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Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
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tataCAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGa > 1:3743101/1‑149 (MQ=255) ataCAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGaa > 2:543077/1‑149 (MQ=255) ataCAATTGCTCGTTCAAAGAGAGAGCTAAAATCCCTATAACAGAAGAACCCTCCCCACTGCTGAAGGGATGACGTAAAAGACGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCAATCCCATGCGCTATCAAGCCGCACAACCTGCGGaa > 2:1666101/1‑149 (MQ=255) taCAATTGCTCGTTGAAATAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCATAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGaaa > 2:3419043/1‑149 (MQ=255) cAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAgg > 2:2274460/1‑149 (MQ=255) tGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCt > 1:3915630/1‑149 (MQ=255) gCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCtt < 2:2330786/149‑1 (MQ=255) ttGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTAccgc > 1:95808/1‑149 (MQ=255) aaaGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTACCGCCgg > 1:4350354/1‑149 (MQ=255) aaaGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCACGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAAAAACAATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTACCGCCgg > 2:361003/1‑149 (MQ=255) agagTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTACCGCCgggg > 2:517685/1‑149 (MQ=255) gagTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTACCGCCGGGGt < 2:1114550/149‑1 (MQ=255) | GCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGCCGGACAACCTGCGGAAAGGATCTTACCGCCGGGGT > CP009273/227382‑227678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |