| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,320,402 | C→T | 5.1% | P467L (CCA→CTA) | yciQ → | enhancer of membrane protein expression; putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,320,402 | 0 | C | T | 5.1% | 996.8 / 25.4 | 274 | P467L (CCA→CTA) | yciQ | enhancer of membrane protein expression; putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (145/114); new base T (7/7); total (153/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
GTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAAAGTTT > CP009273/1320254‑1320550 | gTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTAcc < 1:3899679/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCAc < 2:4068071/149‑1 (MQ=255) ggCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACt > 2:390748/1‑149 (MQ=255) ggCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACt > 2:3440440/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGa < 1:4093157/149‑1 (MQ=255) gggCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGC‑TTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGAttt < 2:1484230/149‑1 (MQ=255) cAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGAAAAGCGTTGCTTTAATCGTTTAATCATCACTTTTTTTTTAAAAATGATTTGt > 1:2437911/1‑149 (MQ=255) aGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGtt < 1:1828863/149‑1 (MQ=255) ggAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTc > 1:2814798/1‑149 (MQ=255) ggAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTc < 2:4483564/149‑1 (MQ=255) gAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCa > 1:3353052/1‑149 (MQ=255) gAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCa > 1:506303/1‑149 (MQ=255) tGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGc > 1:1589106/1‑149 (MQ=255) tGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGc > 1:2188382/1‑149 (MQ=255) gAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCg > 2:4701565/1‑149 (MQ=255) aGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGt < 2:2303002/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTGGGCGATATATTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTg > 1:1768024/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTgg > 1:1152633/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGc < 2:1648208/149‑1 (MQ=255) tggtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACATTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGcc < 1:135253/149‑1 (MQ=255) ggtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACTACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCt > 1:4124540/1‑149 (MQ=255) tggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTc < 2:93650/149‑1 (MQ=255) gggCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCt > 2:1722633/1‑149 (MQ=255) gCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTAt > 2:4286162/1‑149 (MQ=255) gATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtc < 2:1076888/149‑1 (MQ=255) tatGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctc < 2:1006189/149‑1 (MQ=255) tGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctctc > 2:2695715/1‑149 (MQ=255) tttATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTa > 1:1202041/1‑149 (MQ=255) tttATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTa > 1:3300512/1‑149 (MQ=255) tttATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTa > 2:3988743/1‑149 (MQ=255) ttattaTGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTAc < 1:86477/149‑1 (MQ=255) ttattaTGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTAc < 2:3221676/149‑1 (MQ=255) tattatGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACa < 1:3843108/149‑1 (MQ=255) atGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCaa > 2:3265068/1‑149 (MQ=255) atGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCaa < 2:4629165/149‑1 (MQ=255) atGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGGTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCaa < 1:2675557/149‑1 (MQ=255) aTCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGt < 1:3670200/149‑1 (MQ=255) ctgctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCg > 1:4263666/1‑149 (MQ=255) ctgctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCg < 2:652117/149‑1 (MQ=255) ctgctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCg < 2:2196099/149‑1 (MQ=255) gctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGga > 2:2053/1‑149 (MQ=255) gctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGGTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGga < 2:1955801/149‑1 (MQ=255) gATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATTTCGGAGATg > 1:2494493/1‑149 (MQ=255) attattCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGt > 1:1917250/1‑149 (MQ=255) ttattCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTa > 2:2083674/1‑149 (MQ=255) tattCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTAt > 2:824710/1‑149 (MQ=255) tattCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGAGTTAATCGTGTAATCATCACTTAGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGCAGATGTAt > 2:1070175/1‑149 (MQ=255) ttttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCtttt > 1:1095688/1‑149 (MQ=255) ttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTAc > 2:3449822/1‑149 (MQ=255) ttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTAc < 1:2826807/149‑1 (MQ=255) tATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTgg < 1:809291/149‑1 (MQ=255) tATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTgg > 2:136119/1‑149 (MQ=255) aTTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGt < 2:2461971/149‑1 (MQ=255) gTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACTACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATg > 1:423101/1‑149 (MQ=255) tCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGcc > 2:598676/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAg > 2:3115896/1‑149 (MQ=255) ttGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCg > 1:3567236/1‑149 (MQ=255) cTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACTACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCACTGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTa < 2:465708/149‑1 (MQ=255) ttttGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAt > 2:270385/1‑149 (MQ=255) tttgattgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCAATGATTTGGTCAGGCGTGGCCGACTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGAGGGATGCTTGTACTGGTATATGCCAGCGGGTAAtt > 2:1765641/1‑149 (MQ=255) ttgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAttt < 1:909070/149‑1 (MQ=255) gtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACTACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTa > 1:2591012/1‑149 (MQ=255) tttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTAc > 2:3687900/1‑149 (MQ=255) tgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCg > 2:2880255/1‑149 (MQ=255) cgATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGttt < 2:1427150/149‑1 (MQ=255) gatgatGACAAGCCGTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTg < 2:3648711/149‑1 (MQ=255) gatgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCt < 1:3274020/149‑1 (MQ=255) atgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTg > 1:3642276/1‑149 (MQ=255) tgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGa > 2:3031650/1‑149 (MQ=255) gaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGAc < 1:2179158/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCgg > 1:2234211/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCgg > 1:4716588/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGt > 1:2941545/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGt > 1:1699857/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTCTTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGtt > 1:4426321/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGtt > 1:3808015/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTa > 1:1866601/1‑149 (MQ=255) cTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTAt > 1:1456723/1‑149 (MQ=255) tGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTAtct < 2:2814798/149‑1 (MQ=255) tGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTAtct < 1:2520987/149‑1 (MQ=255) cGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACTACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCa < 1:1521106/149‑1 (MQ=255) gTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCAc > 1:2293985/1‑149 (MQ=255) ttAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCACTGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACt < 2:868728/149‑1 (MQ=255) ttAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACt < 1:3173881/149‑1 (MQ=255) ttAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACt > 1:2112359/1‑149 (MQ=255) gtAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATggg > 1:622217/1‑149 (MQ=255) tAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATgggg > 1:1508126/1‑149 (MQ=255) atcatcACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGta < 2:2571947/149‑1 (MQ=255) atcaCTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTatat > 1:2570730/1‑149 (MQ=255) ttttttttTAATACTGAATTGTTAAGGCGTGGCCTTATAATCTCTCTACAACAAATTAGGAGATGTATTATTTTACTGGTATATTACAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATATCACAGGCATTTGGTATAttttta > 2:1172520/1‑148 (MQ=255) ttGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCt < 1:683382/149‑1 (MQ=255) tttttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGcc > 2:3565823/1‑149 (MQ=255) tttttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGcc < 1:2751972/149‑1 (MQ=255) ttttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCa < 1:1954601/149‑1 (MQ=255) tttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCaa > 2:3796213/1‑149 (MQ=255) ttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCaaa > 2:4753528/1‑149 (MQ=255) ttACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCaaa < 2:793123/149‑1 (MQ=255) tactacTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAAAg > 2:1156196/1‑149 (MQ=255) ccACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAAAGtt > 2:296630/1‑149 (MQ=255) cACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAAAGttt > 2:52264/1‑149 (MQ=255) | GTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAAAGTTT > CP009273/1320254‑1320550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |