Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,030,978 | A→T | 5.3% | L163* (TTG→TAG) | recJ ← | ssDNA exonuclease, 5' ‑‑> 3'‑specific |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,030,978 | 0 | A | T | 5.3% | 924.3 / 31.1 | 282 | L163* (TTG→TAG) | recJ | ssDNA exonuclease, 5' ‑‑> 3'‑specific |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (132/135); new base T (7/8); total (139/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
AACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACC > CP009273/3030831‑3031126 | aaCCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTCATGTGTCGCCTGGCaa > 2:3322050/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAACTTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAAt < 1:3362925/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCatat < 2:4066576/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAAt < 2:2510100/149‑1 (MQ=255) aGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCATACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATgg > 1:3600305/1‑149 (MQ=255) aGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATgg < 1:1653886/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGa < 1:2644118/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGa < 1:154636/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGa > 2:2500234/1‑149 (MQ=255) tGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATc > 2:2659901/1‑149 (MQ=255) gATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCg > 1:1167816/1‑149 (MQ=255) cgcgCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTa < 2:1083092/149‑1 (MQ=255) gcgcAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTaa < 2:1474626/149‑1 (MQ=255) gcgcAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTaa > 1:4789456/1‑149 (MQ=255) cgcAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAAc < 2:3938165/149‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAAt < 2:3849992/149‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAAt > 1:202443/1‑149 (MQ=255) aaaaGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATa < 2:444136/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAAc < 1:1131891/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGAt < 2:2167023/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGAt < 1:3917827/149‑1 (MQ=255) gcAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATg > 1:481639/1‑149 (MQ=255) ccAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAc < 1:218480/149‑1 (MQ=255) ccAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAc < 1:3727242/149‑1 (MQ=255) aGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAcga > 2:1716599/1‑149 (MQ=255) tCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAcgagcga < 2:4459569/149‑1 (MQ=255) gATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGagcgagcg < 1:312144/149‑1 (MQ=255) gATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGagcgagcg > 2:4778241/1‑149 (MQ=255) aTAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGt > 2:3853280/1‑149 (MQ=255) aaaCGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCt < 1:3120773/149‑1 (MQ=255) aaaCGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCt > 1:1679921/1‑149 (MQ=255) aaCGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTc < 2:4333733/149‑1 (MQ=255) cacCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAAccccc < 2:2866617/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATggg < 1:1373746/149‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGgga < 1:582175/149‑1 (MQ=255) tGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGggagg > 2:805869/1‑149 (MQ=255) tGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGggagg > 2:1995365/1‑149 (MQ=255) ccAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGaa > 2:4011416/1‑149 (MQ=255) gTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATa > 1:4111890/1‑149 (MQ=255) gTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATa > 1:2696455/1‑149 (MQ=255) gTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATa > 1:4469091/1‑149 (MQ=255) gATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCTACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATAcc > 1:2361650/1‑149 (MQ=255) gATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATAcc > 1:4581465/1‑149 (MQ=255) aTTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCg > 1:3526930/1‑149 (MQ=255) ttCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGtt < 2:3088694/149‑1 (MQ=255) ttCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGtt < 1:3747009/149‑1 (MQ=255) tCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTa < 1:702705/149‑1 (MQ=255) cGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTAt < 1:3973745/149‑1 (MQ=255) cGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCa < 2:4587454/149‑1 (MQ=255) gAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCg > 2:4662657/1‑149 (MQ=255) aaaTTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGt > 1:2214663/1‑149 (MQ=255) aaTTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCgag > 2:421070/1‑147 (MQ=255) aTTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGa > 1:4144386/1‑149 (MQ=255) aTTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGa < 2:653394/149‑1 (MQ=255) ttACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGAc < 2:70268/149‑1 (MQ=255) ttACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGAc < 2:2420563/149‑1 (MQ=255) ttACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGAc < 2:2507412/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTa > 2:2670649/1‑149 (MQ=255) tCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTaa < 1:819334/149‑1 (MQ=255) cgcgCAAGTTAGGGTTACTGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCTACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAAc < 2:1169938/149‑1 (MQ=255) cgcgCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAAc < 2:3245746/149‑1 (MQ=255) gcAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTACTGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgc > 2:3597201/1‑149 (MQ=255) gcAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgc > 1:4330928/1‑149 (MQ=255) gcAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgc < 1:3307767/149‑1 (MQ=255) aaGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgcgc > 1:3995520/1‑149 (MQ=255) aaGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgcgc < 2:3483638/149‑1 (MQ=255) gTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTgcgcgc > 2:232278/1‑149 (MQ=255) aGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCAc > 2:1318077/1‑149 (MQ=255) gTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACggg > 2:3375803/1‑149 (MQ=255) tAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCa > 1:3440022/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCAt < 2:5740/149‑1 (MQ=255) aaTGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCAt < 1:997576/149‑1 (MQ=255) gATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATggg > 1:516645/1‑149 (MQ=255) aTCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGc > 1:2212471/1‑149 (MQ=255) tCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATACCCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGcc < 2:2938336/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGcc < 2:195863/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGcc < 2:1796672/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGcc < 1:2250415/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGcc < 1:1280474/149‑1 (MQ=255) cGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCt > 2:2988614/1‑149 (MQ=255) cGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCt > 1:688279/1‑149 (MQ=255) cGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCt < 2:3663722/149‑1 (MQ=255) cGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCt < 2:1578694/149‑1 (MQ=255) gCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCAGGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTg > 2:2615994/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGa > 2:3870496/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGAt > 1:298950/1‑149 (MQ=255) cGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGa < 1:2268104/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGAcc < 1:2500345/149‑1 (MQ=255) gCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGTGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCAc > 2:4373942/1‑149 (MQ=255) ggTAATGTGTCGCCTGGCTAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTc > 1:1041805/1‑149 (MQ=255) aaTGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCgg < 1:3047297/149‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTaa < 2:1220616/149‑1 (MQ=255) cGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAg > 1:903888/1‑149 (MQ=255) tGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGt > 2:4370699/1‑149 (MQ=255) ggCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTa < 1:1742213/149‑1 (MQ=255) gCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTaa < 1:3580087/149‑1 (MQ=255) cAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAAc < 2:3154253/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAAcc > 1:1089664/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAAcc > 1:2471664/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAAcc > 1:38228/1‑149 (MQ=255) | AACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACC > CP009273/3030831‑3031126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |