| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,525,232 | T→A | 10.4% | L189F (TTA→TTT) | yhgE ← | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,525,232 | 0 | T | A | 10.4% | 908.9 / 10.5 | 282 | L189F (TTA→TTT) | yhgE | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/157); new base A (34/3); total (122/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATG > CP009273/3525085‑3525381 | cGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGATGATAACCGCCAGCGCGGTAAACAGACCTaaact > 2:4661218/1‑147 (MQ=255) gCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTga < 1:1837471/150‑1 (MQ=255) gggTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGat < 2:2398023/150‑1 (MQ=255) gggTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGat < 1:1968858/150‑1 (MQ=255) gttatgatAAACATCAGTGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCGCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataa < 2:5023382/147‑1 (MQ=255) gTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataa < 1:4406070/150‑1 (MQ=255) gTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataa < 2:677653/150‑1 (MQ=255) gatgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataaat < 2:3186945/150‑1 (MQ=255) tgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataaataa < 2:5523915/150‑1 (MQ=255) tgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataaataa < 2:609929/150‑1 (MQ=255) atAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAAACTGACAGGGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCGCCCGGTAACCAGACCGAAAGGGAGTtaaaaaaaa > 1:2173/1‑149 (MQ=255) atAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAAc < 2:4439348/150‑1 (MQ=255) atAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACCGGCCTGGGTTCGCGCCAGGCGCACCCCCCCCCCCGTAACCACACCAAACCGGAGATAAAAAAAc > 1:3792055/1‑150 (MQ=255) aaCATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAg < 2:2302643/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACCTGACAGGGTTCCCGCCAGGATCACCCCCCCCGCCGTAACCCCACCAAACCGGAGATAAAAAAAcccctcc > 1:679326/1‑145 (MQ=255) cAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTTTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCACACCAAAAGTGTGATTAATAAACCAGTC‑GGt > 2:4492058/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGGCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGt < 1:99385/150‑1 (MQ=255) gTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCa < 2:3539609/150‑1 (MQ=255) tAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCaaa < 2:3032760/150‑1 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAag < 2:2725590/150‑1 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCCGCGCGGTAACCAGACCTAACCGGAGATAAATAAACCAGTC‑GGGTGCAAAAAag > 1:2270334/1‑150 (MQ=255) tGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACCTTACTGTGTTCGCGCGAGGATAAACCCCCGCGCGGTAACCAGACCAAACGTGAGATAAAAAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAagat > 1:1370999/1‑149 (MQ=255) gATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACAGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCAGCGCGGTAACCAGACCAAAAGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTTCACAAAACAGc > 2:4167709/1‑150 (MQ=255) aTACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAATGTGAGATAAAAAAACCACTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCg > 2:1133301/1‑150 (MQ=255) aTACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACAGGGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCCGACCGAATGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCg > 2:3895684/1‑150 (MQ=255) tACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAAAGGGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCGCGCGGTAAACAGACCGAAAGGGAGATAAATAAAACACTCGGGTTCCaaaaaaatcgg > 1:3818021/1‑145 (MQ=255) aCTACCGGCAGCACCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTa < 1:479032/150‑1 (MQ=255) aCTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTa < 1:2955590/150‑1 (MQ=255) cTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTAt < 2:5326310/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTg < 1:5059469/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACCTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGCGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTg > 2:3504669/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGaa < 2:5003023/150‑1 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATACACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAc < 2:3265972/150‑1 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGTCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGGTAAATAAACCAGTC‑GGGTGCAAAAAAGAGCGGATTGaaaaaa > 2:947604/1‑149 (MQ=255) aaCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTg < 2:2957440/150‑1 (MQ=255) aaCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGGAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGTAAAACGTg > 2:1215942/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGcc < 1:2069235/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTACCGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaa < 1:899209/150‑1 (MQ=255) ggCTATAAACGTTAACAACTTTTGAATAGATTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGTATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaac < 1:4638365/150‑1 (MQ=255) ggCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACAGTGGTCGCGCGAGGATAACCCCCAGCGCGGTAAACAGACCTAACGGGAGATAAATAAAACACTC‑GGTTGCAAAAAAAAGCGTATTTTAAAAACTGTTGCcaac > 2:481395/1‑150 (MQ=255) gCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaaca > 2:1200999/1‑150 (MQ=255) cGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCcaacaa < 1:750843/150‑1 (MQ=255) ttAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCAGCGCGGTAAACAGACCAAACGGGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAAGTGATGCCAACAACtt > 2:872571/1‑150 (MQ=255) tAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGttt < 1:2510093/150‑1 (MQ=255) tAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGttt < 1:3554855/150‑1 (MQ=255) taCGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGGGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTATCCAGACCTTACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAATAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACATGTTTa < 2:1735825/149‑1 (MQ=255) aCGTGAACAACTTTTGATTAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTaa < 2:3691177/150‑1 (MQ=255) aCGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTaa < 1:2193358/150‑1 (MQ=255) tGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaaca < 1:4818458/150‑1 (MQ=255) tGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaaca < 2:4765652/150‑1 (MQ=255) tGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaaca < 2:4045679/150‑1 (MQ=255) gAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaacaa < 1:1172275/150‑1 (MQ=255) aacaacTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAACCTGAGATAAATAAAACAGTC‑GGTTTCAAAAAAGATCGTATTTAAAAAAGTGATGCCAACAAATTTAaaaaac > 1:421999/1‑150 (MQ=255) aacTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTTACAGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCACCGCGGTAACCAGACCAAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTTCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCCACAACTTTAAACAacaca > 2:2050531/1‑150 (MQ=255) tttaaTAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCca < 2:2432428/147‑1 (MQ=255) aaTAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGTGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAg < 2:4957293/150‑1 (MQ=255) gagTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaaa < 2:188487/150‑1 (MQ=255) gATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCAc > 1:1264856/1‑150 (MQ=255) ttAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCa < 2:3136579/150‑1 (MQ=255) ggttagtgtgTTCGGGCTTGTATAACCGCCTGGGCGTTAACAAGACATAACGTTATATAAATAAACCAGTG‑GTTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAAAAATTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc < 1:3711123/144‑1 (MQ=255) ggttagtgtgTTCGCGCGAGTATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACATAACTTGAGATAAATAAACCCGTC‑GTTTGAAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc < 1:4624173/144‑1 (MQ=255) cGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc < 1:298275/150‑1 (MQ=255) gTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACg > 2:2460794/1‑150 (MQ=255) gtgtgtgTTCGCGCGAGGATCCCCGCCAGCGCGGAAACCAGACCAAAGGTGAGATAAATAAACCCGGG‑GGTTGAAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAATTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTc < 1:4189452/147‑1 (MQ=255) aCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCTGCGCGGAAACCAGACCAAACGTGATATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCa < 1:5149219/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCaa > 1:4246757/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAg > 2:5105629/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAg > 2:2834658/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGcc < 1:1610059/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGcc < 1:5022799/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCAtt < 2:1466629/150‑1 (MQ=255) gAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgag < 1:650447/150‑1 (MQ=255) gAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgag < 2:1355146/150‑1 (MQ=255) gAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgag > 1:3926750/1‑150 (MQ=255) ggATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaa > 1:1798232/1‑150 (MQ=255) gATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgagaca > 2:4111360/1‑148 (MQ=255) gATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaa > 2:4521193/1‑150 (MQ=255) aTCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCCTTGGCGAGaaaa > 1:1985969/1‑150 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAAt > 1:1875500/1‑150 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGTAACCAGACATAACGTGATATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAAt < 1:2227537/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCGCGTTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATc < 1:3199474/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCa < 2:5237200/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAc > 1:592656/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAcc < 1:4132526/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAcc < 1:3097589/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAcc < 1:2743099/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGTAACCAGACATAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCAcc < 1:3097618/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCa > 1:2641317/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATTCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:1337454/1‑150 (MQ=255) gcgGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACACCTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAat < 2:1305811/150‑1 (MQ=255) gTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGGAAtata > 2:1521765/1‑150 (MQ=255) tAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATaa < 1:1200999/150‑1 (MQ=255) tAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATaa > 1:3483254/1‑150 (MQ=255) aaCCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAg > 2:3400108/1‑150 (MQ=255) aaCCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAg > 1:1055054/1‑150 (MQ=255) aCCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGt > 1:2376815/1‑150 (MQ=255) cAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTAc > 1:1523417/1‑150 (MQ=255) cAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTAc < 1:1351439/150‑1 (MQ=255) aGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACg < 2:4225980/150‑1 (MQ=255) tAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATg < 2:2157479/150‑1 (MQ=255) | AAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTC‑GGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAGTAATATAAGTACGTTATG > CP009273/3525085‑3525381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |