Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,952,575 | T→C | 21.0% | intergenic (‑186/+202) | torY ← / ← cutC | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,952,575 | 0 | T | C | 21.0% | 543.0 / 153.5 | 250 | intergenic (‑186/+202) | torY/cutC | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/93); new base C (30/22); total (134/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GTATAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCA > CP009273/1952428‑1952723 | ttataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtt < 1:3786570/148‑1 (MQ=255) tataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGttt < 2:2995114/149‑1 (MQ=255) ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTCTTTAGAATATATATTTATCAGtttt > 1:3431112/1‑149 (MQ=255) ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtttt < 1:2159421/149‑1 (MQ=255) ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACGGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtttt < 2:300314/149‑1 (MQ=255) aaTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAg > 1:563726/1‑149 (MQ=255) aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGt < 2:1999586/149‑1 (MQ=255) aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGt < 1:1197372/149‑1 (MQ=255) aaaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGCATATATATTTTTCAGTTTTAGTGAt > 2:4686972/1‑149 (MQ=255) aaaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAAt > 2:2304843/1‑149 (MQ=255) tataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTa > 1:2535409/1‑149 (MQ=255) ataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaa < 2:717672/149‑1 (MQ=255) ataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTaa > 1:253863/1‑149 (MQ=255) taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaaa < 1:880285/149‑1 (MQ=255) taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaaa < 1:4315556/149‑1 (MQ=255) aaCGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc > 1:2826492/1‑149 (MQ=255) aCGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATccc < 1:2461362/149‑1 (MQ=255) gAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAt > 1:4782665/1‑149 (MQ=255) aTTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaa > 2:2765399/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaatta > 1:4670254/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCACAtaattaa > 2:4170998/1‑149 (MQ=255) gCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 2:2429730/149‑1 (MQ=255) gCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 2:373676/149‑1 (MQ=255) aTAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatat > 1:3331686/1‑149 (MQ=255) tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata < 2:1491890/149‑1 (MQ=255) tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata > 1:4471185/1‑149 (MQ=255) tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata > 1:2072130/1‑149 (MQ=255) aaTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatatat > 1:487175/1‑149 (MQ=255) aTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata < 2:1518065/149‑1 (MQ=255) aTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata > 1:3283731/1‑149 (MQ=255) ttAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATAc > 2:3983279/1‑149 (MQ=255) caacaCTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttt < 1:2876339/149‑1 (MQ=255) cacTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTa < 1:4087169/149‑1 (MQ=255) acggCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAg < 1:959298/146‑1 (MQ=255) tGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAAc < 1:1689398/149‑1 (MQ=255) gAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACg > 1:3455158/1‑149 (MQ=255) gAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACg > 1:1065976/1‑149 (MQ=255) aaaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGc < 1:3042437/149‑1 (MQ=255) aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCt > 1:392828/1‑149 (MQ=255) aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCt > 1:2021250/1‑149 (MQ=255) aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATGTTTAGCACAACGCt > 2:2534972/1‑149 (MQ=255) cAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTAt < 1:2691536/149‑1 (MQ=255) tAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACt > 1:4745833/1‑149 (MQ=255) aaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGt > 1:3507231/1‑149 (MQ=255) aaTATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCAc < 2:882248/149‑1 (MQ=255) aaTATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCAc < 1:493934/149‑1 (MQ=255) atGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCg > 1:753585/1‑149 (MQ=255) tGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGc < 1:437713/149‑1 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTATCTCAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCt > 2:4748393/1‑149 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCt > 1:1870255/1‑149 (MQ=255) aTTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTc > 1:1760867/1‑149 (MQ=255) ttattaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCaa > 1:300453/1‑149 (MQ=255) tattaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAAc < 2:58476/149‑1 (MQ=255) attaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCATCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACa < 1:922010/149‑1 (MQ=255) attaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACa > 2:1922408/1‑149 (MQ=255) aCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAt > 1:442809/1‑149 (MQ=255) aCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAt > 2:2932470/1‑149 (MQ=255) aTGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCAc < 2:465264/149‑1 (MQ=255) tAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGt > 2:1077337/1‑149 (MQ=255) aTCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTa < 2:1771239/149‑1 (MQ=255) tCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAt < 1:3913212/149‑1 (MQ=255) cATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtc > 2:2599590/1‑149 (MQ=255) cATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtc < 1:2939539/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttc > 2:3602154/1‑149 (MQ=255) aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:2747709/1‑149 (MQ=255) aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:1741991/1‑149 (MQ=255) aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:370164/1‑149 (MQ=255) ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt > 1:4612251/1‑149 (MQ=255) ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt < 2:4044720/149‑1 (MQ=255) ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt > 2:2382845/1‑149 (MQ=255) tGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATcgttcgtt > 2:3198281/1‑149 (MQ=255) aaGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGtttttt < 2:3402487/149‑1 (MQ=255) ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:2175907/149‑1 (MQ=255) ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:208073/149‑1 (MQ=255) ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 1:4220457/149‑1 (MQ=255) ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:2705363/149‑1 (MQ=255) ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:3331053/149‑1 (MQ=255) gAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtata < 1:1483928/149‑1 (MQ=255) aaTAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATAc < 2:253863/149‑1 (MQ=255) aTAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACt > 1:4461635/1‑149 (MQ=255) aCCCATTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGtt < 2:4545850/149‑1 (MQ=255) cccAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTc > 2:434529/1‑149 (MQ=255) cccAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTc < 2:2114209/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAg < 1:2244086/149‑1 (MQ=255) aGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTctgt > 2:3357896/1‑146 (MQ=255) ttGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGa > 1:2633866/1‑149 (MQ=255) ttGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGa > 2:1829622/1‑149 (MQ=255) tGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGAt < 2:1289132/149‑1 (MQ=255) gCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATa > 1:4517825/1‑149 (MQ=255) tAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATaaaaaaa > 2:1365480/1‑149 (MQ=255) gAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAgg > 2:3831726/1‑149 (MQ=255) gAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAgg > 2:3883887/1‑149 (MQ=255) tatatatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGccc < 2:4306236/149‑1 (MQ=255) tatatatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTAAGGGATAAAAAAAGGccc > 1:4030812/1‑149 (MQ=255) tatatTTATCATTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCt < 1:61022/149‑1 (MQ=255) tatatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCt > 1:2342676/1‑149 (MQ=255) tatatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCt > 1:4589236/1‑149 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAACACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGt < 1:3612525/149‑1 (MQ=255) tttATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTg > 1:320197/1‑149 (MQ=255) ttttAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCa > 2:126343/1‑149 (MQ=255) | GTATAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCA > CP009273/1952428‑1952723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |