < 2:4727416/149‑1 (MQ=255) tCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATgg < 1:2736533/149‑1 (MQ=255) cGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGt < 1:643958/149‑1 (MQ=255) gTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGttt > 2:4263917/1‑149 (MQ=255) gTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGttt > 2:1874866/1‑149 (MQ=255) aCTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGc > 1:3571551/1‑149 (MQ=255) cTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCt < 2:1552476/149‑1 (MQ=255) gATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGttt < 1:1362277/149‑1 (MQ=255) gATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGttt > 2:1274301/1‑149 (MQ=255) gATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGttt < 1:2637657/149‑1 (MQ=255) ttACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGc > 1:669689/1‑149 (MQ=255) ttACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGc > 1:4448158/1‑149 (MQ=255) ttACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGc < 1:2395209/149‑1 (MQ=255) ttACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGc < 1:268691/149‑1 (MQ=255) ttACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGAGATGGTTTCGCTGTTTGc > 1:1660042/1‑149 (MQ=255) cccAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCgg > 1:930779/1‑149 (MQ=255) ccAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGc > 2:3690437/1‑149 (MQ=255) ccAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGc > 2:3354897/1‑149 (MQ=255) ccAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGc < 2:644174/149‑1 (MQ=255) cAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCa < 2:4763239/149‑1 (MQ=255) tacgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGa < 2:3303200/149‑1 (MQ=255) acgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGaa < 1:281692/149‑1 (MQ=255) cgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAAt > 1:3026059/1‑149 (MQ=255) cgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAAt < 2:337502/149‑1 (MQ=255) cgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAAt < 2:2880175/149‑1 (MQ=255) cgctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAAt < 2:488196/149‑1 (MQ=255) gctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATc < 1:559244/149‑1 (MQ=255) gctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATc < 1:3915540/149‑1 (MQ=255) ctacgcCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCa < 2:2431548/149‑1 (MQ=255) cAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTCTATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACggg > 1:193796/1‑149 (MQ=255) aGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACgggg > 2:2550420/1‑149 (MQ=255) gTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCa > 1:597662/1‑149 (MQ=255) gTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCa > 1:1207127/1‑149 (MQ=255) gTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCa < 2:4460396/149‑1 (MQ=255) gTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCa > 2:3021268/1‑149 (MQ=255) cATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAg > 1:3979560/1‑149 (MQ=255) attattCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGc > 2:3066382/1‑149 (MQ=255) tattCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCa > 2:911315/1‑149 (MQ=255) ttCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATc > 1:404920/1‑149 (MQ=255) ccccAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCga < 1:3080965/149‑1 (MQ=255) ccccAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCga < 1:1307200/149‑1 (MQ=255) ccAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCgaga > 2:2908537/1‑149 (MQ=255) gCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGAt > 1:2851563/1‑149 (MQ=255) aTTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAg < 2:20149/149‑1 (MQ=255) ttGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGc > 1:1148449/1‑149 (MQ=255) ttGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGc > 1:2216813/1‑149 (MQ=255) tGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGcc < 2:1618051/149‑1 (MQ=255) gTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGACTCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGAc > 2:3544408/1‑149 (MQ=255) gATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCa < 1:3463716/149‑1 (MQ=255) tCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCgg > 1:1395261/1‑149 (MQ=255) ccACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGt < 2:1653801/149‑1 (MQ=255) aCCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCt > 1:420400/1‑149 (MQ=255) ccGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTa > 1:2702855/1‑149 (MQ=255) cGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTAt > 2:1386722/1‑149 (MQ=255) gTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATc < 1:530181/149‑1 (MQ=255) gTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATc > 1:3041556/1‑149 (MQ=255) ttAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCt > 2:1262488/1‑149 (MQ=255) ttAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCt > 1:2959138/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGAt < 2:3781923/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGAt > 2:887027/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGATATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGAt > 2:2150978/1‑149 (MQ=255) cagccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTa < 2:4676131/149‑1 (MQ=255) cagccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTa < 2:2279065/149‑1 (MQ=255) agccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTAt > 2:3885603/1‑149 (MQ=255) agccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTAt > 2:1123410/1‑149 (MQ=255) gccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATc > 2:3503317/1‑149 (MQ=255) gccagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATc < 2:4663676/149‑1 (MQ=255) cagTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAg < 1:4692437/149‑1 (MQ=255) gTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGcc > 2:2513915/1‑149 (MQ=255) aTCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTg > 2:891954/1‑149 (MQ=255) aTCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTg > 2:3232687/1‑149 (MQ=255) tcAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACt < 1:1077638/149‑1 (MQ=255) aCATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtc > 1:3195887/1‑149 (MQ=255) aCATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtc > 2:14818/1‑149 (MQ=255) aCATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtc < 2:1326332/149‑1 (MQ=255) aCATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtc > 1:3319888/1‑149 (MQ=255) aTCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCCGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtctc < 1:1206173/149‑1 (MQ=255) aTCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTAtctc < 1:3756988/149‑1 (MQ=255) cAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCgctgc < 1:4544986/149‑1 (MQ=255) aaaCTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCtga > 1:2506053/1‑149 (MQ=255) aaCTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCtgat > 2:2221182/1‑149 (MQ=255) ctcctcTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCtgatga > 1:2171036/1‑149 (MQ=255) cctcTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAat > 2:3133894/1‑149 (MQ=255) cctcTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAat > 2:2000581/1‑149 (MQ=255) tctTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCt < 2:4222306/149‑1 (MQ=255) gccgccGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATaa < 1:292327/149‑1 (MQ=255) gccgcTATTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAAccg > 1:123311/1‑149 (MQ=255) tATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCa > 2:4064411/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCAt > 2:2750045/1‑149 (MQ=255) ttGGCTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATc > 2:695853/1‑149 (MQ=255) ttGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATc > 1:4189293/1‑149 (MQ=255) ttGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATc < 1:887955/149‑1 (MQ=255) gtGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATc < 2:259152/148‑1 (MQ=255) tGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATcg > 1:1743687/1‑149 (MQ=255) tGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATcg > 1:3505337/1‑149 (MQ=255) cTATCCCTATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGa < 2:2179593/149‑1 (MQ=255) tATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGAt > 1:20532/1‑149 (MQ=255) aTCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATc > 1:1437743/1‑149 (MQ=255) ccGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATAGCGATCGtt < 2:119709/149‑1 (MQ=255) cGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTg < 1:910842/149‑1 (MQ=255) | AGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCGGGTGATTATTCCACCGTTAACCAGCCAGTATCTCAACATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTG > CP009273/3414371‑3414666 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |