| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009273 | = 4429937 | 286 (0.920) | 4 (0.010) | 4/258 | NT | 1.4% | coding (1096/1344 nt) | ytfL | UPF0053 family inner membrane protein |
| ? | CP009273 | 4430232 = | 315 (1.090) | coding (801/1344 nt) | ytfL | UPF0053 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCACCTTATTCTTCAGGCTTTGCTCATCTTCGTGGAGATCAAACCAAATCACGTTTTCACGCGG > CP009273/4430084‑4430381 | cgTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGt > 2:2342481/1‑150 (MQ=255) tACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTc > 2:5167662/1‑150 (MQ=255) tACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTc > 1:246857/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcag > 2:277790/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcag > 1:2697363/1‑150 (MQ=255) tCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcagc < 1:3693891/150‑1 (MQ=255) cggtCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcagca < 2:5285505/147‑1 (MQ=255) gTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcagcag < 1:3652705/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAgg < 2:3613352/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAgg < 2:3740174/150‑1 (MQ=255) tCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGt < 2:4383300/150‑1 (MQ=255) gATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCttt > 1:3483030/1‑150 (MQ=255) tCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCCACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTCTCCGGCACAATCAGCGTGGTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAg < 2:2958462/150‑1 (MQ=255) tCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAg < 1:2128820/150‑1 (MQ=255) cACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGa > 1:4895189/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATc < 1:4672875/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATc < 2:2207374/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATc > 1:3979355/1‑150 (MQ=255) 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agcacgcgGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCACCTTATTCTTCAGGCTTTGCTCATCTTCGTGGAGATCAAACCAAATCACGttt > 1:576742‑M2/9‑150 (MQ=255) agcacgcgGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCACCTTATTCTTCAGGCTTTGCTCATCTTCGTGGAGATCAAACCAAATCACGttt < 2:4341579‑M2/142‑1 (MQ=255) | CGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCACCTTATTCTTCAGGCTTTGCTCATCTTCGTGGAGATCAAACCAAATCACGTTTTCACGCGG > CP009273/4430084‑4430381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |