Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,503,324 | 0 | T | A | 10.5% | 925.6 / 76.3 | 310 | intergenic (‑3/‑219) | yncJ/hicA | uncharacterized protein/mRNA interferase toxin of the HicAB toxin‑antitoxin system |
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Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
GCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTATTTT > CP009273/1503177‑1503472 | gCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTg < 1:3789185/149‑1 (MQ=255) cAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGc > 1:1939956/1‑149 (MQ=255) ttCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCAc > 1:4034660/1‑149 (MQ=255) 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aCGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCACAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTgcg > 2:4731046/1‑149 (MQ=255) cTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCGTACCTTGTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGa < 2:3060028/149‑1 (MQ=255) cGTAAACAGCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGAttt < 1:2216279/149‑1 (MQ=255) gTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTa > 2:2660844/1‑149 (MQ=255) aaaCATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGt > 2:2501153/1‑149 (MQ=255) aCATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGc < 1:3571171/149‑1 (MQ=255) cATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCt > 2:121081/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTa < 2:4595507/149‑1 (MQ=255) aTCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTa < 1:3366151/149‑1 (MQ=255) tCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTGAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTAt > 1:3552669/1‑149 (MQ=255) cTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTAttt < 1:2200285/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTAttt < 2:1238736/149‑1 (MQ=255) | GCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATTCTGGAATCTTCCTTCCTGATTTTGCATTGCATTCTGCCGTTGCGGCGATTTAGTGCTATTTT > CP009273/1503177‑1503472 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |