| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 518,321 | A→T | 7.4% | intergenic (+35/‑396) | ybbP → / → rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs family putative polymorphic toxin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 518,321 | 0 | A | T | 7.4% | 824.0 / 43.4 | 264 | intergenic (+35/‑396) | ybbP/rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs family putative polymorphic toxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (111/133); new base T (5/15); total (116/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
GATTGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATA > CP009273/518174‑518468 | gATTGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAAc < 1:4177328/149‑1 (MQ=255) aTTGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACg > 2:2803485/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACGGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACg > 1:2330147/1‑149 (MQ=255) ttGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCGGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGc > 1:3974205/1‑149 (MQ=255) gtgGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCt < 2:1602975/149‑1 (MQ=255) tgGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCtt < 2:1252315/149‑1 (MQ=255) tgGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCGGGCGGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCCGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGGTCTGGTTGAATGGAACGccgt > 1:1460490/1‑147 (MQ=255) tgGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTAGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCtt > 1:1777245/1‑149 (MQ=255) tgGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTAGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCtt > 1:4166020/1‑149 (MQ=255) gATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGt < 2:1904895/149‑1 (MQ=255) gATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGt < 1:223755/149‑1 (MQ=255) ttGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGttt < 2:3647285/149‑1 (MQ=255) tGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTa < 1:2037490/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTaaa < 2:1074102/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTaaa < 1:2533088/149‑1 (MQ=255) tCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAaat < 2:2646323/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAaatt < 2:2712490/149‑1 (MQ=255) tGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGGTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAaatta > 2:3691240/1‑149 (MQ=255) ccGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAaattaat < 2:3999830/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTc < 2:863411/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCGGGGTGCGCGCCGGGTTAAGGGTAAGGCGCGGGTCAGGCCGGTTGGGGGGGGGTGAGAGTAAATAAGGGGCGGGCTGGGTGGAGGGAACGCCGTGTTTAAATTAATTc > 1:3256540/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCGTTTCGGCGGCTGGGTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCGGTTCAGGCCGGTTGCGGGGGGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTc > 2:1240658/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTa < 1:1489083/149‑1 (MQ=255) aGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGGTCAGGCAGGTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGGTCGGGTTGAATGGAACGCCGTGTTTAAATTAATTATACa > 2:1547252/1‑149 (MQ=255) gCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGTTGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACaa > 1:1164718/1‑149 (MQ=255) gCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACaa < 2:2746082/149‑1 (MQ=255) gCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACaa > 2:768986/1‑149 (MQ=255) gCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGGTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGGTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACaa > 2:2125891/1‑149 (MQ=255) ggAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAata < 1:4786144/149‑1 (MQ=255) gctgTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTTATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTAATtga > 2:1033081/1‑149 (MQ=255) gctgTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATtga < 2:3500469/149‑1 (MQ=255) ctgTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATtgat < 1:1882392/149‑1 (MQ=255) ctgTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATtgat < 1:3544731/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGatgatg < 1:428103/149‑1 (MQ=255) gCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGt > 2:3007395/1‑149 (MQ=255) ttttCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTa < 2:1482540/149‑1 (MQ=255) ttttCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTa < 1:943802/149‑1 (MQ=255) ggcggcTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGaa < 2:2817665/149‑1 (MQ=255) gcggcTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAAt < 1:1380986/149‑1 (MQ=255) gctggctgGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTgg < 2:3368789/149‑1 (MQ=255) gctggctgGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTgg < 1:302438/149‑1 (MQ=255) ctggctggGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGt < 1:2750966/149‑1 (MQ=255) gctggGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGAt < 2:3170549/149‑1 (MQ=255) ctggGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGAtt < 1:4439732/149‑1 (MQ=255) gggTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTc < 1:1239146/149‑1 (MQ=255) gggTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTc > 1:4697785/1‑149 (MQ=255) gggTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTc > 2:1896334/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTcc > 2:2559091/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCt > 2:320119/1‑149 (MQ=255) gcgcGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTAt < 2:4244182/149‑1 (MQ=255) cgcgACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATc < 1:2112672/149‑1 (MQ=255) gcgAATGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGTTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCt < 1:3399946/149‑1 (MQ=255) cgACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCtt < 2:497212/149‑1 (MQ=255) gACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCttt < 2:386025/149‑1 (MQ=255) aCTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTc < 1:4250287/149‑1 (MQ=255) cTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCt > 1:4322430/1‑149 (MQ=255) tGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTAAAATATGTTTCATTTATGATGTTATTGAATTGGTGATTTACTATATTTCTa > 2:4291176/1‑149 (MQ=255) ttAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTg < 1:2907457/149‑1 (MQ=255) aaGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCt > 2:3774115/1‑149 (MQ=255) gggTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGa > 2:2300265/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATAtt < 2:3389364/149‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATAtt < 2:2735054/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTTGTGATTTCCTATCTTTCTATTGATGATATTaa > 2:4390515/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTaa < 2:4152352/149‑1 (MQ=255) gcTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGGTGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCt > 1:3791476/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGaa < 1:2395714/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAAt < 2:4453478/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAAt < 2:4192291/149‑1 (MQ=255) cAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCg < 2:2201878/149‑1 (MQ=255) ggCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGt > 1:3460564/1‑149 (MQ=255) gCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTg < 1:1684337/149‑1 (MQ=255) gTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAg > 2:534136/1‑149 (MQ=255) tttGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGt < 1:201316/149‑1 (MQ=255) tttGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGt < 2:2850675/149‑1 (MQ=255) tttGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGt < 2:457733/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGttt < 2:1429152/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGGTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGttt < 1:239472/149‑1 (MQ=255) cGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTAt < 1:1488013/149‑1 (MQ=255) gggTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTg > 1:162013/1‑149 (MQ=255) ggTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGa < 2:442968/149‑1 (MQ=255) gTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGAt < 1:3110433/149‑1 (MQ=255) atgaGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGAtttt > 2:3059125/1‑149 (MQ=255) gagaGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTaa < 2:4111277/149‑1 (MQ=255) gagaGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTaa > 1:2610986/1‑149 (MQ=255) gagTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTaatt > 2:2422666/1‑147 (MQ=255) gTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAatat < 1:4651043/149‑1 (MQ=255) aaTAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAga > 2:3516535/1‑148 (MQ=255) aaTAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGc > 2:2018937/1‑149 (MQ=255) aTAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATTTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATATcc > 1:2847138/1‑149 (MQ=255) tAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGccc < 1:4035605/149‑1 (MQ=255) ggggCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTTAATTGGTGATTTCATATCTTTATATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATATCCCTAc > 2:2074876/1‑149 (MQ=255) gggCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACa < 2:3479484/149‑1 (MQ=255) gggCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACa > 2:3348498/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATaa < 1:4385621/149‑1 (MQ=255) tGGTTGAATGGATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAAc > 2:1807350/1‑149 (MQ=255) ggATCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACtaa < 1:1354478/149‑1 (MQ=255) ggAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACtaa > 2:357740/1‑149 (MQ=255) ggAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACtaa < 1:2927214/149‑1 (MQ=255) gAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACtaat < 1:1708957/149‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGACCTACAAAAATAACTCAGACtaata > 2:1290163/1‑149 (MQ=255) | GATTGTGGATTGTTCTGCCGTGCAGCGGAGCGCTGCTGCTGTCGCTTTTCGGCGGCTGGCTGGGTGCGCGACTGGTTAAGGGTAAGGCGCTGTTCAGGCAGTTTGCGGGGTGATGAGAGTAAATAAGGGGCGTTCTGGTTGAATGGAACGCCTTGTTTAAATTAATTCTACAATATGTTTCATTGATGATGTTATTGAATTGGTGATTTCCTATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATA > CP009273/518174‑518468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |