| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,385,662 | 0 | C | G | 6.8% | 929.9 / 12.6 | 316 | intergenic (‑275/+155) | tldD/yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (191/96); new base G (2/22); total (196/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-08 | |||||||||||
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Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
ATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCG > CP009273/3385513‑3385811 | aTCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTcc > 1:1060180/1‑150 (MQ=38)aTCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTcc > 1:5234215/1‑150 (MQ=38)aTCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTcc > 1:2462918/1‑150 (MQ=38) tCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCg > 1:1631950/1‑150 (MQ=38) ctggCAACGGCTGTGGGTTGCGGCGTAACCGCCTTAACCGCCCTCGGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATACGACGCCCAGCTGCGCATCCGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGt < 2:4884542/148‑1 (MQ=14) aGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGtt > 2:4549779/1‑150 (MQ=40) aatgggCTGGCGTTTGCGGCTTAAACGCATTAGCCGACCTA‑GTTTTTTTTCCGTTTTTTTGGCCTTATAACCCCCACCGGGTCTAATCAGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGt < 1:4319497/146‑1 (MQ=9) accGGCTGTCGGATGCGGCTTAAACGCCTTATCCGACCTAGGGTTTTGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGTa < 2:379360/148‑1 (MQ=255) aaCGGCTGTCGGTTGCGGCTTAAACGCCTTATCCGACCTACGTTTTTGTTCGG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGTa < 2:3119309/150‑1 (MQ=14) aaCGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCGTATCCGACCTACGGGTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTGAT‑GTTCCGGTTGTa > 2:1074918/1‑150 (MQ=255) gggCTGTGGGTTGCGGCTTAACCGCTTTAGCGGACATAGGTTTTTGTTCGT‑TTTGTGGCCCTTATAACACCCCCCGCGTCGCATCAGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGTAgg < 1:2489784/149‑1 (MQ=9) gggCTGTCGGAGGGGGCGTAACCGCCGTATCCGACCTACGGTGTTGTGCCG‑TTTGTGGGCCTGATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTCCGGTTAT‑GTTCCGTTTGTAgg < 2:3958197/149‑1 (MQ=14) ggCTGGCGGTTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGTTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCCTCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTAT‑GTTCCGTTTGTAGGc < 2:332549/150‑1 (MQ=14) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |