| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,082,792 | A→T | 9.1% | L52* (TTG→TAG) | yoeB ← | toxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,082,792 | 0 | A | T | 9.1% | 976.4 / 64.5 | 317 | L52* (TTG→TAG) | yoeB | toxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (134/153); new base T (13/17); total (147/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.48e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
CTACGCTAGCGTATCAAAACTGACAATTCATTCTATGAATGAATCTGTTCAATAATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCTCCTCTGTAATGCGTCGGGACCAGAAACCTGACAAATTATGTTTCAGGGGTTCTGGCTTCCCCTTACCTTCAAATGGCGTTCTGCGGGTATCTTTGATAAGTTCATTGATCTTTTTAACAATTCGCTTATCTGTTTCCTGCCAGTACAGATAATCGTCCCATGATTCCTCAGACCAGATTAG > CP009273/2082644‑2082940 | cTACGCTAGCGTATCAAAACTGACAATTCATTCTATGAATGAATCTGTTCAATAATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCTCCTCTGTAATGCGTCGGGACCAGAAACCTGACa > 2:3767281/1‑149 (MQ=255)cTACGCTAGCGTATCAAAACTGACAATTCATTCTATGAATGAATCTGTTCAATAATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCTCCTCTGTAATGCGTCGGGACCAGAAACCTGACa < 1:4091327/149‑1 (MQ=255) cTAGCGTATCAAAACTGACAATTCATTCTATGAATGAATCTGTTCAATAATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCTCCTCTGTAATGCGTCGGGACCAGAAACCTGACAAATTa > 2:3655590/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |