Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 235,019 | C→A | 22.0% | V69L (GTA→TTA) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 22.0% | 403.4 / 26.2 | 218 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (98/62); new base A (25/32); total (123/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAAT > CP009273/234871‑235167 | tatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAc > 1:2551988/1‑149 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACa > 2:1430766/1‑149 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACa > 2:3820065/1‑149 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt > 2:223390/1‑149 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 2:2483918/149‑1 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt > 2:2307094/1‑149 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGaa > 1:1085093/1‑149 (MQ=255) gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATTAat > 1:2506680/1‑149 (MQ=255) gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat > 1:2537705/1‑149 (MQ=255) gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat > 1:1877778/1‑149 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 1:233336/149‑1 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 1:1885181/149‑1 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa > 2:1889234/1‑149 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTaaa > 2:469702/1‑149 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATGAATATTTtaaa > 1:2467232/1‑149 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaaa < 2:3694676/149‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:2686717/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa‑a < 1:1485633/149‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑Ac < 1:2449336/149‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑Ac < 2:1963539/149‑1 (MQ=255) tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGaaa‑aag > 1:2630183/1‑147 (MQ=255) tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACg > 2:2497558/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAATATTTTATTATATTAATTAAAAATAAAATAATAATTAAAAAGTaaa‑aaaa > 1:2812153/1‑146 (MQ=255) aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTTATAAATATTTTATTTTAGTAAGTAAAAATAAAAGTAAATTTAAAAAGGAAA‑AAGa > 1:2812517/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGAc > 1:1258230/1‑149 (MQ=255) aaGGTGATATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGAc < 2:1403585/149‑1 (MQ=255) tATTAGTATAGCTATTAGTAAAAATATAAGTGTTAGTTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTTTTATCTTAAGTAAATTTAAATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAAc < 2:3804272/149‑1 (MQ=255) tATTACGTTTGCTATTTGTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTTTGGTTTTGTCTGGGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTATTAATGATTTTTTTATCGTAATTAAATTTACTTTAATATTTAAAAAGTAAA‑ACGACATGAAAc < 2:4098879/149‑1 (MQ=255) aCGATTGTTTTTTGTAAAAATATATGTGTTTGGTGTTTTGTTTTGTGTGTGGGGAATTTGACTACCTGCGTTTTTTTTTTTAATATTGTTTTTATTATGTTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAATGTAAA‑ACGACATGAAACCGaa < 2:918370/149‑1 (MQ=255) aCGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGaa > 2:648912/1‑149 (MQ=255) tAGTTATTATTAAAAATATAAGTTTTAGATGTTTTGTTATGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTTTTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGcac < 2:593949/149‑1 (MQ=255) gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAAATACATGAATATTTAAAAATGAAA‑AAGACAAGAAAACGAAGCACAg > 1:540683/1‑149 (MQ=255) gCTACTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAg > 2:4330064/1‑149 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATTAAA‑ACGACATTAAAACGAATAACAGaaa > 2:3309961/1‑148 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGCAA‑ACGTCATGAAAACCAAGCACAGAATaaa > 2:4610820/1‑149 (MQ=255) gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAG‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 1:3128738/149‑1 (MQ=255) tAAAAATATAAGTGTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:2375765/149‑1 (MQ=255) tAAAAATATAAGTGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:2376158/149‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt > 2:4493137/1‑149 (MQ=255) aagttttATCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTGTTTTTTTTGATTATGATTTATTTTATTATCTTAAGTAAATTTAATTTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 2:1231640/144‑1 (MQ=255) agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATc > 1:317425/1‑149 (MQ=255) agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAAACGAAGAACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:2567404/1‑149 (MQ=255) gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa > 2:780334/1‑149 (MQ=255) gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAtaa > 2:255854/1‑147 (MQ=255) gTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa > 2:313538/1‑149 (MQ=255) ttAGCTTTATTTTTTTTTCTGTGGCTAATTTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAATATTGATTTTTTTATTTTAATTAAATTTAAATTATTATTTAAAATGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 1:1000264/149‑1 (MQ=255) aGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACAAGAAAAATTAAAAAGGAAA‑AAGACAATAAACCGAACCACACAAACAAAAATCACCAATCaaaaaa > 1:3791812/1‑149 (MQ=255) aGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGTAA‑AAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAAATATCCAATCATaaaa > 1:106422/1‑149 (MQ=255) aGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGTAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACCAAATCAACAATCTCCAATAATaaaa > 2:4004797/1‑149 (MQ=255) tttATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:2762761/147‑1 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:370468/149‑1 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat > 2:4490211/1‑149 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat > 2:1109742/1‑149 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAAACGAAGCACATAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat > 2:3567582/1‑149 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑AAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCACCAATCATAAAatat > 2:2072952/1‑149 (MQ=255) gttttGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:3784874/146‑1 (MQ=255) gTTATTTCTGTGCCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTAATATCGTAAATAAAATTACAGTAATATTTAAAAAGGAAA‑AACACATTAAAACGAAGCACAGAATCAACAATATACAATAAAAAAataaatactt > 2:581401/1‑142 (MQ=255) gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAATAATATTTAAAAAGGAAA‑AAGACAAGAAAACCAAGCACAGAAAAAACAATATCCAATAAAAAAAAATTTCCGt > 1:3813223/1‑149 (MQ=255) ttATGTGTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTATTATCGTAATTAAAATTAATTTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 1:3902253/149‑1 (MQ=255) tttgtgtgGGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAATGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:290516/147‑1 (MQ=255) tATGTCTGTGGAGAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTTTTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:2600867/149‑1 (MQ=255) aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATACAATCAAAAAAAATTTCCGTGGa > 1:238057/1‑149 (MQ=255) tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTAATATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAA‑AAGACATTAAAACGAAGAACCAAATCAACAATCACCAATAAAAAAATATTTACGTGGAGCa > 1:2311540/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTTTTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAt < 1:4686782/149‑1 (MQ=255) gctaaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:625802/146‑1 (MQ=255) taaaTTTAATACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 2:3410908/148‑1 (MQ=255) aaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAAAAATTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCCAAGCACAGAATCAAAATTCAACAAACATAAAAAATATACGAGGATCAATTtattat > 1:3949862/1‑149 (MQ=255) atttGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:115406/147‑1 (MQ=255) aaTTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:478144/149‑1 (MQ=255) aaTTGACTAACTTCTTTTTTTTTATAAATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATCAATATTAAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2973435/149‑1 (MQ=255) ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa > 2:2727586/1‑149 (MQ=255) ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTTATTATTGa > 2:477666/1‑149 (MQ=255) cTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 2:4303218/149‑1 (MQ=255) ttCGTTTTTTTTATAAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:160256/149‑1 (MQ=255) ctttttttttATTAATAATTATTTTATTATCTAAACAAAAATTAATTGAATATTTAAAAAGCAAC‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt < 1:1665893/147‑1 (MQ=255) ttttttATTAATATTTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 2:46/149‑1 (MQ=255) ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt < 2:273448/149‑1 (MQ=255) aTTAATAATTATTTTTTTATCGTAATTAAATTTAATTTAATATTTAAAAAGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:944119/149‑1 (MQ=255) ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa < 2:794337/149‑1 (MQ=255) aTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACATAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:3036854/1‑149 (MQ=255) tGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa < 2:49300/149‑1 (MQ=255) gATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa > 1:989271/1‑149 (MQ=255) aTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaaa > 1:3379810/1‑149 (MQ=255) ttttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag > 2:175481/1‑149 (MQ=255) tttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaaga > 1:3520683/1‑149 (MQ=255) tattatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag > 2:858483/1‑149 (MQ=255) ttatattaattaaAATTAAATAAAAATTTAAAAAGCAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:939749/143‑1 (MQ=255) tatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt > 2:3930953/1‑149 (MQ=255) tCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 2:2662460/1‑149 (MQ=255) gtatttaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 1:1834885/144‑1 (MQ=255) taattaaAATTACATTAATATTTAAAATGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt < 1:270571/149‑1 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt > 1:4513916/1‑149 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt > 2:4470978/1‑149 (MQ=255) taagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt > 2:1709768/1‑149 (MQ=255) ttaaaaaTTAATTTAATATTTAAAATGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc < 1:4625/146‑1 (MQ=255) ataaAATTTAATTAAATTTTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc < 1:4004797/148‑1 (MQ=255) taaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAg > 1:358746/1‑149 (MQ=255) aaaaTTAAATTAATATTTAAAAAGTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAgg < 1:1686015/149‑1 (MQ=255) aaaaTTAAATTAATATTAAAAAATTAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAgg < 1:66666/149‑1 (MQ=255) aaTTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa > 2:1153271/1‑149 (MQ=255) | TATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAA‑ACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAAT > CP009273/234871‑235167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |