Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 832,445 | G→T | 100% | P213P (CCG→CCT) | ybiC → | putative dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 832,445 | 0 | G | T | 98.4% | 1047.0 / 5.9 | 311 | P213P (CCG→CCT) | ybiC | putative dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base T (154/152); total (157/154) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
TTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTAC > CP009273/832299‑832590 | ttCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctac < 1:1070608/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctacga < 2:1838732/149‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCtacgac > 2:617147/1‑149 (MQ=255) tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTAAACGGCGTGCCtacgac > 2:2044118/1‑149 (MQ=255) tgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCa < 2:1937694/149‑1 (MQ=255) tgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAAt > 2:3564898/1‑149 (MQ=255) tgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAAt > 1:3787392/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATc > 1:4066023/1‑149 (MQ=255) gTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATcc < 2:2771531/149‑1 (MQ=255) tttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcgg > 1:749129/1‑149 (MQ=255) cccTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggcgg > 1:932787/1‑149 (MQ=255) ccTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGt < 2:3198643/149‑1 (MQ=255) tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGc > 1:1630485/1‑149 (MQ=255) tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGc < 1:1812511/149‑1 (MQ=255) tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGc < 1:2673352/149‑1 (MQ=255) aaGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAg > 2:4451045/1‑149 (MQ=255) aaGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAg > 1:1494180/1‑149 (MQ=255) aGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCTAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAgg > 2:1162973/1‑149 (MQ=255) tAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt < 1:2324498/149‑1 (MQ=255) tAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt < 2:688814/149‑1 (MQ=255) aaTGTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTc < 2:3698745/149‑1 (MQ=255) tttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGc > 1:1108459/1‑149 (MQ=255) tCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCg > 1:4740816/1‑149 (MQ=255) cccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGt < 1:2176822/149‑1 (MQ=255) cGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTg > 2:4658704/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTg < 1:2412778/149‑1 (MQ=255) cGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTg < 1:3519405/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTgg > 1:302637/1‑149 (MQ=255) tGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGt > 2:3724599/1‑149 (MQ=255) tGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGt > 1:3698632/1‑149 (MQ=255) gTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGtt > 2:3017622/1‑149 (MQ=255) gTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGtt < 2:3260020/149‑1 (MQ=255) ttGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTc > 2:1443671/1‑149 (MQ=255) cTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCt < 1:2668769/149‑1 (MQ=255) 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gCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCtt < 2:2686372/149‑1 (MQ=255) caccaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTg > 1:3574002/1‑149 (MQ=255) accaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGc < 1:528556/149‑1 (MQ=255) ccaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGcc > 2:2588285/1‑149 (MQ=255) aGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGa > 2:2062719/1‑149 (MQ=255) gcgcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGaa > 2:859387/1‑149 (MQ=255) gcgcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGaa > 1:117910/1‑149 (MQ=255) ccATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACAt < 1:4579082/149‑1 (MQ=255) cATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa < 1:3534170/149‑1 (MQ=255) aTTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATaa > 2:338365/1‑149 (MQ=255) aTTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATaa < 1:4636554/149‑1 (MQ=255) aTTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATaa < 1:2768323/149‑1 (MQ=255) cATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGc > 2:4403689/1‑149 (MQ=255) cATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGc < 1:933944/149‑1 (MQ=255) cATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGc < 2:816366/149‑1 (MQ=255) aTTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCt < 2:1586575/149‑1 (MQ=255) aTTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCt > 2:2599825/1‑149 (MQ=255) ggCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGc > 1:3591150/1‑149 (MQ=255) aaaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCt < 2:4225836/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGc < 1:882571/149‑1 (MQ=255) 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cGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAtgt < 1:646029/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAtgtg < 2:2438796/149‑1 (MQ=255) tGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGa < 1:3908380/149‑1 (MQ=255) ggCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGaa > 2:1409409/1‑149 (MQ=255) gCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGaaa > 1:57964/1‑149 (MQ=255) 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cccGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGgc > 1:2612374/1‑149 (MQ=255) cGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGgcgc < 2:1074293/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCtt < 2:2526933/149‑1 (MQ=255) gccgccAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCttt < 2:464609/149‑1 (MQ=255) gccAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCcg > 2:3399594/1‑149 (MQ=255) 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gCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTAc < 1:1042015/149‑1 (MQ=255) | TTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTAC > CP009273/832299‑832590 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |