Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 235,010 | 0 | G | T | 11.0% | 415.7 / 3.4 | 170 | L72I (CTT→ATT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (76/65); new base T (5/23); total (82/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |