Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,282,598 | G→T | 5.2% | noncoding (95/171 nt) P12Q (CCA→CAA) ‡ |
rttR ← tpr ← |
rtT sRNA, processed from tyrT transcript protamine‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,282,598 | 0 | G | T | 5.2% | 675.9 / 12.7 | 220 | noncoding (95/171 nt) P12Q (CCA→CAA) ‡ | rttR tpr | rtT sRNA, processed from tyrT transcript protamine‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/123); new base T (12/5); total (92/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.92e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAT > CP009273/1282450‑1282746 | tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGGGGCAACCCTCACTCGCGGgc > 1:2158620/1‑150 (MQ=14) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGGCGGCGGCCACGCTCTCACCCTGgcg > 1:4378162/1‑150 (MQ=14) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCGGCGGCCACCCACCCACGCCGgcgc > 1:2911839/1‑150 (MQ=14) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCCGCCACGCACACACGCGGgcgccc > 1:3767201/1‑148 (MQ=14) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTc < 2:4870133/150‑1 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGTCCGGCGGCAAACCCCTCACGCGGGCGCACgc > 1:602648/1‑149 (MQ=14) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCGGCGGCAACCCGCCCACGCCGGcgcgcgc > 1:4759197/1‑149 (MQ=14) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACCCTCACACGCTGGCGCGCGAGt > 2:4664127/1‑150 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGGTCTCTCGCTTTCGCTCGACTC‑Gaa > 2:1160464/1‑150 (MQ=14) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAACGCTCTCACGCTGGCGCTCGAGTC‑gca > 2:3924276/1‑148 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCtcgaatc‑gaa > 2:4722623/1‑150 (MQ=14) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGGCTGGCGCAACGCACAAACCCAGGCGCCCGAGTC‑GGAc > 1:1968425/1‑150 (MQ=14) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACCCTCTATCCCAGGCGCTCCAATC‑Gaaa > 1:3220990/1‑149 (MQ=14) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGTGCTGCGGCAAACCACACACCCAGGCGCGCGAGTC‑Gaaaagtg > 1:3425690/1‑145 (MQ=14) gCAGTATATTTGATCGCGGATTCGCTTGAGATTTCCGCGACTTTAGAAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTgg < 1:992033/150‑1 (MQ=11) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTc < 1:2768350/150‑1 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCGCTCTCGCTGGCGCACGAGTC‑GTACCTTGGTc > 2:166109/1‑150 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCACCGGTCTCTCGCTTTCGCTCGAATC‑GAACCATAGTc > 2:3525141/1‑150 (MQ=14) atatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCACACTCGCTGGCGCTCCAGTC‑GAACCCTGGTCGaa > 1:3618088/1‑150 (MQ=14) atTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCAGGCGCTCGAGTA‑GAACCTTGGTCGTAGc > 2:4401598/1‑150 (MQ=255) tGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAACCTCTCACGCGGGCGCTCCAGTC‑GAAACATGGTCgcaacgta > 1:4436494/1‑143 (MQ=14) aTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGGCGGCCGCAACCCACTCAAGCGGGCCCTCGCGTCGGAACATTGGT‑GAAGCtaaac > 2:2801233/1‑146 (MQ=14) aTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGGAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GGACCTTGGTCGAAGCTtctc > 2:2295143/1‑150 (MQ=255) aTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTtctc < 2:3710660/150‑1 (MQ=255) ttGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCa < 2:2573014/150‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAACGCACACACGCGGGCGCGCGAGTA‑GAAACGAGGGCGAAGcatataaa > 1:784109/1‑143 (MQ=14) tcGGTTTCGGTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTGATAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 1:4409851/149‑1 (MQ=255) gagtCGCTTGTGAGTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTCCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCtt < 2:2658041/147‑1 (MQ=14) cGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATC‑GAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTcccc < 1:3525141/150‑1 (MQ=14) tGAGAGTTCAGGGACTGGGGTAAGTGATGGTGGTGGGGGTATGTTTACTTAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 1:2294390/150‑1 (MQ=14) gagaGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg < 1:4202510/150‑1 (MQ=255) agagTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATgg < 1:1612297/150‑1 (MQ=255) agagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCACTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCAAgg > 2:3683851/1‑150 (MQ=255) 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tCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggtg < 2:4200796/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggtg < 1:4710835/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTA‑GAACCTTGGTGGTAGCTTATCATACTTACCCGCATGGGCAGAATATTTAATTTCGGTTTCGTTGGGTATTTAAGGGTCTTTTTTAATTGAtggtggtg > 2:164703/1‑150 (MQ=14) cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggtgg < 1:1031928/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTCGGGTCGGTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggtgg < 1:2050054/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAACGCTCTAAACCAGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGGCGAAGCTTATAATACTTCCCCCCATGGGCCGAATATTTAAATGCGGATTGGTTGGGGACTTCAGGGGCTTTTGTAAGGTGTGGGGGTggg > 2:1217895/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTC‑GAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:5462041/150‑1 (MQ=255) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGc < 2:3090762/79‑1 (MQ=39) cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCC‑GAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 1:2419088/106‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAc < 1:5188064/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 1:732540/150‑1 (MQ=255) gggggCATCGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:3019451/147‑1 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGa < 2:3322191/150‑1 (MQ=255) aggCAAAGCTCTGTCGCTGGAGCTCTAGAC‑TTTCCTATGACGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGa < 1:1750537/149‑1 (MQ=17) ggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAtt > 2:3125586/1‑88 (MQ=18) ggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAtt < 1:3125586/88‑1 (MQ=18) ggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc > 2:2102461/1‑147 (MQ=255) 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1:1306194/1‑150 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtgg > 2:4244276/1‑120 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 1:1493248/150‑1 (MQ=255) ctctctCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTtct < 2:1448425/42‑1 (MQ=38) ctctctCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat < 1:3911929/66‑1 (MQ=40) ctctctCGCTGGCGCTCGAGGC‑GAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATg < 2:4331247/150‑1 (MQ=255) tctctcGCTGTCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 1:3480872/150‑1 (MQ=255) ctctcGCTGTCGCTCGAGCC‑GAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:1396997/150‑1 (MQ=255) ctcGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:624041/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACGTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAg > 1:3504917/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGCTCAAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAg < 1:3042814/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAt < 2:1968425/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAt > 2:5034880/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAt < 2:3633407/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAACTTCGAAGTAGATGACGGCAGAt > 1:3993787/1‑150 (MQ=255) | CTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTC‑GAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAT > CP009273/1282450‑1282746 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |