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tCCGCAGATTGCGCCACCGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGTCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATgcgg > 1:369646/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGATTGCGCCACCGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATgcgg > 2:2880919/1‑149 (MQ=255) gATTGCGCCACCGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCa > 2:660707/1‑149 (MQ=255) gcCACCGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCct > 1:4002595/1‑149 (MQ=255) cGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATc < 1:194076/149‑1 (MQ=255) aCCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCAc > 2:2694699/1‑149 (MQ=255) ccATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCAct > 1:3794459/1‑149 (MQ=255) aTTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCActct < 2:141480/149‑1 (MQ=255) aTTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAAGATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCActct < 2:2896154/149‑1 (MQ=255) ttACAGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCACTCTg > 1:4314109/1‑149 (MQ=255) ttACAGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCATGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCACTCTg > 1:500027/1‑149 (MQ=255) ccGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCACTCTGAcc < 1:1717739/149‑1 (MQ=255) | GGCTTAAGGGGACTTTCATGGCTAACTATTTTATTGATCGCCCGGTTTTTGCCTGGGTACTTGCCATTATTATGATGCTTGCAGGTGGTCTGGCGATCATGAACTTACCGGTTGCGCAGTATCCGCAGATTGCGCCACCGACCATTACCGTCAGCGCTACCTATCCAGGTGCCGATGCGCAAACGGTAGAAGACTCGGTCACTCAGGTGATTGAGCAAAATATGAATGGGCTTGATGGCCTGATGTACATGTCTTCAACCAGTGATGCGGCGGGCAATGCCTCTATCACTCTGACCT > CP009273/3653757‑3654053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |