Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,528,263 | A→T | 7.0% | V107E (GTA→GAA) | nanM ← | N‑acetylneuraminic acid mutarotase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,528,263 | 0 | A | T | 7.0% | 958.4 / 47.9 | 298 | V107E (GTA→GAA) | nanM | N‑acetylneuraminic acid mutarotase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (121/155); new base T (7/14); total (129/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TTCAAAATAGCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCTTTGGCCTG > CP009273/4528115‑4528411 | ttCAAAATAGCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTa > 1:3486671/1‑149 (MQ=255) aaaTAGCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTc < 1:1117491/149‑1 (MQ=255) gCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTaa < 1:598673/149‑1 (MQ=255) gCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTaa > 1:3457751/1‑149 (MQ=255) cATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAAt > 2:4575100/1‑149 (MQ=255) aTTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATa < 2:3466793/149‑1 (MQ=255) aTTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATa < 1:4285924/149‑1 (MQ=255) ttGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATAc < 2:1184818/149‑1 (MQ=255) ttGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATAc > 1:3403445/1‑149 (MQ=255) gAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCt > 2:4048604/1‑149 (MQ=255) gAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCt < 2:1263608/149‑1 (MQ=255) gAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCt < 2:682021/149‑1 (MQ=255) gATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATACCTGAg < 1:2937677/149‑1 (MQ=255) gATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAg > 2:1219164/1‑149 (MQ=255) gATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAg < 1:409589/149‑1 (MQ=255) atatTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGt < 2:1653030/149‑1 (MQ=255) tatTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTc < 1:4335171/149‑1 (MQ=255) cTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCAACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGc < 1:1533108/149‑1 (MQ=255) ggTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGccc > 2:3315889/1‑149 (MQ=255) gTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCt < 2:233662/149‑1 (MQ=255) aaCACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGc > 1:756575/1‑149 (MQ=255) caccacCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTg < 1:2542318/149‑1 (MQ=255) caccacCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTg < 1:1484645/149‑1 (MQ=255) caccacCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTg > 1:1969124/1‑149 (MQ=255) ccaccaGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGtt < 2:2222345/149‑1 (MQ=255) ccaccaGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGtt < 2:1389862/149‑1 (MQ=255) accaGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGtttt < 1:682706/149‑1 (MQ=255) aGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGc > 1:935066/1‑149 (MQ=255) aGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGc < 2:3673809/149‑1 (MQ=255) aaCATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCaa < 2:4709333/149‑1 (MQ=255) aCATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAAt < 2:1817682/149‑1 (MQ=255) aTAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATgc < 1:3582942/149‑1 (MQ=255) aTAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATgc > 2:724439/1‑149 (MQ=255) tAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATgcc > 2:4382544/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTGTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATgccgc > 1:2262014/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATgccgcc > 1:277576/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCaaa > 1:3247354/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAaca > 2:3940282/1‑149 (MQ=255) ttGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATa > 1:3254610/1‑149 (MQ=255) gtgtACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACa < 2:143609/149‑1 (MQ=255) aaaaGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGc < 1:39582/149‑1 (MQ=255) aaaGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGcc > 1:3106388/1‑149 (MQ=255) aaaGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGcc < 2:1935428/149‑1 (MQ=255) aaGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCa < 1:957208/149‑1 (MQ=255) aGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCAt < 1:792226/149‑1 (MQ=255) gTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATc < 1:3675422/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCaa < 2:1110970/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCaa < 1:3366287/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGCGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCaa > 2:580251/1‑149 (MQ=255) aTGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATaa > 2:3550851/1‑149 (MQ=255) tGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATaaa < 2:3617289/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATaaa < 1:2723481/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATaaa > 2:2598823/1‑149 (MQ=255) ggCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAAt > 2:4262355/1‑149 (MQ=255) cccGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGc > 1:3717188/1‑149 (MQ=255) cGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTCACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCag < 1:1410318/149‑1 (MQ=255) gCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCaga > 1:455171/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCagag > 2:1778088/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCagag < 1:4382639/149‑1 (MQ=255) cATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTTCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAgg < 1:522525/149‑1 (MQ=255) aTGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGt < 2:3365223/149‑1 (MQ=255) cccATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGc < 1:4048604/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCt > 2:3251989/1‑149 (MQ=255) ccATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCt < 1:4695359/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCt < 1:1669989/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGAAGAGGTTGCt < 1:4156791/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTg < 1:1562085/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTg < 2:3518123/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGAtc < 1:3005225/149‑1 (MQ=255) gcgcGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGAtct < 1:1245174/149‑1 (MQ=255) gTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTg < 1:2845847/149‑1 (MQ=255) tGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTgg < 2:4127175/149‑1 (MQ=255) cATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGc > 1:2003300/1‑149 (MQ=255) cATCAATATAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTTCTTGATCTCTTGGTCCga > 2:2840612/1‑148 (MQ=255) tCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCa < 1:332920/149‑1 (MQ=255) aaTTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTCCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTGTTTGCCAATGCCGCCCAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAgg > 2:2519378/1‑149 (MQ=255) aTTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAggg < 1:989805/149‑1 (MQ=255) aTTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTATTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAACAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAggg < 2:4351580/149‑1 (MQ=255) aaCCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATg > 1:4754427/1‑149 (MQ=255) aCCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGc > 2:3034275/1‑149 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCa < 2:2467110/149‑1 (MQ=255) ccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAg > 1:3881912/1‑149 (MQ=255) ccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAg > 1:2533774/1‑149 (MQ=255) ccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAg > 1:2171863/1‑149 (MQ=255) cAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGc < 2:4782691/149‑1 (MQ=255) cAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGc > 2:1975012/1‑149 (MQ=255) aaCTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCt < 2:3890873/149‑1 (MQ=255) tATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAAc < 2:1555839/149‑1 (MQ=255) ttttGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCATCTAACGCTGTc > 2:2754773/1‑149 (MQ=255) tGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCAt < 1:1158550/149‑1 (MQ=255) gggTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCAttt < 2:28012/149‑1 (MQ=255) gTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCAttttt < 1:2462735/149‑1 (MQ=255) tGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTa < 1:2410047/149‑1 (MQ=255) gTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTAt < 1:187986/149‑1 (MQ=255) tATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGAAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATc > 1:1475223/1‑149 (MQ=255) aTTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCt > 1:535204/1‑149 (MQ=255) tttGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCtt > 1:298216/1‑149 (MQ=255) ttGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCttt < 2:2545128/149‑1 (MQ=255) tACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCTTTGGCCt < 2:812332/149‑1 (MQ=255) aCGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTCTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCTTTGGCCtg > 1:4106439/1‑149 (MQ=255) | TTCAAAATAGCCATTGAAGATATTCTGGTTAACACCACCAGTAACATAAGCCTTGCCGTTGTGTACAAAAGTCACATGGCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGGTCCGCCAGGGAATGCAGCTAACGCTGTCCATTTTTTATCTTTGGCCTG > CP009273/4528115‑4528411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |