Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,261,049 | G→T | 6.1% | V917V (GTC→GTA) | uvrA ← | ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,261,049 | 0 | G | T | 6.1% | 1172.9 / 29.4 | 303 | V917V (GTC→GTA) | uvrA | ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (147/137); new base T (6/13); total (153/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
ACTGCCGGAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAA > CP009273/4260903‑4261197 | aCTGCCGGAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGAc > 2:1666280/1‑149 (MQ=255) tGCCGGAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGa > 1:1620594/1‑149 (MQ=255) cGGAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGa > 1:930436/1‑149 (MQ=255) agaaAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGAtctc < 1:3163739/149‑1 (MQ=255) gaaAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTcg > 2:621891/1‑149 (MQ=255) aaCGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTcgccgc > 2:373442/1‑149 (MQ=255) aCGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCgccgcc < 1:3394689/149‑1 (MQ=255) cGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGcca > 1:2012669/1‑149 (MQ=255) cGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGcca > 1:2605620/1‑149 (MQ=255) aaTTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCcaccac < 1:3137653/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTgc < 2:1286586/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTgcc > 1:1430583/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTgccgc > 2:3517296/1‑149 (MQ=255) ggTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTgccgcc > 1:1651374/1‑149 (MQ=255) gCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTc > 2:4197103/1‑149 (MQ=255) gCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTc < 1:654497/149‑1 (MQ=255) aCTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTgg > 2:3139240/1‑149 (MQ=255) ctctGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGt < 1:1047109/149‑1 (MQ=255) tctGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTc > 1:793107/1‑149 (MQ=255) gAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCa < 1:492122/149‑1 (MQ=255) aaGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAgg > 1:4633372/1‑149 (MQ=255) ggAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTc < 1:2515358/149‑1 (MQ=255) ggAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTc > 2:294838/1‑149 (MQ=255) ggAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTc > 1:4722951/1‑149 (MQ=255) aaaaGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGa > 1:4141662/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACaa > 2:828644/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAAt < 2:1160293/149‑1 (MQ=255) cGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCa < 2:951086/149‑1 (MQ=255) tCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTc < 1:1960526/149‑1 (MQ=255) cAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCa < 1:713729/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGc > 2:1988875/1‑149 (MQ=255) gAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGc > 2:2380989/1‑149 (MQ=255) aaaGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCg > 1:113654/1‑149 (MQ=255) aaaGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCg > 1:1671228/1‑149 (MQ=255) aaaGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCg < 1:3192410/149‑1 (MQ=255) aaGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCgg < 1:3843313/149‑1 (MQ=255) aGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGt > 2:2082186/1‑149 (MQ=255) gCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCGTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGGGTCTGGCGGACCGGAGACGAGGAGCGCGCCGCCACCACGGCCGCCGTCGGGGCCCAGGTCGACAATCCCGTCCGCgggg > 2:4382428/1‑147 (MQ=255) cTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGAt < 2:4325160/149‑1 (MQ=255) cTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGAt < 2:367811/149‑1 (MQ=255) tAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCa > 1:1856284/1‑149 (MQ=255) tAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCa > 1:2318291/1‑149 (MQ=255) aaCGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCAc < 1:2800659/149‑1 (MQ=255) aaCGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCAc > 1:3037410/1‑149 (MQ=255) cGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGt > 2:1908419/1‑149 (MQ=255) cGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGt < 2:4237684/149‑1 (MQ=255) cGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGt < 2:1337478/149‑1 (MQ=255) cGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGt < 2:1430900/149‑1 (MQ=255) tACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCgag > 1:4426586/1‑149 (MQ=255) aCAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCgaga < 1:2205210/149‑1 (MQ=255) cAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGAt < 2:4148399/149‑1 (MQ=255) cTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCaa < 2:1765780/149‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAAt < 2:3630882/149‑1 (MQ=255) aaGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATca > 2:3429801/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATca > 2:2293837/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATca > 1:3819486/1‑149 (MQ=255) aGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATcac < 2:2478678/149‑1 (MQ=255) aaGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATcaccac > 2:222940/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACcaca > 1:3944889/1‑149 (MQ=255) gCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGgt < 1:2704287/149‑1 (MQ=255) cGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGgtgt < 2:452424/149‑1 (MQ=255) tgtgtgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTg < 1:3283390/149‑1 (MQ=255) gtgtgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGc < 2:668087/149‑1 (MQ=255) gtgtgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGc > 1:2398584/1‑149 (MQ=255) gtgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGccc < 1:4194698/149‑1 (MQ=255) gtgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGccc < 1:885679/149‑1 (MQ=255) gtgATGCGTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGccc < 1:3291609/149‑1 (MQ=255) tgATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCt > 2:2444216/1‑149 (MQ=255) aTGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGa < 1:3532634/149‑1 (MQ=255) aTGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGa < 1:4224316/149‑1 (MQ=255) tGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGAt < 2:2605620/149‑1 (MQ=255) gCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATc > 1:3579175/1‑149 (MQ=255) cTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATcg > 2:1067735/1‑149 (MQ=255) ttCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATcgc > 2:2008855/1‑149 (MQ=255) ttCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATcgc > 2:2552009/1‑149 (MQ=255) gCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCa < 2:1620594/149‑1 (MQ=255) cACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAg < 1:4465702/149‑1 (MQ=255) cACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAg < 1:2135547/149‑1 (MQ=255) aCTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGt > 1:1319342/1‑149 (MQ=255) tCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGttt < 1:1556400/149‑1 (MQ=255) tCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGttt > 2:3223324/1‑149 (MQ=255) tCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGttt < 1:2444897/149‑1 (MQ=255) ccGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGATACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTa < 2:1777941/149‑1 (MQ=255) ccGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTa < 2:4474152/149‑1 (MQ=255) cgcgACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTAt < 2:2680789/149‑1 (MQ=255) cgACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGc > 2:2765395/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAg > 2:2627859/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAg > 1:2847492/1‑149 (MQ=255) tACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGt > 1:1210395/1‑149 (MQ=255) tACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGt > 2:3524735/1‑149 (MQ=255) tACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGt > 2:1136085/1‑149 (MQ=255) aCCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGtt > 2:3816963/1‑149 (MQ=255) aCCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGtt < 1:1596652/149‑1 (MQ=255) cGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGc < 1:1590462/149‑1 (MQ=255) cGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGc < 2:2389671/149‑1 (MQ=255) cGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCAACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGc < 2:3929721/149‑1 (MQ=255) ggAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCt > 1:3754848/1‑149 (MQ=255) gagaCGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTg > 1:3383746/1‑149 (MQ=255) gagaCGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTg > 1:3978377/1‑149 (MQ=255) agaCGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGa < 2:1076058/149‑1 (MQ=255) | ACTGCCGGAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAA > CP009273/4260903‑4261197 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |