Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,385,578 | A→T | 6.7% | intergenic (‑191/+239) | tldD ← / ← yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,385,578 | 0 | A | T | 6.7% | 942.0 / 3.8 | 335 | intergenic (‑191/+239) | tldD/yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (193/96); new base T (6/18); total (199/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.50e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
CGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACG > CP009273/3385430‑3385727 | cGGCTGCCGGTTGCGGCGTGAACGCCATAGCCAGCCTACGGTTATGTTCGGTTTTGTCGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAg < 1:5423759/150‑1 (MQ=14) cGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGGTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGACGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCGGTGTGTAg > 1:2792486/1‑150 (MQ=14) ggCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAgg > 2:4052341/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGcc > 1:3243389/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTGGCGGCGTGAACGCCCTAGCCAGCCTAGGGTTATGTTCCGGTTTGTTGGCCTGATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCt < 1:4527812/150‑1 (MQ=17) tGCCGGATGCGGCGTGACCGCCCAACCCAGCCTACGGTTATGTTCCGTTTTTTCGGCCTTATACGACGCACCGCGTCCCAACCGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCt < 1:2667212/150‑1 (MQ=14) gcggtttGCGGCGTTAACGCCCTACCCCGCCTAGGGTTAGGTTCGGGTTTGTCGGCCTTATACGCCGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTg < 1:1342241/144‑1 (MQ=14) ccGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGa > 2:3279481/1‑150 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCCTATCCCGCCTACGGTTATGTTCAGGGTAGTAGGCCTGATAACACGAAAACCCACGAATCACCAACCGTCACACGAATCCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTGTAGGCCTGaga > 1:5275151/1‑148 (MQ=9) ggATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATa > 1:3119309/1‑150 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATaa < 2:5030156/150‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCCTAGCCAGCCTACGGTTATGTACCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTCTCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATaa < 2:2268311/150‑1 (MQ=255) agggggcgTGAACGCCCTACCCCGCCTAGGGTTTTGTTCGGGTTGGTTGGCCTTATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAg < 2:2322278/146‑1 (MQ=14) gcggggTTAACGCCCTATCCAGCCAAGGTTTTTGTTCGGGTTTGTCGGCCTTATAAGACGCACCGCGTCGACTCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGAc < 1:2164440/150‑1 (MQ=14) gcggcgTGAACGCCATAACCAGCCTAGGTTTATGTTCCGTTTTTTTGGCCTTATAATACCCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGAc < 1:1177276/150‑1 (MQ=14) gcgTGACCGCCCTATCCAGCCTACGGTTTTGTTCCGGTTTGTAGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGca < 1:3620643/150‑1 (MQ=255) gcgTGAACGCCCTACCCAGCCTACGTTTTTGTTCCGTTTTGTAGGCCTTAAAAGACGCACCGCGTCGCATCCGCCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGca < 1:855664/150‑1 (MQ=14) gTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGcaca > 2:3506434/1‑150 (MQ=255) tGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAg < 2:4137242/150‑1 (MQ=255) gAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGc > 2:4646035/1‑150 (MQ=255) gAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCAGTGTGTAGGCCAGATAAGAAGCACAGc > 1:2311265/1‑150 (MQ=14) aaCGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCg < 2:4005325/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCAACCCAGCCTACGGTTATGTTCCGTTTTGTAGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGCCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCg < 1:4084246/150‑1 (MQ=14) aCGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGt > 1:424322/1‑150 (MQ=255) cGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTc < 2:3916676/150‑1 (MQ=255) gCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTCTCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCg > 1:4441816/1‑150 (MQ=255) gCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCAGTATGTATGCCAGATAAGACGCACAgagacg > 1:4179763/1‑145 (MQ=14) cTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAt > 1:5430809/1‑150 (MQ=255) tATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATc > 2:3387500/1‑150 (MQ=255) ctCCAGCCTAGGGTTATGTTCGGGTTTGTAGGCCTGATAAGCCGCACAGCGTCGCAACAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa < 2:607147/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa > 2:2288349/1‑150 (MQ=255) tCCCGCCTACGTTTTTGTTCCGGTTTTTAGCCCTTAAAAGACCCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAg < 1:5144060/150‑1 (MQ=11) cccgCCTAGGTTTTTGTTCGGGTTTGTGGGCGTGATACGACGCCCCGCGTCGCATCCGGCCACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAgg < 1:5186991/147‑1 (MQ=11) ccAGCCTTGGTTTTTGTACCGTTTTTTAGGCCTTATAAGACCCACAGCGTCTAATCAGCCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAgg < 1:2415928/150‑1 (MQ=11) aGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCa < 1:3631569/150‑1 (MQ=38) cGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCt > 1:3742973/1‑150 (MQ=37) tttGTTCGGTTTTTTTGGCCTTATATGACGCACTGGGTCGCATATGGAAAGGGCTGTCGTAGGCGGCTTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTTTGTTCCGTTTGTTGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCg < 2:1367548/148‑1 (MQ=2) tATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCg > 2:823903/1‑150 (MQ=37) aTGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCgg > 2:3151167/1‑150 (MQ=37) gTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGAt > 2:1248576/1‑150 (MQ=37) ggTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggc > 1:709729/1‑150 (MQ=32) ggTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTGTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGACGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggc > 2:4607771/1‑150 (MQ=17) tGTAGGCCTTATAAGACCCACCGCGTCGAATCTGGCAAGGGCTGTGGGAGGCGGGGTAACCGCGTTACCCGACATCGGGTTTTGTCCCGTTTGTAGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTaa < 2:4783941/150‑1 (MQ=11) tcggCCTGAAACGCCGCCCAGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGTCGGTTGCGGCGTACCCGCCTTACCCGACCTAGGGTTTTGTTCGGTTTGTTGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAACAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAAc < 2:4994641/148‑1 (MQ=11) aGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTTAACg > 2:1122090/1‑150 (MQ=17) cTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt > 2:958033/1‑150 (MQ=35) aCGCCCCGCGTCGAATCAGGCAACGGCGGTCGTTTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGCCCTACGGTTTTGTTCCGTTTGTCGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGAcc < 2:2961747/150‑1 (MQ=11) gCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGACGCATCAGGCGACGGCTGACGGAAGCGGCGTAAAAGCCTTATCAGAcaaa > 2:1293698/1‑147 (MQ=11) cactGCGTCGATTCTGCCAACGGCTGTCGGATGCGGCTTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTTGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTAc < 2:4551634/150‑1 (MQ=11) actgCGTCGCATAAGGAAACGGCTGTCGGTGGGGGCGTAAACCCGTTAGCCGACCTAGGGTTATGTTCCTTTTGTTGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACg < 2:656630/147‑1 (MQ=11) acaGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTGATCCGACCTACg > 2:4899732/1‑150 (MQ=37) aGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGt > 1:1917710/1‑150 (MQ=37) gCGTCGCTACTGGCAAGGGCTGTGGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACATACGTTTTTTTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGtt < 2:368370/150‑1 (MQ=11) 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ccTTACCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTCGGCCTGATAAGACGCACCGCTGCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCa < 2:2061579/150‑1 (MQ=14) cTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAt > 1:598019/1‑150 (MQ=255) tATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa > 1:3852318/1‑150 (MQ=40) aTCCGCCCTAGGTTTATGTTCGGTTTGTAGGCCTGATATGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAg < 2:4311273/150‑1 (MQ=11) aTCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAg > 2:1748974/1‑150 (MQ=40) 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cTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACgg > 1:2474233/1‑150 (MQ=35) ggTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCTTCAGGCAACGGCTga > 1:1097335/1‑149 (MQ=255) ggTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGc > 1:1832766/1‑150 (MQ=35) tATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCgg > 2:3821138/1‑150 (MQ=35) tATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCgg > 1:4150444/1‑150 (MQ=35) 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tAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAAc > 1:4869963/1‑150 (MQ=34) aGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACg > 1:1259964/1‑150 (MQ=34) | CGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACG > CP009273/3385430‑3385727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |