| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,014,888 | C→A | 22.7% | R72S (CGT→AGT) | xdhD → | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,014,888 | 0 | C | A | 22.7% | 763.6 / 163.9 | 299 | R72S (CGT→AGT) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/102); new base A (31/37); total (160/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTAC > CP009273/3014740‑3015033 | cAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCg < 1:4447965/149‑1 (MQ=255) aaaGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTa > 1:1341013/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTAc > 2:3154531/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTAc < 2:3533579/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCg > 1:3362262/1‑149 (MQ=255) tgttTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGaa > 2:599383/1‑149 (MQ=255) tgttTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGaa < 1:729479/149‑1 (MQ=255) tgttTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGaa < 2:926644/149‑1 (MQ=255) tAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAAtctc < 2:1210382/149‑1 (MQ=255) tAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAAtctc < 2:4425989/149‑1 (MQ=255) tAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAAtctc < 2:1027462/149‑1 (MQ=255) aaCATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATctct < 1:3136273/149‑1 (MQ=255) aaCATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATctct > 1:3734148/1‑149 (MQ=255) aTGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTggg > 1:1530773/1‑149 (MQ=255) tGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGc < 2:3637807/149‑1 (MQ=255) aTGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATg < 1:1057855/149‑1 (MQ=255) tGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATgg > 2:1474013/1‑149 (MQ=255) tGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATgg < 1:1829948/149‑1 (MQ=255) tGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATgg < 1:1588815/149‑1 (MQ=255) gCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGa < 1:1762549/149‑1 (MQ=255) cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGaa > 2:3871163/1‑149 (MQ=255) cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGaa < 2:2686422/149‑1 (MQ=255) cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGaa < 2:407841/149‑1 (MQ=255) cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGaa < 2:50861/149‑1 (MQ=255) ctctGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACg > 1:4286166/1‑149 (MQ=255) tctGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGa > 2:2167954/1‑149 (MQ=255) ctGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAg < 2:2852612/149‑1 (MQ=255) ctGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAg < 2:1194174/149‑1 (MQ=255) gTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGtt < 2:1989683/149‑1 (MQ=255) aCGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTaa > 2:1510396/1‑149 (MQ=255) gCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt < 2:1774051/149‑1 (MQ=255) gCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt < 1:735222/149‑1 (MQ=255) gCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt > 1:116626/1‑149 (MQ=255) cAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTgg > 1:3105149/1‑149 (MQ=255) gTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGtt > 1:2854445/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTc > 1:2392260/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTc < 1:543553/149‑1 (MQ=255) atgatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCaa > 1:451073/1‑149 (MQ=255) atgatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCaa > 2:3483916/1‑149 (MQ=255) tgatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAAc > 1:852661/1‑149 (MQ=255) gatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACa > 2:81069/1‑149 (MQ=255) gatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACa < 2:464940/149‑1 (MQ=255) gatgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACa < 2:464997/149‑1 (MQ=255) tgGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAgg < 2:92955/149‑1 (MQ=255) ggTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGc < 2:696154/149‑1 (MQ=255) tCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATg < 2:3300068/149‑1 (MQ=255) gggTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGt > 1:2456447/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGt < 1:2104458/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGtt < 2:431923/149‑1 (MQ=255) tttGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGa < 2:4001463/149‑1 (MQ=255) tttGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGa > 2:3368385/1‑149 (MQ=255) ggTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTgg < 2:1580535/149‑1 (MQ=255) tGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCgtgg < 1:2886012/149‑1 (MQ=255) gACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCgtggt < 2:4207755/149‑1 (MQ=255) gCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCa > 2:4534232/1‑149 (MQ=255) gCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCa < 1:3272705/149‑1 (MQ=255) cAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAg < 2:3574215/149‑1 (MQ=255) aataatCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGt > 2:4491812/1‑149 (MQ=255) aataatCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGt > 2:2496399/1‑149 (MQ=255) ataatCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTc < 2:3098104/149‑1 (MQ=255) taatCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCt > 1:3836222/1‑149 (MQ=255) aatCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTg > 1:1965087/1‑149 (MQ=255) atCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTgg > 1:3772089/1‑149 (MQ=255) atCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTgg > 1:1112980/1‑149 (MQ=255) tCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGt > 1:3034668/1‑149 (MQ=255) tttAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTta > 2:4768121/1‑149 (MQ=255) ggTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGa < 1:4251031/149‑1 (MQ=255) ggTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGa > 1:3572510/1‑149 (MQ=255) gTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGAt > 1:1310253/1‑149 (MQ=255) aaTATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATcc > 2:1135007/1‑149 (MQ=255) atatCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCa > 1:3503978/1‑149 (MQ=255) tatCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAg > 1:1256015/1‑149 (MQ=255) gTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGc < 2:155614/149‑1 (MQ=255) ttAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCa > 1:844901/1‑149 (MQ=255) aaCGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGc > 1:1954327/1‑149 (MQ=255) aCGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGct < 2:1818219/149‑1 (MQ=255) aCGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGct < 1:4677999/149‑1 (MQ=255) aCGCGTCCTTGCTTATTGCCACACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGct > 1:1689772/1‑149 (MQ=255) cgTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTg < 2:2659380/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGa < 2:451073/149‑1 (MQ=255) tCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGAt > 1:1101133/1‑149 (MQ=255) cTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTa < 1:3801415/149‑1 (MQ=255) ttGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAACGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAGCGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTAt > 1:4347884/1‑149 (MQ=255) tGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATc < 1:2730440/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGa > 2:3022706/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGAt < 1:4120456/149‑1 (MQ=255) gCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGAtcttct > 1:3455284/1‑149 (MQ=255) aGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGat > 1:4020818/1‑149 (MQ=255) aGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGat > 1:214849/1‑149 (MQ=255) aGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGat > 1:2606853/1‑149 (MQ=255) gTTAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatc > 1:641512/1‑149 (MQ=255) ttAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatcg > 2:1399702/1‑149 (MQ=255) ttAGAGAAGGCAGATATTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatcg > 1:2577292/1‑149 (MQ=255) agagAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatcgca > 2:2244977/1‑149 (MQ=255) gaAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatcgcatcg > 1:2294965/1‑149 (MQ=255) aaGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGatcgcatcgc < 2:3230930/149‑1 (MQ=255) gATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCAcc < 2:2316676/149‑1 (MQ=255) tatTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTa > 1:3624917/1‑149 (MQ=255) tatTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTa > 1:3193404/1‑149 (MQ=255) tatTAGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTa > 2:3914540/1‑149 (MQ=255) | GCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTAC > CP009273/3014740‑3015033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |