| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,946,395 | 0 | C | A | 6.3% | 1100.6 / 29.8 | 285 | I184I (ATC→ATA) | ilvE | branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
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Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
CTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTATCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTGGCGAAAGAGCTGG > CP009273/3946249‑3946543 | cTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACTGTTATCAGGAAGGTATcgc < 2:317023/149‑1 (MQ=255)cTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTATCAGGAAGGTATcgc < 1:324783/149‑1 (MQ=255) aGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTATCAGGAAGGTATCGCGCTGGAt > 1:593261/1‑149 (MQ=255) 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cGGTTATCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCAtcatca < 1:3960262/149‑1 (MQ=255) gTTATCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCaaa > 1:854091/1‑149 (MQ=255) ttATCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAAc < 2:2550626/149‑1 (MQ=255) aTCAGGAAGGTATCGCGCTTGATGTGAACTGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCACACCGTTCACCTCCTCCGCGATGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTg < 2:1492048/149‑1 (MQ=255) aTCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTg < 2:2936084/149‑1 (MQ=255) 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aTCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTGGCGAAAGAGCt < 1:2674109/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTGGCGAAAGAGCTgg < 1:3536579/149‑1 (MQ=255) | CTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTATCAGGAAGGTATCGCGCTGGATGTGAACGGTTATATCTCTGAAGGCGCAGGCGAAAACCTGTTTGAAGTGAAAGATGGTGTGCTGTTCACCCCACCGTTCACCTCCTCCGCGCTGCCGGGTATTACCCGTGATGCCATCATCAAACTGGCGAAAGAGCTGG > CP009273/3946249‑3946543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |