| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 360652 = | 418 (1.350) | 10222 (49.420) +AATTAATGTAAGTTAGCGCGAATTGATCTGGTTTGACAGCTTATCA |
183/186 | NT | 97.8% | intergenic (‑586/+9) | lacZ/lacI | pseudogene, truncated/DNA‑binding transcriptional repressor |
| ? | CP009273 | = 1317577 | 271 (0.870) | coding (101/882 nt) | yciV | PHP domain protein | |||||
Only 100 of 19250 total aligned reads displayed.
GCCCGATACGGCTCATGGATGGTGTTTCGGGTCGGGTGAATCTTGTTGATGGCGATATGGATGTGCAGGTTGTCGGTGTCGTGATGCACGGCACTGACGCGCTGATGCTCGGCGAAGCCAAGCCCAGCGCAGATGCGGTCCTCAATCGCGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCACCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCC > CP009273/360503‑360801 | ccttgagcgacacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttccattaattg > 2:4889716‑M1/150‑150 (MQ=255) cttgagcgacacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgc < 1:777005‑M1/2‑1 (MQ=255) ttgagcgacacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcg > 2:3319717‑M1/148‑150 (MQ=255) agcgacacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttg > 2:5492587‑M1/145‑150 (MQ=255) acacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCt < 1:5049956‑M1/10‑1 (MQ=255) acacgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCt > 1:2209389‑M1/141‑150 (MQ=255) acgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCa > 1:1000608‑M1/139‑150 (MQ=255) acgaattatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCa < 2:3216396‑M1/12‑1 (MQ=255) attatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGc < 2:5087580‑M1/16‑1 (MQ=255) tatgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGccc > 2:809645‑M1/133‑150 (MQ=255) gatggTGTTTCGGGTCGGGTGAATCTTGTTGATGGCGATATAGATGTGCAGGTTGTCGGTGTCGTGATGCACGGCACTGACGCGCTGATGCTCGGCGAAGCCAAGCCCAGCGCAGATGCGGTCCTCAATCGCGCGTTGCGCTCACTGccc > 2:203312/1‑150 (MQ=255) atgcagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCg < 1:2864457‑M1/19‑1 (MQ=255) cagtgatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCtt > 2:3923091‑M1/129‑150 (MQ=255) gatttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCa > 1:1736030‑M1/125‑150 (MQ=255) atttacgacctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAg < 1:2022309‑M1/27‑1 (MQ=255) acctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaa > 1:2970306‑M1/117‑150 (MQ=255) acctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaa > 1:4535934‑M1/117‑150 (MQ=255) acctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaa < 1:1112318‑M1/34‑1 (MQ=255) acctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaacagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaa < 2:1927940‑M1/34‑1 (MQ=255) cctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaaa < 1:3400474‑M1/35‑1 (MQ=255) cctgcacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGaaa > 1:211096‑M1/116‑150 (MQ=255) gAATCTTGTTGATGGCGATATGGATGTGCAGGTTGTCGGTGTCGTGATGCACGGCACTGACGCGCTGATGCTCGGCGAAGCCAAGCCCAGCGCAGATGCGGTCCTCAATCGCGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCt > 2:2417600/1‑150 (MQ=255) cacagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTg > 2:899540‑M1/112‑150 (MQ=255) cagccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTc > 1:4956269‑M1/110‑150 (MQ=255) agccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCg < 1:2581293‑M1/42‑1 (MQ=255) gccataccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGt > 2:1360898‑M1/108‑150 (MQ=255) taccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCa > 1:2305178‑M1/104‑150 (MQ=255) taccacagcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCa > 2:3634902‑M1/104‑150 (MQ=255) agcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCa > 2:4114278‑M1/98‑150 (MQ=255) agcttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCa < 2:3730065‑M1/53‑1 (MQ=255) cttccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCAtt > 1:4743923‑M1/96‑150 (MQ=255) ccgatggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAAt > 1:4640789‑M1/93‑150 (MQ=255) tggctgcctgacgccagaagcattggtgcaccgtgcagtcgatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAAt < 1:1328558‑M1/62‑1 (MQ=255) 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acttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTACCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCa > 2:3519462‑M1/14‑150 (MQ=255) cttacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCaa < 1:875129‑M1/138‑1 (MQ=255) tacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACa < 1:3187941‑M1/140‑1 (MQ=255) tacattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACa > 1:5164008‑M1/11‑150 (MQ=255) acattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCACCGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAg < 1:5259652‑M1/141‑1 (MQ=255) acattaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAg > 1:669798‑M1/10‑150 (MQ=255) attaattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCt < 2:3018054‑M1/143‑1 (MQ=255) taattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGa < 2:4515803‑M1/145‑1 (MQ=255) taattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGa > 2:4798610‑M1/6‑150 (MQ=255) aattGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGATTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGAt > 2:4408720‑M1/5‑150 (MQ=255) attGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGAtt > 2:1635005‑M1/4‑150 (MQ=255) attGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGAtt < 1:5360982‑M1/147‑1 (MQ=255) attGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGAtt > 1:3912317‑M1/4‑150 (MQ=255) ttGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGAtt < 1:1647320‑M1/147‑1 (MQ=255) tGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGc < 1:1218498‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGGATTGGGCGCCAGGGTGGTGTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGc < 1:1837159‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGcc < 1:5463447/150‑1 (MQ=255) | GCCCGATACGGCTCATGGATGGTGTTTCGGGTCGGGTGAATCTTGTTGATGGCGATATGGATGTGCAGGTTGTCGGTGTCGTGATGCACGGCACTGACGCGCTGATGCTCGGCGAAGCCAAGCCCAGCGCAGATGCGGTCCTCAATCGCGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCACCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCC > CP009273/360503‑360801 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |