Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 102,964 | 0 | T | C | 7.6% | 1010.2 / 56.6 | 315 | intergenic (+21/‑80) | ftsZ/lpxC | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein/UDP‑3‑O‑acyl N‑acetylglucosamine deacetylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (132/157); new base C (15/9); total (149/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
ATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGCATTCCTGCGTAAGCAAGCTGATTAAGAATTGACTGGAATTTGGGTTTCGAGGCTCTTTGTGCTAAACTGGCCCGCCGAATGTATAGTACACTTCGGTTGGATAGGTAATTTGGCGAGATAATACGATGATCAAACAAAGGACACTTAAACGTATCGTTCAGGCGACGGGTGTCGGTTTACATACCGGCAAGAA > CP009273/102816‑103111 | aTGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGCATTCCTGCGTAAGCAAGCTGATTAAGAATTGACTGGAATTTGGGtt < 2:4417239/149‑1 (MQ=255) tGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGCATTCCTGCGTAAGCAAGCTGATTAAGAATTGACTGGAATTTGGGttt > 2:4530118/1‑149 (MQ=255) ggATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGCATTCCTGCGTAAGCAAGCTGATTAAGAATTGACTGGAATTTGGGTTTCg < 2:1798710/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |