Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,176,733 | G→T | 100% | intergenic (+51/+439) | zupT → / ← ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,176,733 | 0 | G | T | 99.6% | 872.6 / ‑4.3 | 257 | intergenic (+51/+439) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (170/86); total (171/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAG > CP009273/3176588‑3176876 | ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaaa < 1:538725/149‑1 (MQ=255) gACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCTCTAAAGc > 2:789681/1‑149 (MQ=255) aCCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc < 2:61679/149‑1 (MQ=255) cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCt > 1:2855263/1‑149 (MQ=255) cTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTa < 2:830514/149‑1 (MQ=255) cTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTa > 1:2620521/1‑149 (MQ=255) taataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAt > 1:1005697/1‑149 (MQ=255) ataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTc > 1:2540730/1‑149 (MQ=255) taataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCt > 2:4058509/1‑149 (MQ=255) taaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTAcc > 1:4485441/1‑149 (MQ=255) aaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCt < 2:3564285/149‑1 (MQ=255) aaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCt > 1:3175983/1‑149 (MQ=255) cccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtttt > 2:3218680/1‑149 (MQ=255) ccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 1:2106112/1‑149 (MQ=255) cAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg > 2:2595659/1‑149 (MQ=255) aGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCTCTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg > 2:4767423/1‑149 (MQ=255) aGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg > 2:1590134/1‑149 (MQ=255) tATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 2:3556692/1‑149 (MQ=255) cGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctct > 2:2090242/1‑149 (MQ=255) 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tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTa < 2:657793/149‑1 (MQ=255) tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTa > 1:1350843/1‑149 (MQ=255) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTAc > 2:576796/1‑149 (MQ=255) aTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt < 1:3648323/149‑1 (MQ=255) aTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt > 2:416140/1‑149 (MQ=255) tGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGtt > 1:1946202/1‑149 (MQ=255) tCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTa > 1:4622127/1‑149 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa > 1:2442458/1‑149 (MQ=255) aGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAg > 2:3715913/1‑149 (MQ=255) tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTa > 1:3286581/1‑149 (MQ=255) 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aGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCa > 1:1589245/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCa < 1:4554725/149‑1 (MQ=255) gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc > 1:1344640/1‑149 (MQ=255) gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc < 1:672001/149‑1 (MQ=255) ctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTCTTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTg > 2:4523485/1‑149 (MQ=255) 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gggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTcc > 1:1834130/1‑149 (MQ=255) gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTg < 1:1166120/149‑1 (MQ=255) gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTg > 2:2166141/1‑149 (MQ=255) aTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGc > 1:3006654/1‑149 (MQ=255) aTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATGTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGc > 1:3925351/1‑149 (MQ=255) ttGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCg > 1:1428822/1‑149 (MQ=255) gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGaaa < 1:1290095/149‑1 (MQ=255) gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGaaa > 1:3196923/1‑149 (MQ=255) aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGc > 2:1475478/1‑149 (MQ=255) aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGcc > 2:1758281/1‑149 (MQ=255) 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gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGt > 2:4263134/1‑149 (MQ=255) aGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGttt > 1:15325/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTc > 2:749123/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACC‑TTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCa > 2:2271810/1‑149 (MQ=255) tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCATACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaa > 1:2586587/1‑149 (MQ=255) tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCATACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaa > 1:4111132/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaaa < 2:494694/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaaa > 2:2373481/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAAt < 1:3397879/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATg > 2:1842469/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATg < 2:4622127/149‑1 (MQ=255) aGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCa > 2:3058759/1‑149 (MQ=255) gcgcATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAg < 2:4357213/149‑1 (MQ=255) gcATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGa > 1:579647/1‑149 (MQ=255) gACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATaa > 1:1035299/1‑149 (MQ=255) aCAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAc > 1:3407820/1‑149 (MQ=255) aCAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAc > 2:2756630/1‑149 (MQ=255) cAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAcc > 1:682659/1‑149 (MQ=255) cTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACccac > 2:473328/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAACTAACccacc > 1:1638788/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACccacc > 1:577817/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACcaca > 1:3732393/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACcaca > 2:2870703/1‑149 (MQ=255) ttCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCagag < 1:2109503/149‑1 (MQ=255) ttCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCagag < 2:544584/149‑1 (MQ=255) ttCACTAAAGCCTGATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCGTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCagag < 2:4277375/149‑1 (MQ=255) | TTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAG > CP009273/3176588‑3176876 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |