| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,046,600 | G→T | 87.1% | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL ← | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,046,600 | 0 | G | T | 87.1% | 589.8 / 93.3 | 241 | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/11); new base T (97/113); total (117/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.20e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAA > CP009273/2046454‑2046747 | cGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAc < 2:2082050/149‑1 (MQ=255)cGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAc < 1:624499/149‑1 (MQ=255) gCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACt > 2:178196/1‑149 (MQ=255) tCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCt > 1:586729/1‑149 (MQ=255) ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaaa > 1:832803/1‑149 (MQ=255) cTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaat < 2:453659/149‑1 (MQ=255) tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt > 1:3166493/1‑149 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 2:2773149/1‑149 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat < 1:38633/149‑1 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAaattaat > 1:3657214/1‑149 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTATTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGAGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATATAGTATGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTACTAaattaat > 1:3158252/1‑149 (MQ=255) tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaatt > 1:1027165/1‑149 (MQ=255) tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaatt < 2:4402746/149‑1 (MQ=255) aaGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCg > 2:1329259/1‑149 (MQ=255) aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGa > 2:871301/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGtt > 2:2827403/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGtt > 2:3155949/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGtt < 2:1154529/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGtt < 2:4180170/149‑1 (MQ=255) cGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTa > 1:4510046/1‑149 (MQ=255) cGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACaa < 1:1205941/149‑1 (MQ=255) tACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAAtt < 2:1662051/149‑1 (MQ=255) tACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAAtt < 1:2294285/149‑1 (MQ=255) tACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAAtt < 1:2590494/149‑1 (MQ=255) ccGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaa > 1:3514273/1‑149 (MQ=255) cGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaa < 2:4293362/149‑1 (MQ=255) gTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaaa < 2:742286/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAAATAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt > 2:3982592/1‑149 (MQ=255) cTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTCTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt > 2:3982524/1‑149 (MQ=255) tgtgTTATGTTCTGTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCtt < 2:4644634/149‑1 (MQ=255) gtTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAt < 2:4041370/149‑1 (MQ=255) aTGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtttt > 1:815681/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTACTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtttt < 1:3694617/149‑1 (MQ=255) tGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTa > 1:2041637/1‑149 (MQ=255) tGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTa < 1:282633/149‑1 (MQ=255) gTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAt < 2:1133543/149‑1 (MQ=255) gTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAt < 1:2717020/149‑1 (MQ=255) ttCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATg > 1:2790949/1‑149 (MQ=255) tttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCaa < 2:1368348/149‑1 (MQ=255) tGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAtt < 1:1416657/149‑1 (MQ=255) aaaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAg > 2:3306225/1‑149 (MQ=255) cTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGcc > 2:3917847/1‑149 (MQ=255) ttttATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGccc < 2:3182456/149‑1 (MQ=255) tttCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATa > 1:3204011/1‑149 (MQ=255) ttCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATaa < 1:3785638/149‑1 (MQ=255) aaTGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGaaa > 2:111673/1‑149 (MQ=255) aTGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAg > 2:2869217/1‑149 (MQ=255) tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa < 1:291546/149‑1 (MQ=255) tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa > 2:3678170/1‑149 (MQ=255) tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa > 1:3217594/1‑149 (MQ=255) gTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAt < 2:3575051/149‑1 (MQ=255) ttGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATg > 1:345783/1‑149 (MQ=255) gCGTGATACTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGAATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATTCTTAATTTTATGCAATTCAATCGCCAGAATAACAGGAAAGATGGc > 2:483574/1‑149 (MQ=255) cGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGcc < 1:4117536/149‑1 (MQ=255) cGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGcc < 1:240489/149‑1 (MQ=255) aTCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg < 2:1674221/149‑1 (MQ=255) ccTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCa > 1:2227104/1‑149 (MQ=255) ccTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCa < 2:1410228/149‑1 (MQ=255) cTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCAt < 2:2629749/149‑1 (MQ=255) tGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATc < 1:3379515/149‑1 (MQ=255) gCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCg > 2:4451848/1‑149 (MQ=255) cATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGc > 2:1882269/1‑149 (MQ=255) tCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATc < 1:4543907/149‑1 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa < 1:2368386/149‑1 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa > 2:2287670/1‑149 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTAAATTTTAAGCGCATTAAATACTTATAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa < 1:3755900/149‑1 (MQ=255) tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGAt < 1:1970486/149‑1 (MQ=255) tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGAt < 2:3657853/149‑1 (MQ=255) gACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCgg > 2:838011/1‑149 (MQ=255) tAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGaa > 2:3631611/1‑149 (MQ=255) aaTGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAat < 1:2679037/149‑1 (MQ=255) tGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat < 1:4287425/149‑1 (MQ=255) tGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat > 1:1795060/1‑149 (MQ=255) ttAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATgg > 1:1753078/1‑149 (MQ=255) ttAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATgg < 1:4141199/149‑1 (MQ=255) aaTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAt > 1:2453402/1‑149 (MQ=255) aTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg < 2:812036/149‑1 (MQ=255) aTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg < 2:1496230/149‑1 (MQ=255) aTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg < 1:1329259/149‑1 (MQ=255) tttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa < 1:2952419/149‑1 (MQ=255) ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGac < 1:897457/149‑1 (MQ=255) ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATGACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGac < 1:178196/149‑1 (MQ=255) gTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaac < 2:3282335/149‑1 (MQ=255) cTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 1:3642480/149‑1 (MQ=255) tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACaaa < 2:2443589/149‑1 (MQ=255) ttCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt < 1:4195061/149‑1 (MQ=255) cAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCt < 1:290434/149‑1 (MQ=255) cAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCt < 2:129471/149‑1 (MQ=255) aaGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTg > 1:687486/1‑149 (MQ=255) tttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttt > 1:4161484/1‑149 (MQ=255) ttAAGCTCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtttt < 1:444895/149‑1 (MQ=255) ttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtttt > 2:3479809/1‑149 (MQ=255) tAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttttt < 2:1354215/149‑1 (MQ=255) tAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttttt < 2:514928/149‑1 (MQ=255) aaGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtttttt < 2:2995127/149‑1 (MQ=255) aGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTc > 1:4359350/1‑149 (MQ=255) cATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAata < 2:582611/149‑1 (MQ=255) ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAtt < 1:4775463/149‑1 (MQ=255) aaaTACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGa > 2:2698759/1‑149 (MQ=255) aGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGaaa < 1:1480854/149‑1 (MQ=255) | CGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAA > CP009273/2046454‑2046747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |