| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,859,661 | A→T | 5.6% | intergenic (‑28/+168) | yidE ← / ← ibpB | putative transporter/heat shock chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,859,661 | 0 | A | T | 5.6% | 1046.8 / 39.2 | 322 | intergenic (‑28/+168) | yidE/ibpB | putative transporter/heat shock chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (160/144); new base T (12/6); total (172/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
TCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCG > CP009273/3859513‑3859809 | tCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTa > 1:2975891/1‑149 (MQ=255)tCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTa > 2:3373940/1‑149 (MQ=255)tCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTGGAGATAACATTTTa > 2:4473025/1‑149 (MQ=255) ccaAACAGCACGCCGCCAATGCCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGc > 2:2334154/1‑149 (MQ=255) ccaAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTTATTGc < 1:3839292/149‑1 (MQ=255) ccaAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGc > 1:3028036/1‑149 (MQ=255) caAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCt < 2:2347169/149‑1 (MQ=255) caAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCt < 1:4184705/149‑1 (MQ=255) aaCAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTAc < 2:4736739/149‑1 (MQ=255) aaCAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTAc < 2:2594875/149‑1 (MQ=255) aGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGa > 2:3342318/1‑149 (MQ=255) aGCACGCCGCCAATACCTAATCCGATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGa < 2:2396377/149‑1 (MQ=255) cACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGAtt < 2:1067406/149‑1 (MQ=255) cACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGAtt < 2:607958/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTAt < 1:2549500/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTAt < 1:2730049/149‑1 (MQ=255) gccAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCt > 1:3295605/1‑149 (MQ=255) ccAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTg > 1:4378723/1‑149 (MQ=255) ccAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTg > 1:1072056/1‑149 (MQ=255) ccAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTg < 2:2653902/149‑1 (MQ=255) ccAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATAACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTg > 2:2780708/1‑149 (MQ=255) aaTACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGaa < 2:3664687/149‑1 (MQ=255) aaTACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGaa < 2:3396358/149‑1 (MQ=255) aaTACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGaa > 2:4092774/1‑149 (MQ=255) aTACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAAt < 1:4200936/149‑1 (MQ=255) aTACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAAt < 2:1693859/149‑1 (MQ=255) cTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGt > 2:3801022/1‑149 (MQ=255) tAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTg > 2:2063136/1‑149 (MQ=255) aaTCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGa > 2:3120405/1‑149 (MQ=255) tCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAg < 1:1590165/149‑1 (MQ=255) tCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAg < 2:548522/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGAtt < 1:483953/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGAtt > 1:3257063/1‑149 (MQ=255) gAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCt > 2:3886925/1‑149 (MQ=255) gAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCt < 2:490210/149‑1 (MQ=255) aaaTTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCtt < 1:1388914/149‑1 (MQ=255) aaTTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTta > 1:3571951/1‑149 (MQ=255) aTTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTtat > 2:1492921/1‑149 (MQ=255) tttGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTtata > 1:573524/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGcac > 1:1802647/1‑149 (MQ=255) tGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACAt < 2:2110489/149‑1 (MQ=255) gCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACAtt > 2:4656864/1‑149 (MQ=255) cGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTAt < 1:2606260/149‑1 (MQ=255) aTAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCa > 2:1474137/1‑149 (MQ=255) tAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCAc > 1:2940224/1‑149 (MQ=255) aacaaacCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACgg < 2:3410070/149‑1 (MQ=255) acaaacCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACggg < 1:4063589/149‑1 (MQ=255) aaacCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGaa < 2:2686917/149‑1 (MQ=255) ccGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGa > 1:1227419/1‑149 (MQ=255) cgacgaCTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGaa < 1:3971049/149‑1 (MQ=255) gacgacTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAACGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCGTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAAc > 2:4555286/1‑149 (MQ=255) acgacTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACg > 2:4625915/1‑149 (MQ=255) acTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGc > 1:10300/1‑149 (MQ=255) cTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGcc < 2:843722/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGcc < 2:2989544/149‑1 (MQ=255) caccaAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGaaa < 1:4728837/149‑1 (MQ=255) accaAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAat > 2:2189204/1‑149 (MQ=255) accaAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAat < 1:913382/149‑1 (MQ=255) caAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAatat > 1:2909036/1‑149 (MQ=255) aaaGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATc > 2:4605426/1‑149 (MQ=255) ccAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTTATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGACAGAACGTGCCGAAATATCTTaa > 2:1238382/1‑149 (MQ=255) gAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACa > 2:691667/1‑149 (MQ=255) aaTACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAg > 2:2559201/1‑149 (MQ=255) gACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGaaa < 2:353175/149‑1 (MQ=255) aCCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAAt > 1:1169741/1‑149 (MQ=255) ccGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAAtt > 1:105180/1‑149 (MQ=255) cGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAAttt < 1:193809/149‑1 (MQ=255) gTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTa > 1:4717228/1‑149 (MQ=255) ttAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTaa < 1:2327267/149‑1 (MQ=255) ttAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTaa > 1:3790948/1‑149 (MQ=255) aaTGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACg < 2:798104/149‑1 (MQ=255) gCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCAt < 2:4304167/149‑1 (MQ=255) cACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGag > 2:2627299/1‑149 (MQ=255) cACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGag > 1:2258898/1‑149 (MQ=255) cTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagta < 2:1780318/149‑1 (MQ=255) tCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagtaa > 1:840320/1‑149 (MQ=255) cATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACTCATTGTTGagtaag > 2:4435398/1‑149 (MQ=255) cATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATAGGTGAAGCAGATTTGCATTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAAAGTGCCGAAATATCTTAAGCAGACGAAATTTAACGCATAGTTGagtaag > 2:4688447/1‑149 (MQ=255) aTCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagtaagt < 1:3632654/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagtaagt > 1:4504785/1‑149 (MQ=255) tCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagtaagta < 1:1296099/149‑1 (MQ=255) tCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTTATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAAAGCATTGTTGAGTAAGTAAGa > 2:4005031/1‑149 (MQ=255) tttCTCTTGAGATAACATTTTTATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaa > 1:2419426/1‑149 (MQ=255) tttCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGATATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaa > 2:3507488/1‑149 (MQ=255) tttCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaa < 2:3028036/149‑1 (MQ=255) tttCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaa > 2:1216267/1‑149 (MQ=255) tctTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaaaaaa > 1:515867/1‑149 (MQ=255) gaTAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCcca > 1:31550/1‑149 (MQ=255) aTAACATTTTTATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAATTATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCccac < 2:141397/149‑1 (MQ=255) aTAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCccac > 1:3502853/1‑149 (MQ=255) tAACATTTTAATTGCTACGTATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCATTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCccacc < 2:2796779/149‑1 (MQ=255) cATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGa < 2:1140563/149‑1 (MQ=255) cATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGa > 1:1007655/1‑149 (MQ=255) aTTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGaa > 1:2141785/1‑149 (MQ=255) aTTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGaa < 1:4625923/149‑1 (MQ=255) ttttTATTGCTACTGTTTTGGGCTGAATCGGTGAAGCATATTTGCCTTTTAGCGCACATTATAACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATATTAAACTGTCTAAATTTAACGAATTGTTGTGTAATTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAAt < 1:1719579/149‑1 (MQ=255) ttttAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAAt > 1:3465253/1‑149 (MQ=255) tttAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATg > 1:1671347/1‑149 (MQ=255) ttAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATgg < 2:3938820/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCg > 1:2759761/1‑149 (MQ=255) | TCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCG > CP009273/3859513‑3859809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |