| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,754,004 | 0 | G | T | 6.5% | 1143.7 / 30.2 | 297 | V259V (GTC→GTA) | sufS | cysteine desulfurase, stimulated by SufE; selenocysteine lyase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (122/155); new base T (10/10); total (132/165) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
ATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAGAATGCCAATTCCGGTGGGGCCATACAGTTTATGCCCGGAGAACACGTAAAAGTCGCAATCCAGCGCCTGAACATCCA > CP009273/1753857‑1754152 | cTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACgg > 2:2551746/1‑149 (MQ=255) cTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACgg > 2:399773/1‑149 (MQ=255) cTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACgg < 1:2221397/149‑1 (MQ=255) 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tGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAGAATGCCAATTCCGGTGGGGCCATACAGTTTATGCCCGGAGAACACGTAAAAGTCGCAATCCAGCGCCTGAACATcc > 1:4437248/1‑149 (MQ=255) gACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAGAATGCCAATTCCGGTGGGGCCATACAGTTTATGCCCGGAGAACACGTAAAAGTCGCAATCCAGCGCCTGAACATCCa < 2:4454901/149‑1 (MQ=255) | ATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAGAATGCCAATTCCGGTGGGGCCATACAGTTTATGCCCGGAGAACACGTAAAAGTCGCAATCCAGCGCCTGAACATCCA > CP009273/1753857‑1754152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |