| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 732,494 | G→T | 100% | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL → | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 732,494 | 0 | G | T | 99.3% | 1006.0 / ‑2.1 | 295 | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (187/106); total (187/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
AGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAG > CP009273/732348‑732639 | cATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATAc > 2:3323568/1‑149 (MQ=255) cATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAAATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATAc < 2:1819000/149‑1 (MQ=255) aTAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAAATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACt > 1:1897470/1‑149 (MQ=255) tAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTa > 1:4231877/1‑149 (MQ=255) tAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAAATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTa < 1:910975/149‑1 (MQ=255) aaTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTAtt < 1:3633792/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCa > 2:1138029/1‑149 (MQ=255) ggCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGt > 1:541300/1‑149 (MQ=255) ggCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGt < 1:709981/149‑1 (MQ=255) gCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGtt < 1:3202702/149‑1 (MQ=255) gCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGtt < 1:2464932/149‑1 (MQ=255) aTCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGt < 1:3478277/149‑1 (MQ=255) tCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTa < 2:3459704/149‑1 (MQ=255) tCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTa < 1:3164497/149‑1 (MQ=255) tCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTa > 1:3051922/1‑149 (MQ=255) tCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTa > 2:4130354/1‑149 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTAt < 2:60199/149‑1 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTAt > 2:417408/1‑149 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTCCACTATACTATTGCCAGAGTTGTAt < 2:4019515/149‑1 (MQ=255) tactaTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATcc > 2:1684265/1‑149 (MQ=255) ctaTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGACAGAGTTGTATCCTg > 2:2836297/1‑149 (MQ=255) taTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGt < 2:22775/149‑1 (MQ=255) taTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGt > 1:2354136/1‑149 (MQ=255) aTTGTCTATTTTTGACGTTATTTCTGTTGAAGATAGTTGTTAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAAAACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTTAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTa < 2:2114982/149‑1 (MQ=14) aTTGACTATTATTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTa < 2:2260002/149‑1 (MQ=255) ttGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTAt > 1:1398482/1‑149 (MQ=255) tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAAATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATc > 1:2726641/1‑149 (MQ=255) gACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCa > 1:2867644/1‑149 (MQ=255) gACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCa < 1:3159676/149‑1 (MQ=255) aCTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAg > 2:4036910/1‑149 (MQ=255) cTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGt > 2:876966/1‑149 (MQ=255) aTTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTcc > 2:4572356/1‑149 (MQ=255) tttttGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCt > 2:3091160/1‑149 (MQ=255) cGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt > 1:2926196/1‑149 (MQ=255) gTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAtt > 1:1120958/1‑149 (MQ=255) tATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGt < 1:494411/123‑1 (MQ=17) aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCa > 2:4162742/1‑149 (MQ=255) aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCa > 2:984365/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAg < 1:1455542/149‑1 (MQ=255) tGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCt > 2:2505781/1‑149 (MQ=255) gAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTttat < 1:1284597/149‑1 (MQ=255) aaaGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTttatt < 2:845090/149‑1 (MQ=255) aGTTGGGAAAATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTaa > 2:1060566/1‑149 (MQ=255) gTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAAc > 1:4051179/1‑149 (MQ=37) ttGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACt > 2:726644/1‑149 (MQ=37) gggAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTgg > 1:4075668/1‑149 (MQ=37) gggAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTgg > 1:3949837/1‑149 (MQ=37) gATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCg > 1:1648143/1‑149 (MQ=37) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGt < 2:460302/149‑1 (MQ=37) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGa > 1:186228/1‑149 (MQ=37) agagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAtt > 1:3707315/1‑149 (MQ=38) gagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTg > 1:4628544/1‑149 (MQ=255) aTTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCAt > 2:376781/1‑149 (MQ=255) ggggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtcatc < 1:2758606/149‑1 (MQ=255) ggggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtcatc > 2:1224000/1‑149 (MQ=255) gggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtcatca > 2:3960855/1‑149 (MQ=255) ggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaa < 2:3358706/149‑1 (MQ=255) gAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATTCGTGATTGCCATTCATCaaa > 1:920074/1‑149 (MQ=255) gAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTTCCATTCATCaaa < 2:4474141/149‑1 (MQ=255) gAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 2:2428503/1‑149 (MQ=255) aaaCACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAAt < 2:2296017/149‑1 (MQ=255) acacATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGa < 2:2073584/149‑1 (MQ=255) acaTCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATa < 1:3032606/149‑1 (MQ=255) aTCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGATAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATaaa < 2:524741/149‑1 (MQ=255) tctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAg < 1:1683587/149‑1 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa < 1:430518/149‑1 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa > 2:1569958/1‑149 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa > 2:3216445/1‑149 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa < 2:1971425/149‑1 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa < 2:4360633/149‑1 (MQ=255) gATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGt < 2:2728664/149‑1 (MQ=255) gATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGt < 2:2350858/149‑1 (MQ=255) aTTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTc > 1:1944669/1‑149 (MQ=255) tttCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCa < 1:1526994/149‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCa > 1:3691763/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGc > 1:1169799/1‑149 (MQ=255) aGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAAtt < 1:4515487/149‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTg < 1:2203823/149‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGACATTGCAATTg > 2:406390/1‑149 (MQ=255) atatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATg < 2:2954738/149‑1 (MQ=21) tatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATgg > 2:275641/1‑149 (MQ=255) tatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATgg > 1:4148352/1‑149 (MQ=255) ggTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaa > 2:4771438/1‑149 (MQ=255) gTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaa > 1:2143196/1‑149 (MQ=255) gTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaa > 1:3791878/1‑149 (MQ=255) tGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaaa > 1:958476/1‑149 (MQ=255) tGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTAACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaaa > 1:1358279/1‑149 (MQ=255) aTTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACg > 1:2975693/1‑149 (MQ=255) ttttGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTGTTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGc > 1:2105673/1‑149 (MQ=255) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTc < 1:327237/149‑1 (MQ=255) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTc < 2:4670210/149‑1 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCg > 2:425627/1‑149 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCg > 2:2594869/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGc > 2:2940434/1‑149 (MQ=255) tGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAct < 2:1398482/149‑1 (MQ=255) gTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct < 1:3902355/149‑1 (MQ=255) gTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACaa < 2:3602711/149‑1 (MQ=255) gTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACaa < 1:3547519/149‑1 (MQ=255) ttCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAag > 1:3349451/1‑149 (MQ=255) tCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAaga > 2:2886653/1‑149 (MQ=255) | AGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAG > CP009273/732348‑732639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |