| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 767,399 | A→T | 81.1% | E162D (GAA→GAT) | cydA → | cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 767,399 | 0 | A | T | 81.1% | 707.9 / 158.7 | 291 | E162D (GAA→GAT) | cydA | cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/27); new base T (113/123); total (141/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |